RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620385.1

CTXN3-204, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CTXN3, Length 1,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-204ENST00000620385 MICALL2Q8IY33 904 aa14.17□□□□□ -0.14
CTXN3-204ENST00000620385 RIMBP2O15034 1052 aa14.16□□□□□ -0.14
CTXN3-204ENST00000620385 UNC13AQ9UPW8 1703 aa14.15□□□□□ -0.14
CTXN3-204ENST00000620385 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
CTXN3-204ENST00000620385 GPR153Q6NV75 609 aa14.09□□□□□ -0.15
CTXN3-204ENST00000620385 TRIM41Q8WV44 630 aa14.09□□□□□ -0.15
CTXN3-204ENST00000620385 MS4A4AQ96JQ5 239 aa14.09□□□□□ -0.15
CTXN3-204ENST00000620385 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa14.09□□□□□ -0.15
CTXN3-204ENST00000620385 MYT1LQ9UL68 1186 aa14.08□□□□□ -0.16
CTXN3-204ENST00000620385 ZNF687Q8N1G0 1237 aa14.07□□□□□ -0.16
CTXN3-204ENST00000620385 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
CTXN3-204ENST00000620385 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
CTXN3-204ENST00000620385 SOX12O15370 315 aa14.03□□□□□ -0.16
CTXN3-204ENST00000620385 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
CTXN3-204ENST00000620385 PHF8Q9UPP1 1060 aa14.02□□□□□ -0.17
CTXN3-204ENST00000620385 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
CTXN3-204ENST00000620385 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
CTXN3-204ENST00000620385 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
CTXN3-204ENST00000620385 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
CTXN3-204ENST00000620385 ARSIQ5FYB1 569 aa13.99□□□□□ -0.17
CTXN3-204ENST00000620385 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP13.95□□□□□ -0.18
CTXN3-204ENST00000620385 VGFO15240 615 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
CTXN3-204ENST00000620385 SMARCA4P51532 1647 aa13.91□□□□□ -0.18
CTXN3-204ENST00000620385 PTGER2P43116 358 aa13.91□□□□□ -0.18
CTXN3-204ENST00000620385 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa13.91□□□□□ -0.18
CTXN3-204ENST00000620385 BICRAQ9NZM4 1560 aa13.91□□□□□ -0.18
CTXN3-204ENST00000620385 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
CTXN3-204ENST00000620385 MROH2BQ7Z745 1585 aa13.88□□□□□ -0.19
CTXN3-204ENST00000620385 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP13.85□□□□□ -0.19
CTXN3-204ENST00000620385 FBXO22Q8NEZ5 403 aa13.85□□□□□ -0.19
CTXN3-204ENST00000620385 CECR2Q9BXF3 1484 aa13.84□□□□□ -0.19
CTXN3-204ENST00000620385 PEG3Q9GZU2 1588 aa13.83□□□□□ -0.19
CTXN3-204ENST00000620385 NLRP6P59044 892 aa13.83□□□□□ -0.2
CTXN3-204ENST00000620385 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
CTXN3-204ENST00000620385 WIZO95785 1651 aa13.8□□□□□ -0.2
CTXN3-204ENST00000620385 KIF3CO14782 793 aa13.78□□□□□ -0.2
CTXN3-204ENST00000620385 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
CTXN3-204ENST00000620385 NUDT7P0C024 238 aa13.76□□□□□ -0.21
CTXN3-204ENST00000620385 MFRPQ9BY79 579 aa13.76□□□□□ -0.21
CTXN3-204ENST00000620385 C2orf72A6NCS6 295 aa13.75□□□□□ -0.21
CTXN3-204ENST00000620385 POTEEQ6S8J3 1075 aa13.75□□□□□ -0.21
CTXN3-204ENST00000620385 AXIN2Q9Y2T1 843 aa13.72□□□□□ -0.21
CTXN3-204ENST00000620385 STK24Q9Y6E0 443 aa13.72□□□□□ -0.21
CTXN3-204ENST00000620385 PBX2P40425 430 aa13.71□□□□□ -0.21
CTXN3-204ENST00000620385 LHX6Q9UPM6 363 aa13.71□□□□□ -0.21
CTXN3-204ENST00000620385 SMARCA2P51531 1590 aa13.69□□□□□ -0.22
CTXN3-204ENST00000620385 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
CTXN3-204ENST00000620385 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa13.68□□□□□ -0.22
CTXN3-204ENST00000620385 SLC34A2O95436 690 aa13.64□□□□□ -0.23
