RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, human

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA3B-215	ENST00000621029	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		46.49	■■■■■ 5.03
SEMA3B-215	ENST00000621029	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		46.44	■■■■■ 5.02
SEMA3B-215	ENST00000621029	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		46.42	■■■■■ 5.02
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		46.39	■■■■■ 5.02
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		46.37	■■■■■ 5.01
SEMA3B-215	ENST00000621029	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		46.35	■■■■■ 5.01
SEMA3B-215	ENST00000621029	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		46.35	■■■■■ 5.01
SEMA3B-215	ENST00000621029	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		46.31	■■■■■ 5
SEMA3B-215	ENST00000621029	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		46.31	■■■■■ 5
SEMA3B-215	ENST00000621029	PREX2	Q70Z35	1606 aa		46.28	■■■■■ 5
SEMA3B-215	ENST00000621029	AFAP1	Q8N556	730 aa		46.28	■■■■■ 5
SEMA3B-215	ENST00000621029	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		46.28	■■■■■ 5
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		46.26	■■■■■ 5
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	46.25	■■■■■ 4.99
SEMA3B-215	ENST00000621029	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		46.2	■■■■■ 4.99
SEMA3B-215	ENST00000621029	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		46.2	■■■■■ 4.99
SEMA3B-215	ENST00000621029	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		46.17	■■■■■ 4.98
SEMA3B-215	ENST00000621029	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		46.16	■■■■■ 4.98
SEMA3B-215	ENST00000621029	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	46.14	■■■■■ 4.98
SEMA3B-215	ENST00000621029	ATP10A	O60312	1499 aa		46.14	■■■■■ 4.98
SEMA3B-215	ENST00000621029	MLEC	Q14165	292 aa		46.14	■■■■■ 4.98
SEMA3B-215	ENST00000621029	PTPRM	P28827	1452 aa		46.12	■■■■■ 4.97
SEMA3B-215	ENST00000621029	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	46.12	■■■■■ 4.97
SEMA3B-215	ENST00000621029	ABCC1	P33527	1531 aa		46.12	■■■■■ 4.97
SEMA3B-215	ENST00000621029	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		46.1	■■■■■ 4.97
SEMA3B-215	ENST00000621029	MADD	Q8WXG6	1647 aa		46.1	■■■■■ 4.97
SEMA3B-215	ENST00000621029	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		46.09	■■■■■ 4.97
SEMA3B-215	ENST00000621029	KDM5C	P41229	1560 aa		46.09	■■■■■ 4.97
SEMA3B-215	ENST00000621029	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		46.08	■■■■■ 4.97
SEMA3B-215	ENST00000621029	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		46.06	■■■■■ 4.96
SEMA3B-215	ENST00000621029	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		46.03	■■■■■ 4.96
SEMA3B-215	ENST00000621029	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		46.02	■■■■■ 4.96
SEMA3B-215	ENST00000621029	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		46.02	■■■■■ 4.96
SEMA3B-215	ENST00000621029	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		46.01	■■■■■ 4.96
SEMA3B-215	ENST00000621029	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	45.99	■■■■■ 4.95
SEMA3B-215	ENST00000621029	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		45.99	■■■■■ 4.95
SEMA3B-215	ENST00000621029	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		45.99	■■■■■ 4.95
SEMA3B-215	ENST00000621029	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		45.98	■■■■■ 4.95
SEMA3B-215	ENST00000621029	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	45.95	■■■■■ 4.95
SEMA3B-215	ENST00000621029	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		45.93	■■■■■ 4.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		45.91	■■■■■ 4.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		45.91	■■■■■ 4.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	TIAM1	Q13009	1591 aa		45.88	■■■■■ 4.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	45.88	■■■■■ 4.94
SEMA3B-215	ENST00000621029	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		45.86	■■■■■ 4.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	ABCA6	Q8N139	1617 aa		45.85	■■■■■ 4.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	45.83	■■■■■ 4.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	NCOA2	Q15596	1464 aa		45.81	■■■■■ 4.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	45.79	■■■■■ 4.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		45.78	■■■■■ 4.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		45.77	■■■■■ 4.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	RERE	Q9P2R6	1566 aa		45.76	■■■■■ 4.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		45.73	■■■■■ 4.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	45.69	■■■■■ 4.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	APLP2	Q06481	763 aa		45.67	■■■■■ 4.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	ATP7A	Q04656	1500 aa		45.67	■■■■■ 4.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	45.66	■■■■■ 4.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	AGL	P35573	1532 aa		45.66	■■■■■ 4.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	45.63	■■■■■ 4.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	MAP3K1	Q13233	1512 aa		45.62	■■■■■ 4.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	MBD5	Q9P267	1494 aa		45.6	■■■■■ 4.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	45.58	■■■■■ 4.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		45.57	■■■■■ 4.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		45.56	■■■■■ 4.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	A2M	P01023	1474 aa		45.53	■■■■■ 4.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		45.49	■■■■■ 4.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	HSPA2	P54652	639 aa		45.48	■■■■■ 4.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		45.48	■■■■■ 4.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		45.44	■■■■■ 4.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	GGT6	Q6P531	493 aa		45.41	■■■■■ 4.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	TSPY4	P0CV99	314 aa		45.4	■■■■■ 4.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	TSPY10	P0CW01	314 aa		45.4	■■■■■ 4.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		45.4	■■■■■ 4.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	PLXNC1	O60486	1568 aa		45.38	■■■■■ 4.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		45.37	■■■■■ 4.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		45.37	■■■■■ 4.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	MIA2	Q96PC5	1412 aa		45.32	■■■■■ 4.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		45.31	■■■■■ 4.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	45.31	■■■■■ 4.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	C3	P01024	1663 aa		45.3	■■■■■ 4.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		45.28	■■■■■ 4.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		45.27	■■■■■ 4.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZMYM3	Q14202	1370 aa		45.24	■■■■■ 4.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	KIF3B	O15066	747 aa		45.23	■■■■■ 4.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		45.19	■■■■■ 4.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	45.16	■■■■■ 4.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	MROH2A	A6NES4	1674 aa		45.15	■■■■■ 4.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	45.15	■■■■■ 4.82
SEMA3B-215	ENST00000621029	NPAT	Q14207	1427 aa		45.09	■■■■■ 4.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	45.07	■■■■■ 4.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		45.06	■■■■■ 4.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		45.05	■■■■■ 4.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		45.04	■■■■■ 4.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		45.01	■■■■■ 4.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	PTPRK	Q15262	1439 aa		44.97	■■■■■ 4.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	ABCC5	O15440	1437 aa		44.95	■■■■■ 4.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		44.94	■■■■■ 4.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		44.92	■■■■■ 4.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	44.91	■■■■■ 4.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		44.9	■■■■■ 4.78

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