RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616271.4

CADM1-222, Transcript of cell adhesion molecule 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CADM1, Length 1,246 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1-222ENST00000616271 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.03■■■□□ 2.24
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CADM1-222ENST00000616271 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.99■■■□□ 2.23
CADM1-222ENST00000616271 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.97■■■□□ 2.23
CADM1-222ENST00000616271 ADGRL1O94910 1474 aa28.97■■■□□ 2.23
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CADM1-222ENST00000616271 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.81■■■□□ 2.2
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CADM1-222ENST00000616271 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.79■■■□□ 2.2
CADM1-222ENST00000616271 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.76■■■□□ 2.19
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CADM1-222ENST00000616271 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.75■■■□□ 2.19
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CADM1-222ENST00000616271 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.74■■■□□ 2.19
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CADM1-222ENST00000616271 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.66■■■□□ 2.18
CADM1-222ENST00000616271 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.65■■■□□ 2.18
CADM1-222ENST00000616271 AFAP1Q8N556 730 aa28.65■■■□□ 2.18
CADM1-222ENST00000616271 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.65■■■□□ 2.18
CADM1-222ENST00000616271 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.17
CADM1-222ENST00000616271 MBD5Q9P267 1494 aa28.63■■■□□ 2.17
CADM1-222ENST00000616271 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.62■■■□□ 2.17
CADM1-222ENST00000616271 ABCA6Q8N139 1617 aa28.62■■■□□ 2.17
CADM1-222ENST00000616271 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.62■■■□□ 2.17
CADM1-222ENST00000616271 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
CADM1-222ENST00000616271 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.62■■■□□ 2.17
CADM1-222ENST00000616271 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.61■■■□□ 2.17
CADM1-222ENST00000616271 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.58■■■□□ 2.17
CADM1-222ENST00000616271 ATP7AQ04656 1500 aa28.58■■■□□ 2.17
CADM1-222ENST00000616271 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.57■■■□□ 2.16
CADM1-222ENST00000616271 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.57■■■□□ 2.16
CADM1-222ENST00000616271 ATP10AO60312 1499 aa28.56■■■□□ 2.16
CADM1-222ENST00000616271 REREQ9P2R6 1566 aa28.56■■■□□ 2.16
CADM1-222ENST00000616271 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.55■■■□□ 2.16
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CADM1-222ENST00000616271 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.53■■■□□ 2.16
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CADM1-222ENST00000616271 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.51■■■□□ 2.15
CADM1-222ENST00000616271 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.5■■■□□ 2.15
CADM1-222ENST00000616271 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.49■■■□□ 2.15
CADM1-222ENST00000616271 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.48■■■□□ 2.15
CADM1-222ENST00000616271 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.47■■■□□ 2.15
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CADM1-222ENST00000616271 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.44■■■□□ 2.14
CADM1-222ENST00000616271 AGLP35573 1532 aa28.43■■■□□ 2.14
CADM1-222ENST00000616271 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
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CADM1-222ENST00000616271 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.4■■■□□ 2.14
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CADM1-222ENST00000616271 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.37■■■□□ 2.13
CADM1-222ENST00000616271 TSPY4P0CV99 314 aa28.37■■■□□ 2.13
CADM1-222ENST00000616271 TSPY10P0CW01 314 aa28.37■■■□□ 2.13
CADM1-222ENST00000616271 A2MP01023 1474 aa28.37■■■□□ 2.13
CADM1-222ENST00000616271 DAPK1P53355 1430 aa28.36■■■□□ 2.13
CADM1-222ENST00000616271 ABCC5O15440 1437 aa28.35■■■□□ 2.13
CADM1-222ENST00000616271 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
CADM1-222ENST00000616271 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
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CADM1-222ENST00000616271 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.26■■■□□ 2.12
CADM1-222ENST00000616271 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
CADM1-222ENST00000616271 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
CADM1-222ENST00000616271 MLECQ14165 292 aa28.24■■■□□ 2.11
CADM1-222ENST00000616271 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.22■■■□□ 2.11
CADM1-222ENST00000616271 ADGRL2O95490 1459 aa28.21■■■□□ 2.11
CADM1-222ENST00000616271 PTPRMP28827 1452 aa28.21■■■□□ 2.11
CADM1-222ENST00000616271 MROH2AA6NES4 1674 aa28.17■■■□□ 2.1
CADM1-222ENST00000616271 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.17■■■□□ 2.1
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CADM1-222ENST00000616271 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
CADM1-222ENST00000616271 NCOA1Q15788 1441 aa28.14■■■□□ 2.1
CADM1-222ENST00000616271 ERBINQ96RT1 1412 aa28.13■■■□□ 2.09
CADM1-222ENST00000616271 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
CADM1-222ENST00000616271 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.13■■■□□ 2.09
CADM1-222ENST00000616271 PTPRKQ15262 1439 aa28.12■■■□□ 2.09
CADM1-222ENST00000616271 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.12■■■□□ 2.09
CADM1-222ENST00000616271 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.12■■■□□ 2.09
CADM1-222ENST00000616271 C3P01024 1663 aa28.11■■■□□ 2.09
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