RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC3-210ENST00000617904 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC3-210ENST00000617904 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC3-210ENST00000617904 PTPRMP28827 1452 aa25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC3-210ENST00000617904 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC3-210ENST00000617904 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC3-210ENST00000617904 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC3-210ENST00000617904 PLCH2O75038 1416 aa25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC3-210ENST00000617904 MADDQ8WXG6 1647 aa25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC3-210ENST00000617904 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC3-210ENST00000617904 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC3-210ENST00000617904 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC3-210ENST00000617904 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC3-210ENST00000617904 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC3-210ENST00000617904 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC3-210ENST00000617904 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC3-210ENST00000617904 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC3-210ENST00000617904 KIF14Q15058 1648 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC3-210ENST00000617904 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC3-210ENST00000617904 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC3-210ENST00000617904 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC3-210ENST00000617904 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC3-210ENST00000617904 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC3-210ENST00000617904 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC3-210ENST00000617904 ATP10AO60312 1499 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC3-210ENST00000617904 NCOA2Q15596 1464 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC3-210ENST00000617904 MLECQ14165 292 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC3-210ENST00000617904 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC3-210ENST00000617904 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.14■■□□□ 1.61
TRAPPC3-210ENST00000617904 AFAP1Q8N556 730 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC3-210ENST00000617904 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC3-210ENST00000617904 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC3-210ENST00000617904 KDM5CP41229 1560 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC3-210ENST00000617904 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC3-210ENST00000617904 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC3-210ENST00000617904 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC3-210ENST00000617904 HSPA2P54652 639 aa25.08■■□□□ 1.6
TRAPPC3-210ENST00000617904 PREX2Q70Z35 1606 aa25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC3-210ENST00000617904 MIA2Q96PC5 1412 aa25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC3-210ENST00000617904 HRCP23327 699 aa25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC3-210ENST00000617904 FBXO41Q8TF61 875 aa25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC3-210ENST00000617904 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC3-210ENST00000617904 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC3-210ENST00000617904 ABCC1P33527 1531 aa25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC3-210ENST00000617904 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 REREQ9P2R6 1566 aa25■■□□□ 1.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 ABCA6Q8N139 1617 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 ITGAEP38570 1179 aa24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC3-210ENST00000617904 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC3-210ENST00000617904 AGLP35573 1532 aa24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC3-210ENST00000617904 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC3-210ENST00000617904 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC3-210ENST00000617904 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC3-210ENST00000617904 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC3-210ENST00000617904 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC3-210ENST00000617904 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC3-210ENST00000617904 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC3-210ENST00000617904 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC3-210ENST00000617904 C3P01024 1663 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC3-210ENST00000617904 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC3-210ENST00000617904 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC3-210ENST00000617904 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC3-210ENST00000617904 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC3-210ENST00000617904 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC3-210ENST00000617904 CERKQ8TCT0 537 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC3-210ENST00000617904 STRCQ7RTU9 1775 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC3-210ENST00000617904 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC3-210ENST00000617904 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC3-210ENST00000617904 ATP7AQ04656 1500 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 HFM1A2PYH4 1435 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 PLXNC1O60486 1568 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC3-210ENST00000617904 DAPK1P53355 1430 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC3-210ENST00000617904 A2MP01023 1474 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC3-210ENST00000617904 MROH2AA6NES4 1674 aa24.69■■□□□ 1.54
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