RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620944.4

NME4-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NME4, Length 1,193 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-211ENST00000620944 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.79■■■■□ 3.16
NME4-211ENST00000620944 POGZQ7Z3K3 1410 aa34.77■■■■□ 3.16
NME4-211ENST00000620944 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa34.75■■■■□ 3.15
NME4-211ENST00000620944 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa34.73■■■■□ 3.15
NME4-211ENST00000620944 MAGI2Q86UL8 1455 aa34.71■■■■□ 3.15
NME4-211ENST00000620944 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa34.71■■■■□ 3.15
NME4-211ENST00000620944 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.7■■■■□ 3.15
NME4-211ENST00000620944 PREX2Q70Z35 1606 aa34.66■■■■□ 3.14
NME4-211ENST00000620944 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa34.65■■■■□ 3.14
NME4-211ENST00000620944 YEATS2Q9ULM3 1422 aa34.65■■■■□ 3.14
NME4-211ENST00000620944 MYT1LQ9UL68 1186 aa34.63■■■■□ 3.13
NME4-211ENST00000620944 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa34.61■■■■□ 3.13
NME4-211ENST00000620944 AFAP1Q8N556 730 aa34.6■■■■□ 3.13
NME4-211ENST00000620944 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
NME4-211ENST00000620944 CCNB3Q8WWL7 1395 aa34.58■■■■□ 3.13
NME4-211ENST00000620944 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
NME4-211ENST00000620944 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa34.54■■■■□ 3.12
NME4-211ENST00000620944 ABCC1P33527 1531 aa34.54■■■■□ 3.12
NME4-211ENST00000620944 BCORL1Q5H9F3 1711 aa34.53■■■■□ 3.12
NME4-211ENST00000620944 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP34.53■■■■□ 3.12
NME4-211ENST00000620944 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.53■■■■□ 3.12
NME4-211ENST00000620944 ADAMTSL3P82987 1691 aa34.52■■■■□ 3.12
NME4-211ENST00000620944 ATP10AO60312 1499 aa34.52■■■■□ 3.12
NME4-211ENST00000620944 KDM5CP41229 1560 aa34.51■■■■□ 3.12
NME4-211ENST00000620944 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.51■■■■□ 3.12
NME4-211ENST00000620944 C9orf84Q5VXU9 1444 aa34.49■■■■□ 3.11
NME4-211ENST00000620944 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa34.48■■■■□ 3.11
NME4-211ENST00000620944 PTPRMP28827 1452 aa34.48■■■■□ 3.11
NME4-211ENST00000620944 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa34.47■■■■□ 3.11
NME4-211ENST00000620944 MLECQ14165 292 aa34.47■■■■□ 3.11
NME4-211ENST00000620944 HECW2Q9P2P5 1572 aa34.46■■■■□ 3.11
NME4-211ENST00000620944 MADDQ8WXG6 1647 aa34.45■■■■□ 3.11
NME4-211ENST00000620944 ITSN2Q9NZM3 1697 aa34.44■■■■□ 3.1
NME4-211ENST00000620944 MLH3Q9UHC1 1453 aa34.42■■■■□ 3.1
NME4-211ENST00000620944 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa34.41■■■■□ 3.1
NME4-211ENST00000620944 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa34.41■■■■□ 3.1
NME4-211ENST00000620944 SYCP2Q9BX26 1530 aa34.4■■■■□ 3.1
NME4-211ENST00000620944 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP34.39■■■■□ 3.1
NME4-211ENST00000620944 TIAM1Q13009 1591 aa34.38■■■■□ 3.09
NME4-211ENST00000620944 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.37■■■■□ 3.09
NME4-211ENST00000620944 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa34.36■■■■□ 3.09
NME4-211ENST00000620944 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa34.36■■■■□ 3.09
NME4-211ENST00000620944 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP34.34■■■■□ 3.09
NME4-211ENST00000620944 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
NME4-211ENST00000620944 PLPPR3Q6T4P5 718 aa34.33■■■■□ 3.09
NME4-211ENST00000620944 NCOA2Q15596 1464 aa34.32■■■■□ 3.08
NME4-211ENST00000620944 ABCA6Q8N139 1617 aa34.3■■■■□ 3.08
