RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 MYO5CQ9NQX4 1742 aa37.41■■■■□ 3.58
CAPNS1-215ENST00000628018 PTPRKQ15262 1439 aa37.4■■■■□ 3.58
CAPNS1-215ENST00000628018 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP37.35■■■■□ 3.57
CAPNS1-215ENST00000628018 ABCA9Q8IUA7 1624 aa37.34■■■■□ 3.57
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP37.33■■■■□ 3.57
CAPNS1-215ENST00000628018 PLCH2O75038 1416 aa37.33■■■■□ 3.57
CAPNS1-215ENST00000628018 MAPKBP1O60336 1514 aa37.33■■■■□ 3.57
CAPNS1-215ENST00000628018 DAPK1P53355 1430 aa37.31■■■■□ 3.56
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGAP5Q13017 1502 aa37.3■■■■□ 3.56
CAPNS1-215ENST00000628018 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa37.29■■■■□ 3.56
CAPNS1-215ENST00000628018 ABCC5O15440 1437 aa37.28■■■■□ 3.56
CAPNS1-215ENST00000628018 ARAP3Q8WWN8 1544 aa37.27■■■■□ 3.56
CAPNS1-215ENST00000628018 SETD5Q9C0A6 1442 aa37.25■■■■□ 3.55
CAPNS1-215ENST00000628018 HFM1A2PYH4 1435 aa37.19■■■■□ 3.54
CAPNS1-215ENST00000628018 CROCC2H7BZ55 1655 aa37.19■■■■□ 3.54
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGEF5Q12774 1597 aa37.18■■■■□ 3.54
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa37.17■■■■□ 3.54
CAPNS1-215ENST00000628018 AKNAQ7Z591 1439 aa37.17■■■■□ 3.54
CAPNS1-215ENST00000628018 MBD5Q9P267 1494 aa37.17■■■■□ 3.54
CAPNS1-215ENST00000628018 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa37.16■■■■□ 3.54
CAPNS1-215ENST00000628018 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa37.15■■■■□ 3.54
CAPNS1-215ENST00000628018 CHIC2Q9UKJ5 165 aa37.15■■■■□ 3.54
CAPNS1-215ENST00000628018 ROCK1Q13464 1354 aa37.14■■■■□ 3.54
CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa37.13■■■■□ 3.54
CAPNS1-215ENST00000628018 NAIPQ13075 1403 aa37.13■■■■□ 3.53
CAPNS1-215ENST00000628018 HRCP23327 699 aa37.12■■■■□ 3.53
CAPNS1-215ENST00000628018 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP37.11■■■■□ 3.53
CAPNS1-215ENST00000628018 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP37.1■■■■□ 3.53
CAPNS1-215ENST00000628018 SYCP2Q9BX26 1530 aa37.1■■■■□ 3.53
CAPNS1-215ENST00000628018 SHANK2Q9UPX8 1470 aa37.1■■■■□ 3.53
CAPNS1-215ENST00000628018 GCC2Q8IWJ2 1684 aa37.09■■■■□ 3.53
CAPNS1-215ENST00000628018 RSPH4AQ5TD94 716 aa37.08■■■■□ 3.53
CAPNS1-215ENST00000628018 ADGBQ8N7X0 1667 aa37.07■■■■□ 3.52
CAPNS1-215ENST00000628018 ABCC1P33527 1531 aa37.07■■■■□ 3.52
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC141Q6ZP82 1450 aa37.07■■■■□ 3.52
CAPNS1-215ENST00000628018 FANCAO15360 1455 aa37.05■■■■□ 3.52
CAPNS1-215ENST00000628018 ADGRL2O95490 1459 aa37.05■■■■□ 3.52
CAPNS1-215ENST00000628018 CD109Q6YHK3 1445 aa37.04■■■■□ 3.52
CAPNS1-215ENST00000628018 GLI2P10070 1586 aa37.04■■■■□ 3.52
CAPNS1-215ENST00000628018 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa37.04■■■■□ 3.52
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa37.03■■■■□ 3.52
CAPNS1-215ENST00000628018 C9orf84Q5VXU9 1444 aa37■■■■□ 3.51
CAPNS1-215ENST00000628018 NCOA1Q15788 1441 aa36.99■■■■□ 3.51
CAPNS1-215ENST00000628018 TSPY4P0CV99 314 aa36.98■■■■□ 3.51
CAPNS1-215ENST00000628018 TSPY10P0CW01 314 aa36.98■■■■□ 3.51
CAPNS1-215ENST00000628018 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.97■■■■□ 3.51
CAPNS1-215ENST00000628018 DIP2BQ9P265 1576 aa36.97■■■■□ 3.51
CAPNS1-215ENST00000628018 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP36.96■■■■□ 3.51
CAPNS1-215ENST00000628018 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.95■■■■□ 3.51
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.94■■■■□ 3.5
CAPNS1-215ENST00000628018 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.94■■■■□ 3.5
CAPNS1-215ENST00000628018 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP36.9■■■■□ 3.5
CAPNS1-215ENST00000628018 KDM6BO15054 1643 aa36.89■■■■□ 3.5
CAPNS1-215ENST00000628018 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.89■■■■□ 3.5
CAPNS1-215ENST00000628018 ADGRL1O94910 1474 aa36.89■■■■□ 3.5
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.85■■■■□ 3.49
CAPNS1-215ENST00000628018 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.83■■■■□ 3.49
CAPNS1-215ENST00000628018 NEO1Q92859 1461 aa36.83■■■■□ 3.49
CAPNS1-215ENST00000628018 PLXNC1O60486 1568 aa36.79■■■■□ 3.48
CAPNS1-215ENST00000628018 CLSPNQ9HAW4 1339 aa36.79■■■■□ 3.48
CAPNS1-215ENST00000628018 KIF15Q9NS87 1388 aa36.77■■■■□ 3.48
CAPNS1-215ENST00000628018 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP36.77■■■■□ 3.48
CAPNS1-215ENST00000628018 AFAP1Q8N556 730 aa36.75■■■■□ 3.47
CAPNS1-215ENST00000628018 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.75■■■■□ 3.47
CAPNS1-215ENST00000628018 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.74■■■■□ 3.47
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.74■■■■□ 3.47
CAPNS1-215ENST00000628018 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.7■■■■□ 3.47
CAPNS1-215ENST00000628018 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.47
CAPNS1-215ENST00000628018 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.68■■■■□ 3.46
CAPNS1-215ENST00000628018 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP36.68■■■■□ 3.46
CAPNS1-215ENST00000628018 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.66■■■■□ 3.46
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP7AQ04656 1500 aa36.64■■■■□ 3.46
CAPNS1-215ENST00000628018 KDM5CP41229 1560 aa36.63■■■■□ 3.45
CAPNS1-215ENST00000628018 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.63■■■■□ 3.45
CAPNS1-215ENST00000628018 TSPOAP1O95153 1857 aa36.62■■■■□ 3.45
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM52Q96A61 297 aa36.62■■■■□ 3.45
CAPNS1-215ENST00000628018 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.62■■■■□ 3.45
CAPNS1-215ENST00000628018 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.6■■■■□ 3.45
CAPNS1-215ENST00000628018 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36.56■■■■□ 3.44
CAPNS1-215ENST00000628018 ERBINQ96RT1 1412 aa36.54■■■■□ 3.44
CAPNS1-215ENST00000628018 RICTORQ6R327 1708 aa36.53■■■■□ 3.44
CAPNS1-215ENST00000628018 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.53■■■■□ 3.44
CAPNS1-215ENST00000628018 MPHOSPH9Q99550 1183 aa36.51■■■■□ 3.44
CAPNS1-215ENST00000628018 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.5■■■■□ 3.43
CAPNS1-215ENST00000628018 PZPP20742 1482 aa36.49■■■■□ 3.43
CAPNS1-215ENST00000628018 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.49■■■■□ 3.43
CAPNS1-215ENST00000628018 RAPGEF3O95398 923 aa36.48■■■■□ 3.43
CAPNS1-215ENST00000628018 UNC13BO14795 1591 aa36.45■■■■□ 3.43
CAPNS1-215ENST00000628018 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.45■■■■□ 3.43
CAPNS1-215ENST00000628018 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.45■■■■□ 3.43
CAPNS1-215ENST00000628018 NUP155O75694 1391 aa36.41■■■■□ 3.42
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
CAPNS1-215ENST00000628018 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
CAPNS1-215ENST00000628018 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.37■■■■□ 3.41
CAPNS1-215ENST00000628018 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.37■■■■□ 3.41
CAPNS1-215ENST00000628018 ABCA6Q8N139 1617 aa36.36■■■■□ 3.41
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.36■■■■□ 3.41
CAPNS1-215ENST00000628018 A2MP01023 1474 aa36.33■■■■□ 3.41
CAPNS1-215ENST00000628018 SIN3AQ96ST3 1273 aa36.32■■■■□ 3.4
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