RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612509.4

SEMA3B-211, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 1,061 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-211ENST00000612509 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.79■■■□□ 2.2
SEMA3B-211ENST00000612509 TIAM1Q13009 1591 aa28.79■■■□□ 2.2
SEMA3B-211ENST00000612509 RAPGEF3O95398 923 aa28.75■■■□□ 2.19
SEMA3B-211ENST00000612509 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.73■■■□□ 2.19
SEMA3B-211ENST00000612509 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.73■■■□□ 2.19
SEMA3B-211ENST00000612509 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.72■■■□□ 2.19
SEMA3B-211ENST00000612509 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.7■■■□□ 2.19
SEMA3B-211ENST00000612509 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.69■■■□□ 2.18
SEMA3B-211ENST00000612509 ABCC1P33527 1531 aa28.69■■■□□ 2.18
SEMA3B-211ENST00000612509 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
SEMA3B-211ENST00000612509 MAP3K1Q13233 1512 aa28.67■■■□□ 2.18
SEMA3B-211ENST00000612509 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
SEMA3B-211ENST00000612509 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.65■■■□□ 2.18
SEMA3B-211ENST00000612509 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
SEMA3B-211ENST00000612509 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.63■■■□□ 2.17
SEMA3B-211ENST00000612509 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.62■■■□□ 2.17
SEMA3B-211ENST00000612509 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.62■■■□□ 2.17
SEMA3B-211ENST00000612509 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.61■■■□□ 2.17
SEMA3B-211ENST00000612509 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.61■■■□□ 2.17
SEMA3B-211ENST00000612509 KDM5CP41229 1560 aa28.61■■■□□ 2.17
SEMA3B-211ENST00000612509 NCOA2Q15596 1464 aa28.6■■■□□ 2.17
SEMA3B-211ENST00000612509 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.59■■■□□ 2.17
SEMA3B-211ENST00000612509 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.58■■■□□ 2.17
SEMA3B-211ENST00000612509 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.57■■■□□ 2.16
SEMA3B-211ENST00000612509 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.55■■■□□ 2.16
SEMA3B-211ENST00000612509 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.55■■■□□ 2.16
SEMA3B-211ENST00000612509 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.54■■■□□ 2.16
SEMA3B-211ENST00000612509 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
SEMA3B-211ENST00000612509 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.52■■■□□ 2.16
SEMA3B-211ENST00000612509 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.51■■■□□ 2.15
SEMA3B-211ENST00000612509 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
SEMA3B-211ENST00000612509 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
SEMA3B-211ENST00000612509 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.47■■■□□ 2.15
SEMA3B-211ENST00000612509 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.47■■■□□ 2.15
SEMA3B-211ENST00000612509 AFAP1Q8N556 730 aa28.47■■■□□ 2.15
SEMA3B-211ENST00000612509 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.45■■■□□ 2.14
SEMA3B-211ENST00000612509 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.45■■■□□ 2.14
SEMA3B-211ENST00000612509 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.45■■■□□ 2.14
SEMA3B-211ENST00000612509 ABCA6Q8N139 1617 aa28.44■■■□□ 2.14
SEMA3B-211ENST00000612509 APLP2Q06481 763 aa28.44■■■□□ 2.14
SEMA3B-211ENST00000612509 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.43■■■□□ 2.14
SEMA3B-211ENST00000612509 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.41■■■□□ 2.14
SEMA3B-211ENST00000612509 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.41■■■□□ 2.14
SEMA3B-211ENST00000612509 ATP10AO60312 1499 aa28.4■■■□□ 2.14
SEMA3B-211ENST00000612509 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.4■■■□□ 2.14
SEMA3B-211ENST00000612509 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
SEMA3B-211ENST00000612509 REREQ9P2R6 1566 aa28.37■■■□□ 2.13
SEMA3B-211ENST00000612509 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.37■■■□□ 2.13
SEMA3B-211ENST00000612509 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
SEMA3B-211ENST00000612509 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
SEMA3B-211ENST00000612509 MBD5Q9P267 1494 aa28.36■■■□□ 2.13
SEMA3B-211ENST00000612509 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.35■■■□□ 2.13
SEMA3B-211ENST00000612509 ATP7AQ04656 1500 aa28.35■■■□□ 2.13
SEMA3B-211ENST00000612509 MADDQ8WXG6 1647 aa28.35■■■□□ 2.13
SEMA3B-211ENST00000612509 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.34■■■□□ 2.13
SEMA3B-211ENST00000612509 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.3■■■□□ 2.12
SEMA3B-211ENST00000612509 MIA2Q96PC5 1412 aa28.3■■■□□ 2.12
SEMA3B-211ENST00000612509 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
SEMA3B-211ENST00000612509 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.28■■■□□ 2.12
SEMA3B-211ENST00000612509 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
SEMA3B-211ENST00000612509 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.24■■■□□ 2.11
SEMA3B-211ENST00000612509 AGLP35573 1532 aa28.24■■■□□ 2.11
SEMA3B-211ENST00000612509 PTPRMP28827 1452 aa28.22■■■□□ 2.11
SEMA3B-211ENST00000612509 PLXNC1O60486 1568 aa28.22■■■□□ 2.11
SEMA3B-211ENST00000612509 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.21■■■□□ 2.11
SEMA3B-211ENST00000612509 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.21■■■□□ 2.11
SEMA3B-211ENST00000612509 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.19■■■□□ 2.1
SEMA3B-211ENST00000612509 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.18■■■□□ 2.1
SEMA3B-211ENST00000612509 MLECQ14165 292 aa28.18■■■□□ 2.1
SEMA3B-211ENST00000612509 A2MP01023 1474 aa28.16■■■□□ 2.1
SEMA3B-211ENST00000612509 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.16■■■□□ 2.1
SEMA3B-211ENST00000612509 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.16■■■□□ 2.1
SEMA3B-211ENST00000612509 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
SEMA3B-211ENST00000612509 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.13■■■□□ 2.09
SEMA3B-211ENST00000612509 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
SEMA3B-211ENST00000612509 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.07■■■□□ 2.08
SEMA3B-211ENST00000612509 TSPY4P0CV99 314 aa28.05■■■□□ 2.08
SEMA3B-211ENST00000612509 TSPY10P0CW01 314 aa28.05■■■□□ 2.08
SEMA3B-211ENST00000612509 ABCC5O15440 1437 aa28.02■■■□□ 2.08
SEMA3B-211ENST00000612509 DAPK1P53355 1430 aa28.02■■■□□ 2.08
SEMA3B-211ENST00000612509 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
SEMA3B-211ENST00000612509 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.97■■■□□ 2.07
SEMA3B-211ENST00000612509 MROH2AA6NES4 1674 aa27.97■■■□□ 2.07
SEMA3B-211ENST00000612509 C3P01024 1663 aa27.97■■■□□ 2.07
SEMA3B-211ENST00000612509 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
SEMA3B-211ENST00000612509 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
SEMA3B-211ENST00000612509 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.94■■■□□ 2.06
SEMA3B-211ENST00000612509 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
SEMA3B-211ENST00000612509 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
SEMA3B-211ENST00000612509 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.92■■■□□ 2.06
SEMA3B-211ENST00000612509 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
SEMA3B-211ENST00000612509 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
SEMA3B-211ENST00000612509 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.89■■■□□ 2.05
SEMA3B-211ENST00000612509 KIF15Q9NS87 1388 aa27.88■■■□□ 2.05
SEMA3B-211ENST00000612509 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.88■■■□□ 2.05
SEMA3B-211ENST00000612509 GGT6Q6P531 493 aa27.88■■■□□ 2.05
SEMA3B-211ENST00000612509 KIF3BO15066 747 aa27.87■■■□□ 2.05
SEMA3B-211ENST00000612509 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
SEMA3B-211ENST00000612509 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.87■■■□□ 2.05
SEMA3B-211ENST00000612509 ADGRL2O95490 1459 aa27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms