RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630951.1

RAB28-208, Transcript of RAB28, member RAS oncogene family, human

TSL 5 BASIC

Gene RAB28, Length 1,679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB28-208	ENST00000630951	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		34.14	■■■■□ 3.06
RAB28-208	ENST00000630951	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		34.13	■■■■□ 3.05
RAB28-208	ENST00000630951	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		34.1	■■■■□ 3.05
RAB28-208	ENST00000630951	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		34.09	■■■■□ 3.05
RAB28-208	ENST00000630951	PREX2	Q70Z35	1606 aa		34.09	■■■■□ 3.05
RAB28-208	ENST00000630951	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		34.08	■■■■□ 3.05
RAB28-208	ENST00000630951	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		34.08	■■■■□ 3.05
RAB28-208	ENST00000630951	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		34.03	■■■■□ 3.04
RAB28-208	ENST00000630951	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		34.02	■■■■□ 3.04
RAB28-208	ENST00000630951	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		34.02	■■■■□ 3.04
RAB28-208	ENST00000630951	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		34.02	■■■■□ 3.04
RAB28-208	ENST00000630951	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	34.01	■■■■□ 3.03
RAB28-208	ENST00000630951	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		34	■■■■□ 3.03
RAB28-208	ENST00000630951	AFAP1	Q8N556	730 aa		33.98	■■■■□ 3.03
RAB28-208	ENST00000630951	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	33.98	■■■■□ 3.03
RAB28-208	ENST00000630951	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		33.97	■■■■□ 3.03
RAB28-208	ENST00000630951	ABCC1	P33527	1531 aa		33.95	■■■■□ 3.03
RAB28-208	ENST00000630951	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		33.95	■■■■□ 3.03
RAB28-208	ENST00000630951	KDM5C	P41229	1560 aa		33.95	■■■■□ 3.02
RAB28-208	ENST00000630951	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.92	■■■■□ 3.02
RAB28-208	ENST00000630951	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	33.92	■■■■□ 3.02
RAB28-208	ENST00000630951	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		33.9	■■■■□ 3.02
RAB28-208	ENST00000630951	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	33.9	■■■■□ 3.02
RAB28-208	ENST00000630951	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		33.89	■■■■□ 3.02
RAB28-208	ENST00000630951	ATP10A	O60312	1499 aa		33.89	■■■■□ 3.02
RAB28-208	ENST00000630951	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		33.88	■■■■□ 3.01
RAB28-208	ENST00000630951	TIAM1	Q13009	1591 aa		33.88	■■■■□ 3.01
RAB28-208	ENST00000630951	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.86	■■■■□ 3.01
RAB28-208	ENST00000630951	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		33.86	■■■■□ 3.01
RAB28-208	ENST00000630951	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		33.85	■■■■□ 3.01
RAB28-208	ENST00000630951	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		33.84	■■■■□ 3.01
RAB28-208	ENST00000630951	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		33.84	■■■■□ 3.01
RAB28-208	ENST00000630951	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		33.84	■■■■□ 3.01
RAB28-208	ENST00000630951	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		33.83	■■■■□ 3.01
RAB28-208	ENST00000630951	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		33.83	■■■■□ 3.01
RAB28-208	ENST00000630951	MAP3K1	Q13233	1512 aa		33.81	■■■■□ 3
RAB28-208	ENST00000630951	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		33.79	■■■■□ 3
RAB28-208	ENST00000630951	PTPRM	P28827	1452 aa		33.78	■■■■□ 3
RAB28-208	ENST00000630951	NCOA2	Q15596	1464 aa		33.78	■■■■□ 3
RAB28-208	ENST00000630951	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		33.78	■■■■□ 3
RAB28-208	ENST00000630951	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	33.78	■■■■□ 3
RAB28-208	ENST00000630951	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	33.77	■■■■□ 3	2e-6	■■■■□ 25.1
RAB28-208	ENST00000630951	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		33.77	■■■■□ 3
RAB28-208	ENST00000630951	MADD	Q8WXG6	1647 aa		33.75	■■■□□ 2.99
RAB28-208	ENST00000630951	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.74	■■■□□ 2.99
RAB28-208	ENST00000630951	RERE	Q9P2R6	1566 aa		33.71	■■■□□ 2.99
RAB28-208	ENST00000630951	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	33.7	■■■□□ 2.99
RAB28-208	ENST00000630951	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33.7	■■■□□ 2.98
RAB28-208	ENST00000630951	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	33.69	■■■□□ 2.98
RAB28-208	ENST00000630951	MLEC	Q14165	292 aa		33.69	■■■□□ 2.98
RAB28-208	ENST00000630951	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		33.69	■■■□□ 2.98
RAB28-208	ENST00000630951	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	33.68	■■■□□ 2.98
RAB28-208	ENST00000630951	APLP2	Q06481	763 aa		33.64	■■■□□ 2.98
RAB28-208	ENST00000630951	MBD5	Q9P267	1494 aa		33.64	■■■□□ 2.98
RAB28-208	ENST00000630951	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	33.63	■■■□□ 2.97
RAB28-208	ENST00000630951	AGL	P35573	1532 aa		33.62	■■■□□ 2.97
RAB28-208	ENST00000630951	ATP7A	Q04656	1500 aa		33.59	■■■□□ 2.97
RAB28-208	ENST00000630951	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		33.57	■■■□□ 2.96
RAB28-208	ENST00000630951	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	33.56	■■■□□ 2.96
RAB28-208	ENST00000630951	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		33.56	■■■□□ 2.96
RAB28-208	ENST00000630951	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		33.56	■■■□□ 2.96
RAB28-208	ENST00000630951	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		33.52	■■■□□ 2.96
RAB28-208	ENST00000630951	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		33.49	■■■□□ 2.95
RAB28-208	ENST00000630951	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		33.49	■■■□□ 2.95
RAB28-208	ENST00000630951	MIA2	Q96PC5	1412 aa		33.48	■■■□□ 2.95
RAB28-208	ENST00000630951	A2M	P01023	1474 aa		33.46	■■■□□ 2.95
RAB28-208	ENST00000630951	PLXNC1	O60486	1568 aa		33.44	■■■□□ 2.94
RAB28-208	ENST00000630951	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		33.44	■■■□□ 2.94
RAB28-208	ENST00000630951	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		33.44	■■■□□ 2.94
RAB28-208	ENST00000630951	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	33.42	■■■□□ 2.94
RAB28-208	ENST00000630951	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		33.4	■■■□□ 2.94
RAB28-208	ENST00000630951	TSPY4	P0CV99	314 aa		33.4	■■■□□ 2.94
RAB28-208	ENST00000630951	TSPY10	P0CW01	314 aa		33.4	■■■□□ 2.94
RAB28-208	ENST00000630951	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		33.37	■■■□□ 2.93
RAB28-208	ENST00000630951	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		33.37	■■■□□ 2.93
RAB28-208	ENST00000630951	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	33.36	■■■□□ 2.93
RAB28-208	ENST00000630951	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	33.35	■■■□□ 2.93
RAB28-208	ENST00000630951	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		33.29	■■■□□ 2.92
RAB28-208	ENST00000630951	GGT6	Q6P531	493 aa		33.28	■■■□□ 2.92
RAB28-208	ENST00000630951	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		33.26	■■■□□ 2.91
RAB28-208	ENST00000630951	C3	P01024	1663 aa		33.25	■■■□□ 2.91
RAB28-208	ENST00000630951	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		33.25	■■■□□ 2.91
RAB28-208	ENST00000630951	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		33.24	■■■□□ 2.91
RAB28-208	ENST00000630951	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	33.23	■■■□□ 2.91
RAB28-208	ENST00000630951	MROH2A	A6NES4	1674 aa		33.22	■■■□□ 2.91
RAB28-208	ENST00000630951	ZMYM3	Q14202	1370 aa		33.22	■■■□□ 2.91
RAB28-208	ENST00000630951	KIF3B	O15066	747 aa		33.2	■■■□□ 2.91
RAB28-208	ENST00000630951	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		33.2	■■■□□ 2.91
RAB28-208	ENST00000630951	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	33.2	■■■□□ 2.9
RAB28-208	ENST00000630951	HSPA2	P54652	639 aa		33.19	■■■□□ 2.9
RAB28-208	ENST00000630951	ABCC5	O15440	1437 aa		33.16	■■■□□ 2.9
RAB28-208	ENST00000630951	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		33.15	■■■□□ 2.9
RAB28-208	ENST00000630951	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
RAB28-208	ENST00000630951	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		33.14	■■■□□ 2.9
RAB28-208	ENST00000630951	NPAT	Q14207	1427 aa		33.14	■■■□□ 2.9
RAB28-208	ENST00000630951	DAPK1	P53355	1430 aa		33.11	■■■□□ 2.89
RAB28-208	ENST00000630951	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
RAB28-208	ENST00000630951	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		33.09	■■■□□ 2.89
RAB28-208	ENST00000630951	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		33.07	■■■□□ 2.89
RAB28-208	ENST00000630951	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		33.05	■■■□□ 2.88

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