RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608306.5

LINC00635-217, long intergenic non-protein coding RNA 635, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00635, Length 873 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00635-217ENST00000608306 PLEKHD1A6NEE1 506 aa13.99□□□□□ -0.17
LINC00635-217ENST00000608306 KIF21BO75037 1637 aa13.99□□□□□ -0.17
LINC00635-217ENST00000608306 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa13.99□□□□□ -0.17
LINC00635-217ENST00000608306 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa13.98□□□□□ -0.17
LINC00635-217ENST00000608306 CFAP43Q8NDM7 1665 aa13.96□□□□□ -0.17
LINC00635-217ENST00000608306 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
LINC00635-217ENST00000608306 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
LINC00635-217ENST00000608306 EFCAB5A4FU69 1503 aa13.93□□□□□ -0.18
LINC00635-217ENST00000608306 RAPGEF3O95398 923 aa13.92□□□□□ -0.18
LINC00635-217ENST00000608306 ADGRL1O94910 1474 aa13.92□□□□□ -0.18
LINC00635-217ENST00000608306 ABCA9Q8IUA7 1624 aa13.89□□□□□ -0.19
LINC00635-217ENST00000608306 PHLDB1Q86UU1 1377 aa13.88□□□□□ -0.19
LINC00635-217ENST00000608306 ARAP3Q8WWN8 1544 aa13.87□□□□□ -0.19
LINC00635-217ENST00000608306 FMN1Q68DA7 1419 aa13.87□□□□□ -0.19
LINC00635-217ENST00000608306 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa13.87□□□□□ -0.19
LINC00635-217ENST00000608306 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
LINC00635-217ENST00000608306 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
LINC00635-217ENST00000608306 NEO1Q92859 1461 aa13.85□□□□□ -0.19
LINC00635-217ENST00000608306 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
LINC00635-217ENST00000608306 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
LINC00635-217ENST00000608306 AKNAQ7Z591 1439 aa13.81□□□□□ -0.2
LINC00635-217ENST00000608306 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP13.81□□□□□ -0.2
LINC00635-217ENST00000608306 FANCAO15360 1455 aa13.8□□□□□ -0.2
LINC00635-217ENST00000608306 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
LINC00635-217ENST00000608306 HECW1Q76N89 1606 aa13.79□□□□□ -0.2
LINC00635-217ENST00000608306 TTC37Q6PGP7 1564 aa13.78□□□□□ -0.2
LINC00635-217ENST00000608306 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa13.77□□□□□ -0.21
LINC00635-217ENST00000608306 PLCH2O75038 1416 aa13.75□□□□□ -0.21
LINC00635-217ENST00000608306 SCAPERQ9BY12 1400 aa13.75□□□□□ -0.21
LINC00635-217ENST00000608306 MYT1LQ9UL68 1186 aa13.75□□□□□ -0.21
LINC00635-217ENST00000608306 CLIP1P30622 1438 aa13.74□□□□□ -0.21
LINC00635-217ENST00000608306 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
LINC00635-217ENST00000608306 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa13.73□□□□□ -0.21
LINC00635-217ENST00000608306 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
LINC00635-217ENST00000608306 MLECQ14165 292 aa13.72□□□□□ -0.21
LINC00635-217ENST00000608306 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa13.72□□□□□ -0.21
LINC00635-217ENST00000608306 CFAP74Q9C0B2 1584 aa13.71□□□□□ -0.21
LINC00635-217ENST00000608306 KIF14Q15058 1648 aa13.69□□□□□ -0.22
LINC00635-217ENST00000608306 AFAP1Q8N556 730 aa13.69□□□□□ -0.22
LINC00635-217ENST00000608306 YEATS2Q9ULM3 1422 aa13.69□□□□□ -0.22
LINC00635-217ENST00000608306 ARHGAP5Q13017 1502 aa13.69□□□□□ -0.22
LINC00635-217ENST00000608306 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
LINC00635-217ENST00000608306 CCDC18Q5T9S5 1454 aa13.67□□□□□ -0.22
LINC00635-217ENST00000608306 RICTORQ6R327 1708 aa13.67□□□□□ -0.22
LINC00635-217ENST00000608306 POGZQ7Z3K3 1410 aa13.67□□□□□ -0.22
LINC00635-217ENST00000608306 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
LINC00635-217ENST00000608306 PTPRMP28827 1452 aa13.67□□□□□ -0.22
LINC00635-217ENST00000608306 HECW2Q9P2P5 1572 aa13.66□□□□□ -0.22
LINC00635-217ENST00000608306 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa13.66□□□□□ -0.22
LINC00635-217ENST00000608306 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa13.65□□□□□ -0.22
