RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620978.1

GDF6-202, Transcript of growth differentiation factor 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GDF6, Length 973 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6-202ENST00000620978 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.72■■■■□ 3.47
GDF6-202ENST00000620978 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.7■■■■□ 3.47
GDF6-202ENST00000620978 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.69■■■■□ 3.46
GDF6-202ENST00000620978 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.69■■■■□ 3.46
GDF6-202ENST00000620978 PREX2Q70Z35 1606 aa36.69■■■■□ 3.46
GDF6-202ENST00000620978 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.68■■■■□ 3.46
GDF6-202ENST00000620978 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.64■■■■□ 3.46
GDF6-202ENST00000620978 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.62■■■■□ 3.45
GDF6-202ENST00000620978 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.62■■■■□ 3.45
GDF6-202ENST00000620978 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
GDF6-202ENST00000620978 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.6■■■■□ 3.45
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GDF6-202ENST00000620978 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.57■■■■□ 3.44
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GDF6-202ENST00000620978 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.54■■■■□ 3.44
GDF6-202ENST00000620978 AFAP1Q8N556 730 aa36.54■■■■□ 3.44
GDF6-202ENST00000620978 ABCC1P33527 1531 aa36.53■■■■□ 3.44
GDF6-202ENST00000620978 TIAM1Q13009 1591 aa36.53■■■■□ 3.44
GDF6-202ENST00000620978 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.51■■■■□ 3.43
GDF6-202ENST00000620978 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
GDF6-202ENST00000620978 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
GDF6-202ENST00000620978 KDM5CP41229 1560 aa36.49■■■■□ 3.43
GDF6-202ENST00000620978 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.49■■■■□ 3.43
GDF6-202ENST00000620978 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.45■■■■□ 3.43
GDF6-202ENST00000620978 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.45■■■■□ 3.42
GDF6-202ENST00000620978 MAP3K1Q13233 1512 aa36.44■■■■□ 3.42
GDF6-202ENST00000620978 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.44■■■■□ 3.42
GDF6-202ENST00000620978 ATP10AO60312 1499 aa36.43■■■■□ 3.42
GDF6-202ENST00000620978 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.41■■■■□ 3.42
GDF6-202ENST00000620978 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.4■■■■□ 3.42
GDF6-202ENST00000620978 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
GDF6-202ENST00000620978 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.4■■■■□ 3.42
GDF6-202ENST00000620978 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.4■■■■□ 3.42
GDF6-202ENST00000620978 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.4■■■■□ 3.42
GDF6-202ENST00000620978 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.39■■■■□ 3.42
GDF6-202ENST00000620978 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.39■■■■□ 3.42
GDF6-202ENST00000620978 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.39■■■■□ 3.42
GDF6-202ENST00000620978 NCOA2Q15596 1464 aa36.38■■■■□ 3.41
GDF6-202ENST00000620978 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.36■■■■□ 3.41
GDF6-202ENST00000620978 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.35■■■■□ 3.41
GDF6-202ENST00000620978 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.35■■■■□ 3.41
GDF6-202ENST00000620978 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.31■■■■□ 3.4
GDF6-202ENST00000620978 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
GDF6-202ENST00000620978 APLP2Q06481 763 aa36.29■■■■□ 3.4
GDF6-202ENST00000620978 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.28■■■■□ 3.4
GDF6-202ENST00000620978 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
GDF6-202ENST00000620978 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.39
GDF6-202ENST00000620978 PTPRMP28827 1452 aa36.25■■■■□ 3.39
GDF6-202ENST00000620978 MADDQ8WXG6 1647 aa36.25■■■■□ 3.39
GDF6-202ENST00000620978 REREQ9P2R6 1566 aa36.24■■■■□ 3.39
GDF6-202ENST00000620978 ABCA6Q8N139 1617 aa36.24■■■■□ 3.39
GDF6-202ENST00000620978 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36.24■■■■□ 3.39
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GDF6-202ENST00000620978 MBD5Q9P267 1494 aa36.2■■■■□ 3.39
GDF6-202ENST00000620978 ATP7AQ04656 1500 aa36.14■■■■□ 3.38
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GDF6-202ENST00000620978 AGLP35573 1532 aa36.13■■■■□ 3.38
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GDF6-202ENST00000620978 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.06■■■■□ 3.36
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GDF6-202ENST00000620978 TSPY10P0CW01 314 aa35.96■■■■□ 3.35
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GDF6-202ENST00000620978 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.94■■■■□ 3.34
GDF6-202ENST00000620978 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
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GDF6-202ENST00000620978 MROH2AA6NES4 1674 aa35.71■■■■□ 3.31
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GDF6-202ENST00000620978 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
GDF6-202ENST00000620978 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.65■■■■□ 3.3
GDF6-202ENST00000620978 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
GDF6-202ENST00000620978 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.63■■■■□ 3.29
GDF6-202ENST00000620978 HSPA2P54652 639 aa35.62■■■■□ 3.29
GDF6-202ENST00000620978 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.6■■■■□ 3.29
GDF6-202ENST00000620978 NPATQ14207 1427 aa35.59■■■■□ 3.29
GDF6-202ENST00000620978 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.58■■■■□ 3.29
GDF6-202ENST00000620978 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.58■■■■□ 3.29
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