RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602733.5

TCP11L1-211, Transcript of t-complex 11 like 1, humanhuman

TSL 4

Gene TCP11L1, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L1-211ENST00000602733 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.11■■■■■ 4.01
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TCP11L1-211ENST00000602733 LMTK3Q96Q04 1460 aa40.04■■■■■ 4
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TCP11L1-211ENST00000602733 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.03■■■■■ 4
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TCP11L1-211ENST00000602733 PLPPR3Q6T4P5 718 aa39.94■■■■□ 3.98
TCP11L1-211ENST00000602733 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.94■■■■□ 3.98
TCP11L1-211ENST00000602733 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa39.93■■■■□ 3.98
TCP11L1-211ENST00000602733 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.91■■■■□ 3.98
TCP11L1-211ENST00000602733 ATP10AO60312 1499 aa39.88■■■■□ 3.97
TCP11L1-211ENST00000602733 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.87■■■■□ 3.97
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TCP11L1-211ENST00000602733 AFAP1Q8N556 730 aa39.83■■■■□ 3.97
TCP11L1-211ENST00000602733 C9orf84Q5VXU9 1444 aa39.82■■■■□ 3.97
TCP11L1-211ENST00000602733 CLIP1P30622 1438 aa39.82■■■■□ 3.96
TCP11L1-211ENST00000602733 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa39.81■■■■□ 3.96
TCP11L1-211ENST00000602733 KDM5CP41229 1560 aa39.81■■■■□ 3.96
TCP11L1-211ENST00000602733 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.79■■■■□ 3.96
TCP11L1-211ENST00000602733 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa39.78■■■■□ 3.96
TCP11L1-211ENST00000602733 PREX2Q70Z35 1606 aa39.75■■■■□ 3.95
TCP11L1-211ENST00000602733 FBXO41Q8TF61 875 aa39.73■■■■□ 3.95
TCP11L1-211ENST00000602733 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa39.72■■■■□ 3.95
TCP11L1-211ENST00000602733 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.7■■■■□ 3.95
TCP11L1-211ENST00000602733 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.69■■■■□ 3.94
TCP11L1-211ENST00000602733 ABCA6Q8N139 1617 aa39.69■■■■□ 3.94
TCP11L1-211ENST00000602733 ITSN2Q9NZM3 1697 aa39.67■■■■□ 3.94
TCP11L1-211ENST00000602733 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa39.67■■■■□ 3.94
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TCP11L1-211ENST00000602733 ABCC1P33527 1531 aa39.66■■■■□ 3.94
TCP11L1-211ENST00000602733 MLH3Q9UHC1 1453 aa39.62■■■■□ 3.93
TCP11L1-211ENST00000602733 MYT1LQ9UL68 1186 aa39.6■■■■□ 3.93
TCP11L1-211ENST00000602733 REREQ9P2R6 1566 aa39.59■■■■□ 3.93
TCP11L1-211ENST00000602733 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.59■■■■□ 3.93
TCP11L1-211ENST00000602733 PREX1Q8TCU6 1659 aa39.59■■■■□ 3.93
TCP11L1-211ENST00000602733 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.57■■■■□ 3.93
TCP11L1-211ENST00000602733 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa39.5■■■■□ 3.91
TCP11L1-211ENST00000602733 C3P01024 1663 aa39.48■■■■□ 3.91
TCP11L1-211ENST00000602733 AGLP35573 1532 aa39.47■■■■□ 3.91
TCP11L1-211ENST00000602733 STRCQ7RTU9 1775 aa39.46■■■■□ 3.91
TCP11L1-211ENST00000602733 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP39.45■■■■□ 3.91
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TCP11L1-211ENST00000602733 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP39.42■■■■□ 3.9
TCP11L1-211ENST00000602733 SYCP2Q9BX26 1530 aa39.4■■■■□ 3.9
TCP11L1-211ENST00000602733 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP39.36■■■■□ 3.89
TCP11L1-211ENST00000602733 CERKQ8TCT0 537 aa39.33■■■■□ 3.89
TCP11L1-211ENST00000602733 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa39.32■■■■□ 3.89
TCP11L1-211ENST00000602733 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP39.3■■■■□ 3.88
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TCP11L1-211ENST00000602733 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP39.23■■■■□ 3.87
TCP11L1-211ENST00000602733 ATP7AQ04656 1500 aa39.23■■■■□ 3.87
TCP11L1-211ENST00000602733 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa39.23■■■■□ 3.87
TCP11L1-211ENST00000602733 CCNB3Q8WWL7 1395 aa39.22■■■■□ 3.87
TCP11L1-211ENST00000602733 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP39.2■■■■□ 3.87
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TCP11L1-211ENST00000602733 TIAM1Q13009 1591 aa39.18■■■■□ 3.86
TCP11L1-211ENST00000602733 CNTLNQ9NXG0 1405 aa39.17■■■■□ 3.86
TCP11L1-211ENST00000602733 MROH2AA6NES4 1674 aa39.17■■■■□ 3.86
TCP11L1-211ENST00000602733 PLXNC1O60486 1568 aa39.16■■■■□ 3.86
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TCP11L1-211ENST00000602733 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa39.15■■■■□ 3.86
TCP11L1-211ENST00000602733 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP39.13■■■■□ 3.86
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TCP11L1-211ENST00000602733 CEP162Q5TB80 1403 aa39.07■■■■□ 3.85
TCP11L1-211ENST00000602733 MBD5Q9P267 1494 aa39.07■■■■□ 3.85
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TCP11L1-211ENST00000602733 NPATQ14207 1427 aa39.03■■■■□ 3.84
TCP11L1-211ENST00000602733 NCOA1Q15788 1441 aa39.03■■■■□ 3.84
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TCP11L1-211ENST00000602733 NCOA2Q15596 1464 aa38.9■■■■□ 3.82
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TCP11L1-211ENST00000602733 CCDC141Q6ZP82 1450 aa38.79■■■■□ 3.8
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TCP11L1-211ENST00000602733 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP38.73■■■■□ 3.79
TCP11L1-211ENST00000602733 KIF3BO15066 747 aa38.72■■■■□ 3.79
TCP11L1-211ENST00000602733 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP38.7■■■■□ 3.79
TCP11L1-211ENST00000602733 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP38.69■■■■□ 3.78
TCP11L1-211ENST00000602733 ARHGEF5Q12774 1597 aa38.69■■■■□ 3.78
TCP11L1-211ENST00000602733 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP38.68■■■■□ 3.78
TCP11L1-211ENST00000602733 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa38.66■■■■□ 3.78
TCP11L1-211ENST00000602733 VPS8Q8N3P4 1428 aa38.66■■■■□ 3.78
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