RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618035.4

RCC1L-205, Transcript of RCC1 like, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene RCC1L, Length 1,409 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RCC1L-205	ENST00000618035	PREX2	Q70Z35	1606 aa		42.7	■■■■■ 4.43
RCC1L-205	ENST00000618035	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		42.7	■■■■■ 4.43
RCC1L-205	ENST00000618035	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		42.69	■■■■■ 4.42
RCC1L-205	ENST00000618035	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		42.68	■■■■■ 4.42
RCC1L-205	ENST00000618035	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		42.62	■■■■■ 4.41
RCC1L-205	ENST00000618035	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		42.61	■■■■■ 4.41
RCC1L-205	ENST00000618035	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		42.61	■■■■■ 4.41
RCC1L-205	ENST00000618035	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	42.56	■■■■■ 4.4
RCC1L-205	ENST00000618035	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		42.56	■■■■■ 4.4
RCC1L-205	ENST00000618035	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		42.55	■■■■■ 4.4
RCC1L-205	ENST00000618035	TIAM1	Q13009	1591 aa		42.53	■■■■■ 4.4
RCC1L-205	ENST00000618035	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		42.5	■■■■■ 4.39
RCC1L-205	ENST00000618035	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		42.5	■■■■■ 4.39
RCC1L-205	ENST00000618035	ABCC1	P33527	1531 aa		42.49	■■■■■ 4.39
RCC1L-205	ENST00000618035	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		42.46	■■■■■ 4.39
RCC1L-205	ENST00000618035	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		42.46	■■■■■ 4.39
RCC1L-205	ENST00000618035	KDM5C	P41229	1560 aa		42.44	■■■■■ 4.38
RCC1L-205	ENST00000618035	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		42.44	■■■■■ 4.38
RCC1L-205	ENST00000618035	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		42.44	■■■■■ 4.38
RCC1L-205	ENST00000618035	AFAP1	Q8N556	730 aa		42.44	■■■■■ 4.38
RCC1L-205	ENST00000618035	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		42.44	■■■■■ 4.38
RCC1L-205	ENST00000618035	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		42.43	■■■■■ 4.38
RCC1L-205	ENST00000618035	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		42.42	■■■■■ 4.38
RCC1L-205	ENST00000618035	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		42.4	■■■■■ 4.38
RCC1L-205	ENST00000618035	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	42.36	■■■■■ 4.37
RCC1L-205	ENST00000618035	MAP3K1	Q13233	1512 aa		42.35	■■■■■ 4.37
RCC1L-205	ENST00000618035	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	42.34	■■■■■ 4.37
RCC1L-205	ENST00000618035	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		42.34	■■■■■ 4.37
RCC1L-205	ENST00000618035	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	42.34	■■■■■ 4.37
RCC1L-205	ENST00000618035	NCOA2	Q15596	1464 aa		42.33	■■■■■ 4.37
RCC1L-205	ENST00000618035	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		42.32	■■■■■ 4.36
RCC1L-205	ENST00000618035	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		42.31	■■■■■ 4.36
RCC1L-205	ENST00000618035	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	42.3	■■■■■ 4.36
RCC1L-205	ENST00000618035	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		42.3	■■■■■ 4.36
RCC1L-205	ENST00000618035	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		42.29	■■■■■ 4.36
RCC1L-205	ENST00000618035	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		42.26	■■■■■ 4.36
RCC1L-205	ENST00000618035	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	42.26	■■■■■ 4.36
RCC1L-205	ENST00000618035	ATP10A	O60312	1499 aa		42.25	■■■■■ 4.35
RCC1L-205	ENST00000618035	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	42.24	■■■■■ 4.35	2e-10	■■■□□ 19.1
RCC1L-205	ENST00000618035	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		42.23	■■■■■ 4.35
RCC1L-205	ENST00000618035	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	42.22	■■■■■ 4.35
RCC1L-205	ENST00000618035	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		42.21	■■■■■ 4.35
RCC1L-205	ENST00000618035	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		42.2	■■■■■ 4.35
RCC1L-205	ENST00000618035	ABCA6	Q8N139	1617 aa		42.2	■■■■■ 4.35
RCC1L-205	ENST00000618035	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		42.19	■■■■■ 4.34
RCC1L-205	ENST00000618035	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		42.19	■■■■■ 4.34
RCC1L-205	ENST00000618035	MADD	Q8WXG6	1647 aa		42.16	■■■■■ 4.34
RCC1L-205	ENST00000618035	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		42.12	■■■■■ 4.33
RCC1L-205	ENST00000618035	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.11	■■■■■ 4.33
RCC1L-205	ENST00000618035	RERE	Q9P2R6	1566 aa		42.08	■■■■■ 4.33
RCC1L-205	ENST00000618035	PTPRM	P28827	1452 aa		42.07	■■■■■ 4.32
RCC1L-205	ENST00000618035	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		42.04	■■■■■ 4.32
RCC1L-205	ENST00000618035	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	42.04	■■■■■ 4.32
RCC1L-205	ENST00000618035	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	42.03	■■■■■ 4.32
RCC1L-205	ENST00000618035	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	42.02	■■■■■ 4.32
RCC1L-205	ENST00000618035	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.01	■■■■■ 4.32
RCC1L-205	ENST00000618035	APLP2	Q06481	763 aa		42.01	■■■■■ 4.32
RCC1L-205	ENST00000618035	MLEC	Q14165	292 aa		42.01	■■■■■ 4.32
RCC1L-205	ENST00000618035	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		41.94	■■■■■ 4.3
RCC1L-205	ENST00000618035	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		41.94	■■■■■ 4.3
RCC1L-205	ENST00000618035	AGL	P35573	1532 aa		41.94	■■■■■ 4.3
RCC1L-205	ENST00000618035	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		41.88	■■■■■ 4.29
RCC1L-205	ENST00000618035	MIA2	Q96PC5	1412 aa		41.87	■■■■■ 4.29
RCC1L-205	ENST00000618035	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		41.86	■■■■■ 4.29
RCC1L-205	ENST00000618035	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		41.84	■■■■■ 4.29
RCC1L-205	ENST00000618035	PLXNC1	O60486	1568 aa		41.84	■■■■■ 4.29
RCC1L-205	ENST00000618035	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		41.8	■■■■■ 4.28
RCC1L-205	ENST00000618035	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		41.8	■■■■■ 4.28
RCC1L-205	ENST00000618035	A2M	P01023	1474 aa		41.8	■■■■■ 4.28
RCC1L-205	ENST00000618035	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		41.71	■■■■■ 4.27
RCC1L-205	ENST00000618035	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		41.69	■■■■■ 4.27
RCC1L-205	ENST00000618035	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		41.68	■■■■■ 4.26
RCC1L-205	ENST00000618035	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		41.66	■■■■■ 4.26
RCC1L-205	ENST00000618035	TSPY4	P0CV99	314 aa		41.64	■■■■■ 4.26
RCC1L-205	ENST00000618035	TSPY10	P0CW01	314 aa		41.64	■■■■■ 4.26
RCC1L-205	ENST00000618035	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	41.64	■■■■■ 4.26
RCC1L-205	ENST00000618035	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	41.64	■■■■■ 4.26
RCC1L-205	ENST00000618035	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	41.63	■■■■■ 4.25
RCC1L-205	ENST00000618035	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		41.59	■■■■■ 4.25
RCC1L-205	ENST00000618035	C3	P01024	1663 aa		41.59	■■■■■ 4.25
RCC1L-205	ENST00000618035	ABCC5	O15440	1437 aa		41.56	■■■■■ 4.24
RCC1L-205	ENST00000618035	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		41.55	■■■■■ 4.24
RCC1L-205	ENST00000618035	GGT6	Q6P531	493 aa		41.52	■■■■■ 4.24
RCC1L-205	ENST00000618035	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	41.51	■■■■■ 4.24
RCC1L-205	ENST00000618035	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		41.51	■■■■■ 4.24
RCC1L-205	ENST00000618035	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	41.5	■■■■■ 4.23
RCC1L-205	ENST00000618035	MROH2A	A6NES4	1674 aa		41.49	■■■■■ 4.23
RCC1L-205	ENST00000618035	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	41.49	■■■■■ 4.23
RCC1L-205	ENST00000618035	DAPK1	P53355	1430 aa		41.48	■■■■■ 4.23
RCC1L-205	ENST00000618035	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		41.46	■■■■■ 4.23
RCC1L-205	ENST00000618035	KIF3B	O15066	747 aa		41.45	■■■■■ 4.23
RCC1L-205	ENST00000618035	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	41.44	■■■■■ 4.22
RCC1L-205	ENST00000618035	ZMYM3	Q14202	1370 aa		41.42	■■■■■ 4.22
RCC1L-205	ENST00000618035	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		41.42	■■■■■ 4.22
RCC1L-205	ENST00000618035	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	41.4	■■■■■ 4.22
RCC1L-205	ENST00000618035	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		41.38	■■■■■ 4.22
RCC1L-205	ENST00000618035	HSPA2	P54652	639 aa		41.35	■■■■■ 4.21
RCC1L-205	ENST00000618035	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		41.33	■■■■■ 4.21
RCC1L-205	ENST00000618035	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	41.33	■■■■■ 4.21
RCC1L-205	ENST00000618035	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	41.32	■■■■■ 4.21

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