CTXN3-204ENST00000620385 TAOK2Q9UL54 1235 aa13.63□□□□□ -0.23
CTXN3-204ENST00000620385 STK25O00506 426 aa13.62□□□□□ -0.23
CTXN3-204ENST00000620385 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa13.62□□□□□ -0.23
CTXN3-204ENST00000620385 HCSTQ9UBK5 93 aa13.58□□□□□ -0.24
CTXN3-204ENST00000620385 HMGXB3Q12766 1538 aa13.58□□□□□ -0.24
CTXN3-204ENST00000620385 ADGRD1Q6QNK2 874 aa13.57□□□□□ -0.24
CTXN3-204ENST00000620385 TMC2Q8TDI7 906 aa13.57□□□□□ -0.24
CTXN3-204ENST00000620385 ARHGAP33O14559 1287 aa13.54□□□□□ -0.24
CTXN3-204ENST00000620385 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa13.53□□□□□ -0.24
CTXN3-204ENST00000620385 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
CTXN3-204ENST00000620385 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa13.51□□□□□ -0.25
CTXN3-204ENST00000620385 PPP1R37O75864 691 aa13.5□□□□□ -0.25
CTXN3-204ENST00000620385 CCDC88BA6NC98 1476 aa13.49□□□□□ -0.25
CTXN3-204ENST00000620385 DMRTA1Q5VZB9 504 aa13.49□□□□□ -0.25
CTXN3-204ENST00000620385 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
CTXN3-204ENST00000620385 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
CTXN3-204ENST00000620385 HRO43593 1189 aa13.47□□□□□ -0.25
CTXN3-204ENST00000620385 PSEN2P49810 448 aa13.47□□□□□ -0.25
CTXN3-204ENST00000620385 TK2O00142 265 aa13.45□□□□□ -0.26
CTXN3-204ENST00000620385 RGL2O15211 777 aa13.44□□□□□ -0.26
CTXN3-204ENST00000620385 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
CTXN3-204ENST00000620385 NCAPD3P42695 1498 aa13.42□□□□□ -0.26
CTXN3-204ENST00000620385 PRDM2Q13029 1718 aa13.39□□□□□ -0.27
CTXN3-204ENST00000620385 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
CTXN3-204ENST00000620385 PKD2Q13563 968 aa13.38□□□□□ -0.27
CTXN3-204ENST00000620385 FOXK1P85037 733 aa13.36□□□□□ -0.27
CTXN3-204ENST00000620385 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa13.36□□□□□ -0.27
CTXN3-204ENST00000620385 PLPP6Q8IY26 295 aa13.36□□□□□ -0.27
CTXN3-204ENST00000620385 EEA1Q15075 1411 aa13.34□□□□□ -0.27
CTXN3-204ENST00000620385 DSG2Q14126 1118 aa13.31□□□□□ -0.28
CTXN3-204ENST00000620385 KCNK17Q96T54 332 aa13.31□□□□□ -0.28
CTXN3-204ENST00000620385 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
CTXN3-204ENST00000620385 STAC3Q96MF2 364 aa13.28□□□□□ -0.28
CTXN3-204ENST00000620385 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa13.26□□□□□ -0.29
CTXN3-204ENST00000620385 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa13.25□□□□□ -0.29
CTXN3-204ENST00000620385 ABCC8Q09428 1581 aa13.25□□□□□ -0.29
CTXN3-204ENST00000620385 TBC1D12O60347 775 aa13.25□□□□□ -0.29
CTXN3-204ENST00000620385 PTPN5P54829 565 aa13.24□□□□□ -0.29
CTXN3-204ENST00000620385 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP13.23□□□□□ -0.29
CTXN3-204ENST00000620385 TOP2BQ02880 1626 aa13.22□□□□□ -0.29
CTXN3-204ENST00000620385 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa13.21□□□□□ -0.29
CTXN3-204ENST00000620385 KCNH8Q96L42 1107 aa13.21□□□□□ -0.29
CTXN3-204ENST00000620385 CFTRP13569 1480 aa13.18□□□□□ -0.3
CTXN3-204ENST00000620385 OXER1Q8TDS5 423 aa13.18□□□□□ -0.3
CTXN3-204ENST00000620385 SYNJ1O43426 1573 aa13.18□□□□□ -0.3
CTXN3-204ENST00000620385 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP13.17□□□□□ -0.3
CTXN3-204ENST00000620385 ZNF454Q8N9F8 522 aa13.16□□□□□ -0.3
CTXN3-204ENST00000620385 BCL2L12Q9HB09 334 aa13.15□□□□□ -0.3
CTXN3-204ENST00000620385 KIF21BO75037 1637 aa13.14□□□□□ -0.31
CTXN3-204ENST00000620385 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
CTXN3-204ENST00000620385 IFFO2Q5TF58 517 aa13.14□□□□□ -0.31
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