RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
CLN8-208ENST00000635751 GLI2P10070 1586 aa30.03■■■□□ 2.4
CLN8-208ENST00000635751 PLCH2O75038 1416 aa30.03■■■□□ 2.4
CLN8-208ENST00000635751 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.03■■■□□ 2.4
CLN8-208ENST00000635751 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.02■■■□□ 2.4
CLN8-208ENST00000635751 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
CLN8-208ENST00000635751 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.02■■■□□ 2.4
CLN8-208ENST00000635751 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
CLN8-208ENST00000635751 CD109Q6YHK3 1445 aa29.99■■■□□ 2.39
CLN8-208ENST00000635751 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.98■■■□□ 2.39
CLN8-208ENST00000635751 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
CLN8-208ENST00000635751 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.95■■■□□ 2.39
CLN8-208ENST00000635751 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.95■■■□□ 2.38
CLN8-208ENST00000635751 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.94■■■□□ 2.38
CLN8-208ENST00000635751 TSPOAP1O95153 1857 aa29.94■■■□□ 2.38
CLN8-208ENST00000635751 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.94■■■□□ 2.38
CLN8-208ENST00000635751 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.93■■■□□ 2.38
CLN8-208ENST00000635751 ITGAEP38570 1179 aa29.91■■■□□ 2.38
CLN8-208ENST00000635751 FANCAO15360 1455 aa29.89■■■□□ 2.38
CLN8-208ENST00000635751 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
CLN8-208ENST00000635751 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.83■■■□□ 2.376e-8■□□□□ 11
CLN8-208ENST00000635751 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
CLN8-208ENST00000635751 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.82■■■□□ 2.36
CLN8-208ENST00000635751 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
CLN8-208ENST00000635751 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.81■■■□□ 2.36
CLN8-208ENST00000635751 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
CLN8-208ENST00000635751 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.8■■■□□ 2.36
CLN8-208ENST00000635751 AKNAQ7Z591 1439 aa29.79■■■□□ 2.36
CLN8-208ENST00000635751 ABCC1P33527 1531 aa29.79■■■□□ 2.36
CLN8-208ENST00000635751 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.78■■■□□ 2.36
CLN8-208ENST00000635751 DAPK1P53355 1430 aa29.77■■■□□ 2.36
CLN8-208ENST00000635751 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.77■■■□□ 2.36
CLN8-208ENST00000635751 MBD5Q9P267 1494 aa29.77■■■□□ 2.36
CLN8-208ENST00000635751 PTPRKQ15262 1439 aa29.77■■■□□ 2.36
CLN8-208ENST00000635751 ABCC5O15440 1437 aa29.76■■■□□ 2.35
CLN8-208ENST00000635751 ADGRL1O94910 1474 aa29.75■■■□□ 2.35
CLN8-208ENST00000635751 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.75■■■□□ 2.35
CLN8-208ENST00000635751 NEO1Q92859 1461 aa29.75■■■□□ 2.35
CLN8-208ENST00000635751 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.74■■■□□ 2.35
CLN8-208ENST00000635751 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.72■■■□□ 2.35
CLN8-208ENST00000635751 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.71■■■□□ 2.35
CLN8-208ENST00000635751 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.71■■■□□ 2.35
CLN8-208ENST00000635751 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.7■■■□□ 2.34
CLN8-208ENST00000635751 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.69■■■□□ 2.34
CLN8-208ENST00000635751 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.69■■■□□ 2.34
CLN8-208ENST00000635751 TSPY4P0CV99 314 aa29.65■■■□□ 2.34
CLN8-208ENST00000635751 TSPY10P0CW01 314 aa29.65■■■□□ 2.34
CLN8-208ENST00000635751 AFAP1Q8N556 730 aa29.64■■■□□ 2.34
CLN8-208ENST00000635751 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.63■■■□□ 2.33
CLN8-208ENST00000635751 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.61■■■□□ 2.33