NME4-211ENST00000620944 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
NME4-211ENST00000620944 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
NME4-211ENST00000620944 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.27■■■■□ 3.08
NME4-211ENST00000620944 REREQ9P2R6 1566 aa34.27■■■■□ 3.08
NME4-211ENST00000620944 APLP2Q06481 763 aa34.25■■■■□ 3.07
NME4-211ENST00000620944 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa34.23■■■■□ 3.07
NME4-211ENST00000620944 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa34.22■■■■□ 3.07
NME4-211ENST00000620944 MAP3K1Q13233 1512 aa34.22■■■■□ 3.07
NME4-211ENST00000620944 ATP7AQ04656 1500 aa34.2■■■■□ 3.06
NME4-211ENST00000620944 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
NME4-211ENST00000620944 AGLP35573 1532 aa34.18■■■■□ 3.06
NME4-211ENST00000620944 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.17■■■■□ 3.06
NME4-211ENST00000620944 MBD5Q9P267 1494 aa34.14■■■■□ 3.06
NME4-211ENST00000620944 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa34.14■■■■□ 3.06
NME4-211ENST00000620944 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
NME4-211ENST00000620944 RSPH4AQ5TD94 716 aa34.09■■■■□ 3.05
NME4-211ENST00000620944 A2MP01023 1474 aa34.07■■■■□ 3.05
NME4-211ENST00000620944 CCDC141Q6ZP82 1450 aa34.07■■■■□ 3.05
NME4-211ENST00000620944 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.04
NME4-211ENST00000620944 LMTK3Q96Q04 1460 aa34.06■■■■□ 3.04
NME4-211ENST00000620944 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa34.04■■■■□ 3.04
NME4-211ENST00000620944 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.01■■■■□ 3.03
NME4-211ENST00000620944 TSPY4P0CV99 314 aa34■■■■□ 3.03
NME4-211ENST00000620944 TSPY10P0CW01 314 aa34■■■■□ 3.03
NME4-211ENST00000620944 CNTLNQ9NXG0 1405 aa34■■■■□ 3.03
NME4-211ENST00000620944 PLXNC1O60486 1568 aa33.98■■■■□ 3.03
NME4-211ENST00000620944 MIA2Q96PC5 1412 aa33.97■■■■□ 3.03
NME4-211ENST00000620944 ADGBQ8N7X0 1667 aa33.96■■■■□ 3.03
NME4-211ENST00000620944 ARHGEF5Q12774 1597 aa33.95■■■■□ 3.03
NME4-211ENST00000620944 HSPA2P54652 639 aa33.95■■■■□ 3.03
NME4-211ENST00000620944 GGT6Q6P531 493 aa33.95■■■■□ 3.03
NME4-211ENST00000620944 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP33.92■■■■□ 3.02
NME4-211ENST00000620944 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa33.87■■■■□ 3.01
NME4-211ENST00000620944 C3P01024 1663 aa33.86■■■■□ 3.01
NME4-211ENST00000620944 PREX1Q8TCU6 1659 aa33.86■■■■□ 3.01
NME4-211ENST00000620944 PPP6R1Q9UPN7 881 aa33.85■■■■□ 3.01
NME4-211ENST00000620944 ZMYM3Q14202 1370 aa33.84■■■■□ 3.01
NME4-211ENST00000620944 KIF3BO15066 747 aa33.83■■■■□ 3.01
NME4-211ENST00000620944 MROH2AA6NES4 1674 aa33.79■■■■□ 3
NME4-211ENST00000620944 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP33.77■■■■□ 3
NME4-211ENST00000620944 FGD6Q6ZV73 1430 aa33.76■■■□□ 2.99
NME4-211ENST00000620944 MAST1Q9Y2H9 1570 aa33.76■■■□□ 2.99
NME4-211ENST00000620944 NPATQ14207 1427 aa33.75■■■□□ 2.99
NME4-211ENST00000620944 PTPN23Q9H3S7 1636 aa33.75■■■□□ 2.99
NME4-211ENST00000620944 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP33.71■■■□□ 2.99
NME4-211ENST00000620944 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa33.69■■■□□ 2.98
NME4-211ENST00000620944 ABCC5O15440 1437 aa33.66■■■□□ 2.98
NME4-211ENST00000620944 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP33.66■■■□□ 2.98
NME4-211ENST00000620944 SHANK2Q9UPX8 1470 aa33.66■■■□□ 2.98
NME4-211ENST00000620944 KDM5DQ9BY66 1539 aa33.65■■■□□ 2.98
NME4-211ENST00000620944 DAPK1P53355 1430 aa33.64■■■□□ 2.98
NME4-211ENST00000620944 PTPRKQ15262 1439 aa33.64■■■□□ 2.98
NME4-211ENST00000620944 FAM135AQ9P2D6 1515 aa33.63■■■□□ 2.97
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