LINC00635-217ENST00000608306 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa13.65□□□□□ -0.22
LINC00635-217ENST00000608306 MYO5CQ9NQX4 1742 aa13.65□□□□□ -0.22
LINC00635-217ENST00000608306 MAGI2Q86UL8 1455 aa13.65□□□□□ -0.22
LINC00635-217ENST00000608306 ADAMTSL3P82987 1691 aa13.64□□□□□ -0.23
LINC00635-217ENST00000608306 FYCO1Q9BQS8 1478 aa13.64□□□□□ -0.23
LINC00635-217ENST00000608306 LMTK3Q96Q04 1460 aa13.63□□□□□ -0.23
LINC00635-217ENST00000608306 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa13.63□□□□□ -0.23
LINC00635-217ENST00000608306 SOCS7O14512 581 aa13.63□□□□□ -0.23
LINC00635-217ENST00000608306 FBXO41Q8TF61 875 aa13.63□□□□□ -0.23
LINC00635-217ENST00000608306 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa13.63□□□□□ -0.23
LINC00635-217ENST00000608306 BCORL1Q5H9F3 1711 aa13.62□□□□□ -0.23
LINC00635-217ENST00000608306 AKT1S1Q96B36 256 aa13.62□□□□□ -0.23
LINC00635-217ENST00000608306 ATP10AO60312 1499 aa13.61□□□□□ -0.23
LINC00635-217ENST00000608306 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa13.61□□□□□ -0.23
LINC00635-217ENST00000608306 MADDQ8WXG6 1647 aa13.61□□□□□ -0.23
LINC00635-217ENST00000608306 MTUS2Q5JR59 1369 aa13.6□□□□□ -0.23
LINC00635-217ENST00000608306 CEP162Q5TB80 1403 aa13.59□□□□□ -0.23
LINC00635-217ENST00000608306 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP13.59□□□□□ -0.23
LINC00635-217ENST00000608306 ILDR2Q71H61 639 aa13.59□□□□□ -0.23
LINC00635-217ENST00000608306 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
LINC00635-217ENST00000608306 C9orf84Q5VXU9 1444 aa13.58□□□□□ -0.24
LINC00635-217ENST00000608306 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa13.58□□□□□ -0.24
LINC00635-217ENST00000608306 CCNB3Q8WWL7 1395 aa13.58□□□□□ -0.24
LINC00635-217ENST00000608306 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
LINC00635-217ENST00000608306 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa13.57□□□□□ -0.24
LINC00635-217ENST00000608306 SPDYE2BA6NHP3 402 aa13.57□□□□□ -0.24
LINC00635-217ENST00000608306 SPDYE6P0CI01 402 aa13.57□□□□□ -0.24
LINC00635-217ENST00000608306 SPDYE2Q495Y8 402 aa13.57□□□□□ -0.24
LINC00635-217ENST00000608306 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa13.56□□□□□ -0.24
LINC00635-217ENST00000608306 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
LINC00635-217ENST00000608306 HSPA2P54652 639 aa13.56□□□□□ -0.24
LINC00635-217ENST00000608306 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
LINC00635-217ENST00000608306 PREX2Q70Z35 1606 aa13.55□□□□□ -0.24
LINC00635-217ENST00000608306 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa13.55□□□□□ -0.24
LINC00635-217ENST00000608306 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
LINC00635-217ENST00000608306 KDM5CP41229 1560 aa13.54□□□□□ -0.24
LINC00635-217ENST00000608306 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
LINC00635-217ENST00000608306 ABCC1P33527 1531 aa13.53□□□□□ -0.24
LINC00635-217ENST00000608306 MLH3Q9UHC1 1453 aa13.52□□□□□ -0.25
LINC00635-217ENST00000608306 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa13.52□□□□□ -0.25
LINC00635-217ENST00000608306 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
LINC00635-217ENST00000608306 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa13.49□□□□□ -0.25
LINC00635-217ENST00000608306 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa13.49□□□□□ -0.25
LINC00635-217ENST00000608306 SYCP2Q9BX26 1530 aa13.49□□□□□ -0.25
LINC00635-217ENST00000608306 ITSN2Q9NZM3 1697 aa13.48□□□□□ -0.25
LINC00635-217ENST00000608306 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa13.48□□□□□ -0.25
LINC00635-217ENST00000608306 ABCA6Q8N139 1617 aa13.47□□□□□ -0.25
LINC00635-217ENST00000608306 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa13.47□□□□□ -0.25
LINC00635-217ENST00000608306 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa13.47□□□□□ -0.25
LINC00635-217ENST00000608306 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms