RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609454.5

ANKRD54-211, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ANKRD54, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-211ENST00000609454 CEP162Q5TB80 1403 aa30.68■■■□□ 2.5
ANKRD54-211ENST00000609454 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.67■■■□□ 2.5
ANKRD54-211ENST00000609454 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa30.66■■■□□ 2.5
ANKRD54-211ENST00000609454 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.65■■■□□ 2.5
ANKRD54-211ENST00000609454 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.65■■■□□ 2.5
ANKRD54-211ENST00000609454 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.63■■■□□ 2.49
ANKRD54-211ENST00000609454 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa30.63■■■□□ 2.49
ANKRD54-211ENST00000609454 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.61■■■□□ 2.49
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
ANKRD54-211ENST00000609454 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.6■■■□□ 2.49
ANKRD54-211ENST00000609454 AFAP1Q8N556 730 aa30.59■■■□□ 2.49
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.58■■■□□ 2.49
ANKRD54-211ENST00000609454 MLECQ14165 292 aa30.57■■■□□ 2.48
ANKRD54-211ENST00000609454 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.54■■■□□ 2.48
ANKRD54-211ENST00000609454 PREX2Q70Z35 1606 aa30.53■■■□□ 2.48
ANKRD54-211ENST00000609454 ADAMTSL3P82987 1691 aa30.52■■■□□ 2.48
ANKRD54-211ENST00000609454 PTPRMP28827 1452 aa30.52■■■□□ 2.48
ANKRD54-211ENST00000609454 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.52■■■□□ 2.48
ANKRD54-211ENST00000609454 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.52■■■□□ 2.48
ANKRD54-211ENST00000609454 ATP10AO60312 1499 aa30.51■■■□□ 2.48
ANKRD54-211ENST00000609454 PLPPR3Q6T4P5 718 aa30.51■■■□□ 2.47
ANKRD54-211ENST00000609454 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
ANKRD54-211ENST00000609454 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.47■■■□□ 2.47
ANKRD54-211ENST00000609454 MADDQ8WXG6 1647 aa30.46■■■□□ 2.47
ANKRD54-211ENST00000609454 HECW2Q9P2P5 1572 aa30.45■■■□□ 2.47
ANKRD54-211ENST00000609454 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
ANKRD54-211ENST00000609454 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.44■■■□□ 2.46
ANKRD54-211ENST00000609454 ABCC1P33527 1531 aa30.43■■■□□ 2.46
ANKRD54-211ENST00000609454 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.42■■■□□ 2.46
ANKRD54-211ENST00000609454 KDM5CP41229 1560 aa30.41■■■□□ 2.46
ANKRD54-211ENST00000609454 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.4■■■□□ 2.46
ANKRD54-211ENST00000609454 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.45
ANKRD54-211ENST00000609454 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.38■■■□□ 2.45
ANKRD54-211ENST00000609454 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.38■■■□□ 2.45
ANKRD54-211ENST00000609454 MLH3Q9UHC1 1453 aa30.38■■■□□ 2.45
ANKRD54-211ENST00000609454 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.36■■■□□ 2.45
ANKRD54-211ENST00000609454 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
ANKRD54-211ENST00000609454 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.35■■■□□ 2.45
ANKRD54-211ENST00000609454 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
ANKRD54-211ENST00000609454 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.33■■■□□ 2.45
ANKRD54-211ENST00000609454 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.32■■■□□ 2.45
ANKRD54-211ENST00000609454 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.32■■■□□ 2.44
ANKRD54-211ENST00000609454 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.32■■■□□ 2.44
ANKRD54-211ENST00000609454 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa30.3■■■□□ 2.44
ANKRD54-211ENST00000609454 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.29■■■□□ 2.44
ANKRD54-211ENST00000609454 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa30.26■■■□□ 2.43
ANKRD54-211ENST00000609454 ABCA6Q8N139 1617 aa30.25■■■□□ 2.43
ANKRD54-211ENST00000609454 APLP2Q06481 763 aa30.25■■■□□ 2.43
ANKRD54-211ENST00000609454 TIAM1Q13009 1591 aa30.24■■■□□ 2.43
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
ANKRD54-211ENST00000609454 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
ANKRD54-211ENST00000609454 REREQ9P2R6 1566 aa30.21■■■□□ 2.43
ANKRD54-211ENST00000609454 NCOA2Q15596 1464 aa30.21■■■□□ 2.43
ANKRD54-211ENST00000609454 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa30.19■■■□□ 2.42
ANKRD54-211ENST00000609454 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
ANKRD54-211ENST00000609454 AGLP35573 1532 aa30.16■■■□□ 2.42
ANKRD54-211ENST00000609454 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.15■■■□□ 2.42
ANKRD54-211ENST00000609454 ATP7AQ04656 1500 aa30.15■■■□□ 2.42
ANKRD54-211ENST00000609454 LMTK3Q96Q04 1460 aa30.12■■■□□ 2.41
ANKRD54-211ENST00000609454 HSPA2P54652 639 aa30.11■■■□□ 2.41
ANKRD54-211ENST00000609454 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.11■■■□□ 2.41
ANKRD54-211ENST00000609454 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
ANKRD54-211ENST00000609454 A2MP01023 1474 aa30.08■■■□□ 2.41
ANKRD54-211ENST00000609454 MAP3K1Q13233 1512 aa30.07■■■□□ 2.4
ANKRD54-211ENST00000609454 MBD5Q9P267 1494 aa30.07■■■□□ 2.4
ANKRD54-211ENST00000609454 TSPY4P0CV99 314 aa30.07■■■□□ 2.4
ANKRD54-211ENST00000609454 TSPY10P0CW01 314 aa30.07■■■□□ 2.4
ANKRD54-211ENST00000609454 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.06■■■□□ 2.4
ANKRD54-211ENST00000609454 GGT6Q6P531 493 aa30.06■■■□□ 2.4
ANKRD54-211ENST00000609454 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
ANKRD54-211ENST00000609454 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.05■■■□□ 2.4
ANKRD54-211ENST00000609454 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.03■■■□□ 2.4
ANKRD54-211ENST00000609454 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.03■■■□□ 2.4
ANKRD54-211ENST00000609454 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.99■■■□□ 2.39
ANKRD54-211ENST00000609454 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.96■■■□□ 2.39
ANKRD54-211ENST00000609454 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
ANKRD54-211ENST00000609454 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.95■■■□□ 2.38
ANKRD54-211ENST00000609454 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.94■■■□□ 2.38
ANKRD54-211ENST00000609454 ZMYM3Q14202 1370 aa29.93■■■□□ 2.38
ANKRD54-211ENST00000609454 KIF3BO15066 747 aa29.93■■■□□ 2.38
ANKRD54-211ENST00000609454 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.93■■■□□ 2.38
ANKRD54-211ENST00000609454 PLXNC1O60486 1568 aa29.93■■■□□ 2.38
ANKRD54-211ENST00000609454 C3P01024 1663 aa29.92■■■□□ 2.38
ANKRD54-211ENST00000609454 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
ANKRD54-211ENST00000609454 MIA2Q96PC5 1412 aa29.91■■■□□ 2.38
ANKRD54-211ENST00000609454 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.89■■■□□ 2.38
ANKRD54-211ENST00000609454 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
ANKRD54-211ENST00000609454 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.85■■■□□ 2.37
ANKRD54-211ENST00000609454 MROH2AA6NES4 1674 aa29.83■■■□□ 2.37
ANKRD54-211ENST00000609454 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
ANKRD54-211ENST00000609454 NPATQ14207 1427 aa29.81■■■□□ 2.36
ANKRD54-211ENST00000609454 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.8■■■□□ 2.36
ANKRD54-211ENST00000609454 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.72■■■□□ 2.35
ANKRD54-211ENST00000609454 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.71■■■□□ 2.35
ANKRD54-211ENST00000609454 PTPRKQ15262 1439 aa29.71■■■□□ 2.35
ANKRD54-211ENST00000609454 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.71■■■□□ 2.35
ANKRD54-211ENST00000609454 FBXO41Q8TF61 875 aa29.7■■■□□ 2.35
ANKRD54-211ENST00000609454 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.68■■■□□ 2.34
ANKRD54-211ENST00000609454 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.68■■■□□ 2.34
ANKRD54-211ENST00000609454 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms