RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615278.1

RNFT2-208, Transcript of ring finger protein, transmembrane 2, human

TSL 3

Gene RNFT2, Length 415 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNFT2-208	ENST00000615278	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		28.97	■■■□□ 2.23
RNFT2-208	ENST00000615278	MLEC	Q14165	292 aa		28.97	■■■□□ 2.23
RNFT2-208	ENST00000615278	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		28.97	■■■□□ 2.23
RNFT2-208	ENST00000615278	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	28.96	■■■□□ 2.23
RNFT2-208	ENST00000615278	CLIP1	P30622	1438 aa		28.95	■■■□□ 2.23
RNFT2-208	ENST00000615278	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		28.94	■■■□□ 2.22
RNFT2-208	ENST00000615278	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		28.93	■■■□□ 2.22
RNFT2-208	ENST00000615278	KIF14	Q15058	1648 aa		28.92	■■■□□ 2.22
RNFT2-208	ENST00000615278	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
RNFT2-208	ENST00000615278	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
RNFT2-208	ENST00000615278	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		28.88	■■■□□ 2.21
RNFT2-208	ENST00000615278	ATP10A	O60312	1499 aa		28.85	■■■□□ 2.21
RNFT2-208	ENST00000615278	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RNFT2-208	ENST00000615278	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		28.81	■■■□□ 2.2
RNFT2-208	ENST00000615278	AFAP1	Q8N556	730 aa		28.81	■■■□□ 2.2
RNFT2-208	ENST00000615278	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RNFT2-208	ENST00000615278	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RNFT2-208	ENST00000615278	HSPA2	P54652	639 aa		28.79	■■■□□ 2.2
RNFT2-208	ENST00000615278	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		28.79	■■■□□ 2.2
RNFT2-208	ENST00000615278	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RNFT2-208	ENST00000615278	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RNFT2-208	ENST00000615278	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RNFT2-208	ENST00000615278	FBXO41	Q8TF61	875 aa		28.76	■■■□□ 2.19
RNFT2-208	ENST00000615278	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		28.69	■■■□□ 2.18
RNFT2-208	ENST00000615278	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		28.68	■■■□□ 2.18
RNFT2-208	ENST00000615278	KDM5C	P41229	1560 aa		28.67	■■■□□ 2.18
RNFT2-208	ENST00000615278	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		28.66	■■■□□ 2.18
RNFT2-208	ENST00000615278	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	28.66	■■■□□ 2.18
RNFT2-208	ENST00000615278	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
RNFT2-208	ENST00000615278	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	28.66	■■■□□ 2.18
RNFT2-208	ENST00000615278	PREX2	Q70Z35	1606 aa		28.65	■■■□□ 2.18
RNFT2-208	ENST00000615278	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		28.61	■■■□□ 2.17
RNFT2-208	ENST00000615278	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		28.61	■■■□□ 2.17
RNFT2-208	ENST00000615278	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		28.61	■■■□□ 2.17
RNFT2-208	ENST00000615278	ABCC1	P33527	1531 aa		28.59	■■■□□ 2.17
RNFT2-208	ENST00000615278	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		28.56	■■■□□ 2.16
RNFT2-208	ENST00000615278	ABCA6	Q8N139	1617 aa		28.56	■■■□□ 2.16
RNFT2-208	ENST00000615278	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		28.56	■■■□□ 2.16
RNFT2-208	ENST00000615278	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		28.54	■■■□□ 2.16
RNFT2-208	ENST00000615278	RERE	Q9P2R6	1566 aa		28.54	■■■□□ 2.16
RNFT2-208	ENST00000615278	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	28.51	■■■□□ 2.15
RNFT2-208	ENST00000615278	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		28.51	■■■□□ 2.15
RNFT2-208	ENST00000615278	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	28.5	■■■□□ 2.15
RNFT2-208	ENST00000615278	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	28.49	■■■□□ 2.15
RNFT2-208	ENST00000615278	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		28.49	■■■□□ 2.15
RNFT2-208	ENST00000615278	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		28.49	■■■□□ 2.15
RNFT2-208	ENST00000615278	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		28.48	■■■□□ 2.15
RNFT2-208	ENST00000615278	AGL	P35573	1532 aa		28.48	■■■□□ 2.15
RNFT2-208	ENST00000615278	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	28.48	■■■□□ 2.15
RNFT2-208	ENST00000615278	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	28.47	■■■□□ 2.15
RNFT2-208	ENST00000615278	CERK	Q8TCT0	537 aa		28.46	■■■□□ 2.15
RNFT2-208	ENST00000615278	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		28.46	■■■□□ 2.15
RNFT2-208	ENST00000615278	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		28.45	■■■□□ 2.15
RNFT2-208	ENST00000615278	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		28.45	■■■□□ 2.14
RNFT2-208	ENST00000615278	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		28.41	■■■□□ 2.14
RNFT2-208	ENST00000615278	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		28.41	■■■□□ 2.14
RNFT2-208	ENST00000615278	C3	P01024	1663 aa		28.41	■■■□□ 2.14
RNFT2-208	ENST00000615278	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		28.37	■■■□□ 2.13
RNFT2-208	ENST00000615278	ATP7A	Q04656	1500 aa		28.34	■■■□□ 2.13
RNFT2-208	ENST00000615278	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	28.34	■■■□□ 2.13
RNFT2-208	ENST00000615278	STRC	Q7RTU9	1775 aa		28.31	■■■□□ 2.12
RNFT2-208	ENST00000615278	CEP162	Q5TB80	1403 aa		28.3	■■■□□ 2.12
RNFT2-208	ENST00000615278	GGT6	Q6P531	493 aa		28.3	■■■□□ 2.12
RNFT2-208	ENST00000615278	A2M	P01023	1474 aa		28.29	■■■□□ 2.12
RNFT2-208	ENST00000615278	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	28.29	■■■□□ 2.12
RNFT2-208	ENST00000615278	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		28.28	■■■□□ 2.12
RNFT2-208	ENST00000615278	ZMYM3	Q14202	1370 aa		28.28	■■■□□ 2.12
RNFT2-208	ENST00000615278	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	28.26	■■■□□ 2.11
RNFT2-208	ENST00000615278	NPAT	Q14207	1427 aa		28.24	■■■□□ 2.11
RNFT2-208	ENST00000615278	TIAM1	Q13009	1591 aa		28.24	■■■□□ 2.11
RNFT2-208	ENST00000615278	MROH2A	A6NES4	1674 aa		28.23	■■■□□ 2.11
RNFT2-208	ENST00000615278	PTPRT	O14522	1441 aa		28.22	■■■□□ 2.11
RNFT2-208	ENST00000615278	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	28.2	■■■□□ 2.11
RNFT2-208	ENST00000615278	PLXNC1	O60486	1568 aa		28.19	■■■□□ 2.1
RNFT2-208	ENST00000615278	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		28.18	■■■□□ 2.1
RNFT2-208	ENST00000615278	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		28.18	■■■□□ 2.1
RNFT2-208	ENST00000615278	NCOA1	Q15788	1441 aa		28.16	■■■□□ 2.1
RNFT2-208	ENST00000615278	MBD5	Q9P267	1494 aa		28.15	■■■□□ 2.1
RNFT2-208	ENST00000615278	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		28.14	■■■□□ 2.1
RNFT2-208	ENST00000615278	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		28.13	■■■□□ 2.09
RNFT2-208	ENST00000615278	NCOA2	Q15596	1464 aa		28.12	■■■□□ 2.09
RNFT2-208	ENST00000615278	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		28.11	■■■□□ 2.09
RNFT2-208	ENST00000615278	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		28.11	■■■□□ 2.09
RNFT2-208	ENST00000615278	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	28.11	■■■□□ 2.09
RNFT2-208	ENST00000615278	KIF3B	O15066	747 aa		28.1	■■■□□ 2.09
RNFT2-208	ENST00000615278	PTPRK	Q15262	1439 aa		28.09	■■■□□ 2.09
RNFT2-208	ENST00000615278	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		28.08	■■■□□ 2.09
RNFT2-208	ENST00000615278	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		28.08	■■■□□ 2.09
RNFT2-208	ENST00000615278	TSPY4	P0CV99	314 aa		28.07	■■■□□ 2.08
RNFT2-208	ENST00000615278	TSPY10	P0CW01	314 aa		28.07	■■■□□ 2.08
RNFT2-208	ENST00000615278	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		28.06	■■■□□ 2.08
RNFT2-208	ENST00000615278	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		28.05	■■■□□ 2.08
RNFT2-208	ENST00000615278	PKD2	Q13563	968 aa		28.04	■■■□□ 2.08
RNFT2-208	ENST00000615278	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	28.03	■■■□□ 2.08
RNFT2-208	ENST00000615278	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		28.01	■■■□□ 2.07
RNFT2-208	ENST00000615278	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
RNFT2-208	ENST00000615278	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		28	■■■□□ 2.07
RNFT2-208	ENST00000615278	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		28	■■■□□ 2.07
RNFT2-208	ENST00000615278	PLA2R1	Q13018	1463 aa		27.98	■■■□□ 2.07
RNFT2-208	ENST00000615278	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07

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