RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617744.4

NUDT13-208, Transcript of nudix hydrolase 13, human

TSL 5 BASIC

Gene NUDT13, Length 928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUDT13-208	ENST00000617744	MLEC	Q14165	292 aa		12.61	□□□□□ -0.39
NUDT13-208	ENST00000617744	AFAP1	Q8N556	730 aa		12.61	□□□□□ -0.39
NUDT13-208	ENST00000617744	ADGRL1	O94910	1474 aa		12.6	□□□□□ -0.39
NUDT13-208	ENST00000617744	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	12.58	□□□□□ -0.4
NUDT13-208	ENST00000617744	APLP2	Q06481	763 aa		12.58	□□□□□ -0.4
NUDT13-208	ENST00000617744	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		12.58	□□□□□ -0.4
NUDT13-208	ENST00000617744	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	12.58	□□□□□ -0.4
NUDT13-208	ENST00000617744	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		12.57	□□□□□ -0.4
NUDT13-208	ENST00000617744	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		12.56	□□□□□ -0.4
NUDT13-208	ENST00000617744	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		12.55	□□□□□ -0.4
NUDT13-208	ENST00000617744	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		12.55	□□□□□ -0.4
NUDT13-208	ENST00000617744	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	12.55	□□□□□ -0.4
NUDT13-208	ENST00000617744	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		12.55	□□□□□ -0.4
NUDT13-208	ENST00000617744	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	12.54	□□□□□ -0.4
NUDT13-208	ENST00000617744	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.4
NUDT13-208	ENST00000617744	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		12.52	□□□□□ -0.41
NUDT13-208	ENST00000617744	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		12.52	□□□□□ -0.41
NUDT13-208	ENST00000617744	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		12.52	□□□□□ -0.41
NUDT13-208	ENST00000617744	RICTOR	Q6R327	1708 aa		12.51	□□□□□ -0.41
NUDT13-208	ENST00000617744	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		12.5	□□□□□ -0.41
NUDT13-208	ENST00000617744	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		12.5	□□□□□ -0.41
NUDT13-208	ENST00000617744	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		12.49	□□□□□ -0.41
NUDT13-208	ENST00000617744	PREX2	Q70Z35	1606 aa		12.49	□□□□□ -0.41
NUDT13-208	ENST00000617744	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		12.49	□□□□□ -0.41
NUDT13-208	ENST00000617744	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
NUDT13-208	ENST00000617744	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
NUDT13-208	ENST00000617744	TIAM1	Q13009	1591 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NUDT13-208	ENST00000617744	NCOA2	Q15596	1464 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NUDT13-208	ENST00000617744	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		12.46	□□□□□ -0.41
NUDT13-208	ENST00000617744	ATP10A	O60312	1499 aa		12.46	□□□□□ -0.42
NUDT13-208	ENST00000617744	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		12.46	□□□□□ -0.42
NUDT13-208	ENST00000617744	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		12.45	□□□□□ -0.42
NUDT13-208	ENST00000617744	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		12.45	□□□□□ -0.42
NUDT13-208	ENST00000617744	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		12.45	□□□□□ -0.42
NUDT13-208	ENST00000617744	ABCC1	P33527	1531 aa		12.44	□□□□□ -0.42
NUDT13-208	ENST00000617744	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		12.44	□□□□□ -0.42
NUDT13-208	ENST00000617744	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		12.44	□□□□□ -0.42
NUDT13-208	ENST00000617744	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
NUDT13-208	ENST00000617744	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		12.43	□□□□□ -0.42
NUDT13-208	ENST00000617744	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
NUDT13-208	ENST00000617744	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
NUDT13-208	ENST00000617744	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		12.43	□□□□□ -0.42
NUDT13-208	ENST00000617744	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		12.41	□□□□□ -0.42
NUDT13-208	ENST00000617744	MADD	Q8WXG6	1647 aa		12.4	□□□□□ -0.42
NUDT13-208	ENST00000617744	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		12.4	□□□□□ -0.42
NUDT13-208	ENST00000617744	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		12.4	□□□□□ -0.42
NUDT13-208	ENST00000617744	GGT6	Q6P531	493 aa		12.4	□□□□□ -0.42
NUDT13-208	ENST00000617744	PTPRM	P28827	1452 aa		12.4	□□□□□ -0.43
NUDT13-208	ENST00000617744	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		12.4	□□□□□ -0.43
NUDT13-208	ENST00000617744	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		12.4	□□□□□ -0.43
NUDT13-208	ENST00000617744	TSPY4	P0CV99	314 aa		12.39	□□□□□ -0.43
NUDT13-208	ENST00000617744	TSPY10	P0CW01	314 aa		12.39	□□□□□ -0.43
NUDT13-208	ENST00000617744	KDM5C	P41229	1560 aa		12.39	□□□□□ -0.43
NUDT13-208	ENST00000617744	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		12.38	□□□□□ -0.43
NUDT13-208	ENST00000617744	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	12.38	□□□□□ -0.43
NUDT13-208	ENST00000617744	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		12.38	□□□□□ -0.43
NUDT13-208	ENST00000617744	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		12.38	□□□□□ -0.43
NUDT13-208	ENST00000617744	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		12.38	□□□□□ -0.43
NUDT13-208	ENST00000617744	ABCA6	Q8N139	1617 aa		12.37	□□□□□ -0.43
NUDT13-208	ENST00000617744	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		12.36	□□□□□ -0.43
NUDT13-208	ENST00000617744	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
NUDT13-208	ENST00000617744	MAP3K1	Q13233	1512 aa		12.36	□□□□□ -0.43
NUDT13-208	ENST00000617744	MBD5	Q9P267	1494 aa		12.35	□□□□□ -0.43
NUDT13-208	ENST00000617744	HSPA2	P54652	639 aa		12.35	□□□□□ -0.43
NUDT13-208	ENST00000617744	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		12.35	□□□□□ -0.43
NUDT13-208	ENST00000617744	ATP7A	Q04656	1500 aa		12.35	□□□□□ -0.43
NUDT13-208	ENST00000617744	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		12.35	□□□□□ -0.43
NUDT13-208	ENST00000617744	KIF3B	O15066	747 aa		12.34	□□□□□ -0.43
NUDT13-208	ENST00000617744	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		12.34	□□□□□ -0.43
NUDT13-208	ENST00000617744	A2M	P01023	1474 aa		12.33	□□□□□ -0.44
NUDT13-208	ENST00000617744	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		12.33	□□□□□ -0.44
NUDT13-208	ENST00000617744	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		12.31	□□□□□ -0.44
NUDT13-208	ENST00000617744	ITGAE	P38570	1179 aa		12.31	□□□□□ -0.44
NUDT13-208	ENST00000617744	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		12.31	□□□□□ -0.44
NUDT13-208	ENST00000617744	MIA2	Q96PC5	1412 aa		12.29	□□□□□ -0.44
NUDT13-208	ENST00000617744	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	12.28	□□□□□ -0.44
NUDT13-208	ENST00000617744	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	12.28	□□□□□ -0.44
NUDT13-208	ENST00000617744	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	12.28	□□□□□ -0.44
NUDT13-208	ENST00000617744	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		12.28	□□□□□ -0.44
NUDT13-208	ENST00000617744	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		12.27	□□□□□ -0.45
NUDT13-208	ENST00000617744	AGL	P35573	1532 aa		12.27	□□□□□ -0.45
NUDT13-208	ENST00000617744	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		12.26	□□□□□ -0.45
NUDT13-208	ENST00000617744	ZMYM3	Q14202	1370 aa		12.26	□□□□□ -0.45
NUDT13-208	ENST00000617744	RERE	Q9P2R6	1566 aa		12.26	□□□□□ -0.45
NUDT13-208	ENST00000617744	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		12.25	□□□□□ -0.45
NUDT13-208	ENST00000617744	ABCC5	O15440	1437 aa		12.25	□□□□□ -0.45
NUDT13-208	ENST00000617744	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		12.24	□□□□□ -0.45
NUDT13-208	ENST00000617744	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		12.23	□□□□□ -0.45
NUDT13-208	ENST00000617744	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	12.23	□□□□□ -0.45
NUDT13-208	ENST00000617744	DAPK1	P53355	1430 aa		12.22	□□□□□ -0.45
NUDT13-208	ENST00000617744	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		12.21	□□□□□ -0.45
NUDT13-208	ENST00000617744	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	12.21	□□□□□ -0.45
NUDT13-208	ENST00000617744	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		12.2	□□□□□ -0.46
NUDT13-208	ENST00000617744	KIF15	Q9NS87	1388 aa		12.2	□□□□□ -0.46
NUDT13-208	ENST00000617744	C3	P01024	1663 aa		12.2	□□□□□ -0.46
NUDT13-208	ENST00000617744	PLXNC1	O60486	1568 aa		12.2	□□□□□ -0.46
NUDT13-208	ENST00000617744	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		12.2	□□□□□ -0.46
NUDT13-208	ENST00000617744	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
NUDT13-208	ENST00000617744	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		12.18	□□□□□ -0.46
NUDT13-208	ENST00000617744	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		12.18	□□□□□ -0.46

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