CLN8-208ENST00000635751 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.61■■■□□ 2.33
CLN8-208ENST00000635751 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.58■■■□□ 2.33
CLN8-208ENST00000635751 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
CLN8-208ENST00000635751 RICTORQ6R327 1708 aa29.57■■■□□ 2.32
CLN8-208ENST00000635751 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.57■■■□□ 2.32
CLN8-208ENST00000635751 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.57■■■□□ 2.32
CLN8-208ENST00000635751 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.57■■■□□ 2.32
CLN8-208ENST00000635751 RAPGEF3O95398 923 aa29.56■■■□□ 2.32
CLN8-208ENST00000635751 ROCK1Q13464 1354 aa29.55■■■□□ 2.32
CLN8-208ENST00000635751 ADGRL2O95490 1459 aa29.54■■■□□ 2.32
CLN8-208ENST00000635751 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
CLN8-208ENST00000635751 NCOA1Q15788 1441 aa29.54■■■□□ 2.32
CLN8-208ENST00000635751 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.52■■■□□ 2.32
CLN8-208ENST00000635751 KDM5CP41229 1560 aa29.51■■■□□ 2.31
CLN8-208ENST00000635751 HFM1A2PYH4 1435 aa29.51■■■□□ 2.31
CLN8-208ENST00000635751 NAIPQ13075 1403 aa29.5■■■□□ 2.31
CLN8-208ENST00000635751 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.5■■■□□ 2.31
CLN8-208ENST00000635751 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.49■■■□□ 2.31
CLN8-208ENST00000635751 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.49■■■□□ 2.31
CLN8-208ENST00000635751 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.49■■■□□ 2.31
CLN8-208ENST00000635751 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
CLN8-208ENST00000635751 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
CLN8-208ENST00000635751 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.48■■■□□ 2.31
CLN8-208ENST00000635751 ATP7AQ04656 1500 aa29.47■■■□□ 2.31
CLN8-208ENST00000635751 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.47■■■□□ 2.31
CLN8-208ENST00000635751 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.47■■■□□ 2.31
CLN8-208ENST00000635751 PLXNC1O60486 1568 aa29.45■■■□□ 2.31
CLN8-208ENST00000635751 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.44■■■□□ 2.3
CLN8-208ENST00000635751 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.44■■■□□ 2.3
CLN8-208ENST00000635751 KIF15Q9NS87 1388 aa29.43■■■□□ 2.3
CLN8-208ENST00000635751 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.42■■■□□ 2.3
CLN8-208ENST00000635751 KDM6BO15054 1643 aa29.41■■■□□ 2.3
CLN8-208ENST00000635751 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.37■■■□□ 2.29
CLN8-208ENST00000635751 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.34■■■□□ 2.29
CLN8-208ENST00000635751 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.34■■■□□ 2.29
CLN8-208ENST00000635751 ABCA6Q8N139 1617 aa29.34■■■□□ 2.29
CLN8-208ENST00000635751 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.31■■■□□ 2.28
CLN8-208ENST00000635751 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.3■■■□□ 2.28
CLN8-208ENST00000635751 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.29■■■□□ 2.28
CLN8-208ENST00000635751 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
CLN8-208ENST00000635751 ERBINQ96RT1 1412 aa29.25■■■□□ 2.27
CLN8-208ENST00000635751 A2MP01023 1474 aa29.25■■■□□ 2.27
CLN8-208ENST00000635751 TRIM52Q96A61 297 aa29.21■■■□□ 2.27
CLN8-208ENST00000635751 ATP10AO60312 1499 aa29.19■■■□□ 2.26
CLN8-208ENST00000635751 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.18■■■□□ 2.26
CLN8-208ENST00000635751 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
CLN8-208ENST00000635751 KIF3BO15066 747 aa29.15■■■□□ 2.26
CLN8-208ENST00000635751 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.25
CLN8-208ENST00000635751 UNC13BO14795 1591 aa29.13■■■□□ 2.25
CLN8-208ENST00000635751 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms