RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616237.1

LHX1-202, Transcript of LIM homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LHX1, Length 1,364 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1-202ENST00000616237 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.17■■□□□ 1.94
LHX1-202ENST00000616237 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.16■■□□□ 1.94
LHX1-202ENST00000616237 PREX2Q70Z35 1606 aa27.14■■□□□ 1.93
LHX1-202ENST00000616237 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.14■■□□□ 1.93
LHX1-202ENST00000616237 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.11■■□□□ 1.93
LHX1-202ENST00000616237 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.11■■□□□ 1.93
LHX1-202ENST00000616237 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
LHX1-202ENST00000616237 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.1■■□□□ 1.93
LHX1-202ENST00000616237 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.08■■□□□ 1.93
LHX1-202ENST00000616237 TIAM1Q13009 1591 aa27.05■■□□□ 1.92
LHX1-202ENST00000616237 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.05■■□□□ 1.92
LHX1-202ENST00000616237 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.04■■□□□ 1.92
LHX1-202ENST00000616237 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.04■■□□□ 1.92
LHX1-202ENST00000616237 ABCC1P33527 1531 aa27.03■■□□□ 1.92
LHX1-202ENST00000616237 AFAP1Q8N556 730 aa27.02■■□□□ 1.92
LHX1-202ENST00000616237 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.01■■□□□ 1.91
LHX1-202ENST00000616237 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.01■■□□□ 1.91
LHX1-202ENST00000616237 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27■■□□□ 1.91
LHX1-202ENST00000616237 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27■■□□□ 1.91
LHX1-202ENST00000616237 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.99■■□□□ 1.91
LHX1-202ENST00000616237 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.99■■□□□ 1.91
LHX1-202ENST00000616237 KDM5CP41229 1560 aa26.98■■□□□ 1.91
LHX1-202ENST00000616237 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
LHX1-202ENST00000616237 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
LHX1-202ENST00000616237 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.96■■□□□ 1.91
LHX1-202ENST00000616237 MAP3K1Q13233 1512 aa26.96■■□□□ 1.91
LHX1-202ENST00000616237 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.96■■□□□ 1.91
LHX1-202ENST00000616237 NCOA2Q15596 1464 aa26.95■■□□□ 1.9
LHX1-202ENST00000616237 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
LHX1-202ENST00000616237 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.93■■□□□ 1.9
LHX1-202ENST00000616237 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
LHX1-202ENST00000616237 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.91■■□□□ 1.9
LHX1-202ENST00000616237 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
LHX1-202ENST00000616237 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
LHX1-202ENST00000616237 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.89■■□□□ 1.9
LHX1-202ENST00000616237 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.89■■□□□ 1.89
LHX1-202ENST00000616237 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.88■■□□□ 1.89
LHX1-202ENST00000616237 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.88■■□□□ 1.89
LHX1-202ENST00000616237 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.88■■□□□ 1.89
LHX1-202ENST00000616237 ATP10AO60312 1499 aa26.88■■□□□ 1.89
LHX1-202ENST00000616237 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.87■■□□□ 1.89
LHX1-202ENST00000616237 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.84■■□□□ 1.89
LHX1-202ENST00000616237 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.84■■□□□ 1.89
LHX1-202ENST00000616237 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.84■■□□□ 1.89
LHX1-202ENST00000616237 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.83■■□□□ 1.88
LHX1-202ENST00000616237 ABCA6Q8N139 1617 aa26.82■■□□□ 1.88
LHX1-202ENST00000616237 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.82■■□□□ 1.88
LHX1-202ENST00000616237 MBD5Q9P267 1494 aa26.81■■□□□ 1.88
LHX1-202ENST00000616237 MADDQ8WXG6 1647 aa26.79■■□□□ 1.88
LHX1-202ENST00000616237 APLP2Q06481 763 aa26.77■■□□□ 1.88
LHX1-202ENST00000616237 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
LHX1-202ENST00000616237 PTPRMP28827 1452 aa26.76■■□□□ 1.87
LHX1-202ENST00000616237 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.76■■□□□ 1.87
LHX1-202ENST00000616237 REREQ9P2R6 1566 aa26.75■■□□□ 1.87
LHX1-202ENST00000616237 MLECQ14165 292 aa26.75■■□□□ 1.87
LHX1-202ENST00000616237 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
LHX1-202ENST00000616237 ATP7AQ04656 1500 aa26.72■■□□□ 1.87
LHX1-202ENST00000616237 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.7■■□□□ 1.86
LHX1-202ENST00000616237 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
LHX1-202ENST00000616237 AGLP35573 1532 aa26.68■■□□□ 1.86
LHX1-202ENST00000616237 MIA2Q96PC5 1412 aa26.66■■□□□ 1.86
LHX1-202ENST00000616237 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.65■■□□□ 1.86
LHX1-202ENST00000616237 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.63■■□□□ 1.85
LHX1-202ENST00000616237 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.62■■□□□ 1.85
LHX1-202ENST00000616237 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.62■■□□□ 1.85
LHX1-202ENST00000616237 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.61■■□□□ 1.85
LHX1-202ENST00000616237 A2MP01023 1474 aa26.6■■□□□ 1.85
LHX1-202ENST00000616237 PLXNC1O60486 1568 aa26.6■■□□□ 1.85
LHX1-202ENST00000616237 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.55■■□□□ 1.84
LHX1-202ENST00000616237 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.54■■□□□ 1.84
LHX1-202ENST00000616237 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.53■■□□□ 1.84
LHX1-202ENST00000616237 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.53■■□□□ 1.84
LHX1-202ENST00000616237 TSPY4P0CV99 314 aa26.52■■□□□ 1.84
LHX1-202ENST00000616237 TSPY10P0CW01 314 aa26.52■■□□□ 1.84
LHX1-202ENST00000616237 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
LHX1-202ENST00000616237 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
LHX1-202ENST00000616237 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
LHX1-202ENST00000616237 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.49■■□□□ 1.83
LHX1-202ENST00000616237 ABCC5O15440 1437 aa26.47■■□□□ 1.83
LHX1-202ENST00000616237 GGT6Q6P531 493 aa26.44■■□□□ 1.82
LHX1-202ENST00000616237 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.43■■□□□ 1.82
LHX1-202ENST00000616237 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
LHX1-202ENST00000616237 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
LHX1-202ENST00000616237 DAPK1P53355 1430 aa26.41■■□□□ 1.82
LHX1-202ENST00000616237 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.41■■□□□ 1.82
LHX1-202ENST00000616237 C3P01024 1663 aa26.41■■□□□ 1.82
LHX1-202ENST00000616237 KIF3BO15066 747 aa26.4■■□□□ 1.82
LHX1-202ENST00000616237 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
LHX1-202ENST00000616237 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.39■■□□□ 1.81
LHX1-202ENST00000616237 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.38■■□□□ 1.81
LHX1-202ENST00000616237 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
LHX1-202ENST00000616237 ZMYM3Q14202 1370 aa26.35■■□□□ 1.81
LHX1-202ENST00000616237 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.34■■□□□ 1.81
LHX1-202ENST00000616237 MROH2AA6NES4 1674 aa26.34■■□□□ 1.81
LHX1-202ENST00000616237 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.8
LHX1-202ENST00000616237 HSPA2P54652 639 aa26.32■■□□□ 1.8
LHX1-202ENST00000616237 KIF15Q9NS87 1388 aa26.3■■□□□ 1.8
LHX1-202ENST00000616237 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.3■■□□□ 1.8
LHX1-202ENST00000616237 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.3■■□□□ 1.8
LHX1-202ENST00000616237 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms