RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609706.1

ANKRD54-212, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

Gene ANKRD54, Length 1,140 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-212ENST00000609706 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.83■■□□□ 1.73
ANKRD54-212ENST00000609706 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.83■■□□□ 1.73
ANKRD54-212ENST00000609706 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.82■■□□□ 1.72
ANKRD54-212ENST00000609706 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.82■■□□□ 1.72
ANKRD54-212ENST00000609706 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.8■■□□□ 1.72
ANKRD54-212ENST00000609706 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.8■■□□□ 1.72
ANKRD54-212ENST00000609706 PREX2Q70Z35 1606 aa25.79■■□□□ 1.72
ANKRD54-212ENST00000609706 MADDQ8WXG6 1647 aa25.77■■□□□ 1.72
ANKRD54-212ENST00000609706 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.77■■□□□ 1.72
ANKRD54-212ENST00000609706 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.77■■□□□ 1.72
ANKRD54-212ENST00000609706 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.75■■□□□ 1.71
ANKRD54-212ENST00000609706 PTPRMP28827 1452 aa25.75■■□□□ 1.71
ANKRD54-212ENST00000609706 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
ANKRD54-212ENST00000609706 KDM5CP41229 1560 aa25.73■■□□□ 1.71
ANKRD54-212ENST00000609706 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.72■■□□□ 1.71
ANKRD54-212ENST00000609706 ABCC1P33527 1531 aa25.71■■□□□ 1.71
ANKRD54-212ENST00000609706 CEP162Q5TB80 1403 aa25.71■■□□□ 1.71
ANKRD54-212ENST00000609706 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.69■■□□□ 1.7
ANKRD54-212ENST00000609706 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
ANKRD54-212ENST00000609706 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.66■■□□□ 1.7
ANKRD54-212ENST00000609706 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.66■■□□□ 1.7
ANKRD54-212ENST00000609706 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.63■■□□□ 1.69
ANKRD54-212ENST00000609706 ATP10AO60312 1499 aa25.63■■□□□ 1.69
ANKRD54-212ENST00000609706 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.61■■□□□ 1.69
ANKRD54-212ENST00000609706 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.6■■□□□ 1.69
ANKRD54-212ENST00000609706 ABCA6Q8N139 1617 aa25.59■■□□□ 1.69
ANKRD54-212ENST00000609706 AFAP1Q8N556 730 aa25.59■■□□□ 1.69
ANKRD54-212ENST00000609706 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.59■■□□□ 1.69
ANKRD54-212ENST00000609706 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
ANKRD54-212ENST00000609706 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.58■■□□□ 1.69
ANKRD54-212ENST00000609706 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.58■■□□□ 1.69
ANKRD54-212ENST00000609706 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.58■■□□□ 1.68
ANKRD54-212ENST00000609706 REREQ9P2R6 1566 aa25.57■■□□□ 1.68
ANKRD54-212ENST00000609706 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.56■■□□□ 1.68
ANKRD54-212ENST00000609706 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.55■■□□□ 1.68
ANKRD54-212ENST00000609706 TIAM1Q13009 1591 aa25.52■■□□□ 1.68
ANKRD54-212ENST00000609706 MLECQ14165 292 aa25.51■■□□□ 1.67
ANKRD54-212ENST00000609706 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.51■■□□□ 1.67
ANKRD54-212ENST00000609706 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.5■■□□□ 1.67
ANKRD54-212ENST00000609706 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.49■■□□□ 1.67
ANKRD54-212ENST00000609706 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.47■■□□□ 1.67
ANKRD54-212ENST00000609706 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
ANKRD54-212ENST00000609706 AGLP35573 1532 aa25.46■■□□□ 1.67
ANKRD54-212ENST00000609706 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.46■■□□□ 1.67
ANKRD54-212ENST00000609706 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.45■■□□□ 1.66
ANKRD54-212ENST00000609706 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.43■■□□□ 1.66
ANKRD54-212ENST00000609706 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
ANKRD54-212ENST00000609706 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
ANKRD54-212ENST00000609706 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.41■■□□□ 1.66
ANKRD54-212ENST00000609706 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.4■■□□□ 1.66
ANKRD54-212ENST00000609706 ATP7AQ04656 1500 aa25.4■■□□□ 1.66
ANKRD54-212ENST00000609706 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
ANKRD54-212ENST00000609706 NCOA2Q15596 1464 aa25.37■■□□□ 1.65
ANKRD54-212ENST00000609706 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.36■■□□□ 1.65
ANKRD54-212ENST00000609706 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
ANKRD54-212ENST00000609706 PLXNC1O60486 1568 aa25.35■■□□□ 1.65
ANKRD54-212ENST00000609706 MBD5Q9P267 1494 aa25.33■■□□□ 1.65
ANKRD54-212ENST00000609706 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.32■■□□□ 1.64
ANKRD54-212ENST00000609706 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
ANKRD54-212ENST00000609706 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.29■■□□□ 1.64
ANKRD54-212ENST00000609706 C3P01024 1663 aa25.29■■□□□ 1.64
ANKRD54-212ENST00000609706 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.28■■□□□ 1.64
ANKRD54-212ENST00000609706 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
ANKRD54-212ENST00000609706 A2MP01023 1474 aa25.28■■□□□ 1.64
ANKRD54-212ENST00000609706 HSPA2P54652 639 aa25.27■■□□□ 1.64
ANKRD54-212ENST00000609706 MAP3K1Q13233 1512 aa25.26■■□□□ 1.63
ANKRD54-212ENST00000609706 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.26■■□□□ 1.63
ANKRD54-212ENST00000609706 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.25■■□□□ 1.63
ANKRD54-212ENST00000609706 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.24■■□□□ 1.63
ANKRD54-212ENST00000609706 MROH2AA6NES4 1674 aa25.23■■□□□ 1.63
ANKRD54-212ENST00000609706 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
ANKRD54-212ENST00000609706 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.21■■□□□ 1.63
ANKRD54-212ENST00000609706 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.21■■□□□ 1.63
ANKRD54-212ENST00000609706 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
ANKRD54-212ENST00000609706 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54-212ENST00000609706 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
ANKRD54-212ENST00000609706 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
ANKRD54-212ENST00000609706 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
ANKRD54-212ENST00000609706 NPATQ14207 1427 aa25.12■■□□□ 1.61
ANKRD54-212ENST00000609706 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.11■■□□□ 1.61
ANKRD54-212ENST00000609706 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
ANKRD54-212ENST00000609706 ZMYM3Q14202 1370 aa25.08■■□□□ 1.61
ANKRD54-212ENST00000609706 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.08■■□□□ 1.61
ANKRD54-212ENST00000609706 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.07■■□□□ 1.6
ANKRD54-212ENST00000609706 MIA2Q96PC5 1412 aa25.07■■□□□ 1.6
ANKRD54-212ENST00000609706 STRCQ7RTU9 1775 aa25.07■■□□□ 1.6
ANKRD54-212ENST00000609706 GGT6Q6P531 493 aa25.06■■□□□ 1.6
ANKRD54-212ENST00000609706 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.04■■□□□ 1.6
ANKRD54-212ENST00000609706 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.03■■□□□ 1.6
ANKRD54-212ENST00000609706 PTPRKQ15262 1439 aa25.03■■□□□ 1.6
ANKRD54-212ENST00000609706 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
ANKRD54-212ENST00000609706 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.02■■□□□ 1.6
ANKRD54-212ENST00000609706 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.01■■□□□ 1.59
ANKRD54-212ENST00000609706 NCOA1Q15788 1441 aa24.98■■□□□ 1.59
ANKRD54-212ENST00000609706 TSPY4P0CV99 314 aa24.98■■□□□ 1.59
ANKRD54-212ENST00000609706 TSPY10P0CW01 314 aa24.98■■□□□ 1.59
ANKRD54-212ENST00000609706 KIF3BO15066 747 aa24.97■■□□□ 1.59
ANKRD54-212ENST00000609706 FBXO41Q8TF61 875 aa24.97■■□□□ 1.59
ANKRD54-212ENST00000609706 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
ANKRD54-212ENST00000609706 APLP2Q06481 763 aa24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms