RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602492.5

PPFIA3-204, Transcript of PTPRF interacting protein alpha 3, human

TSL 4

Gene PPFIA3, Length 740 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPFIA3-204	ENST00000602492	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	33.29	■■■□□ 2.92
PPFIA3-204	ENST00000602492	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	33.27	■■■□□ 2.92
PPFIA3-204	ENST00000602492	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		33.27	■■■□□ 2.92
PPFIA3-204	ENST00000602492	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		33.25	■■■□□ 2.91
PPFIA3-204	ENST00000602492	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	33.23	■■■□□ 2.91
PPFIA3-204	ENST00000602492	KIF14	Q15058	1648 aa		33.23	■■■□□ 2.91
PPFIA3-204	ENST00000602492	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		33.22	■■■□□ 2.91
PPFIA3-204	ENST00000602492	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PPFIA3-204	ENST00000602492	CLIP1	P30622	1438 aa		33.2	■■■□□ 2.91
PPFIA3-204	ENST00000602492	MLEC	Q14165	292 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PPFIA3-204	ENST00000602492	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PPFIA3-204	ENST00000602492	ATP10A	O60312	1499 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PPFIA3-204	ENST00000602492	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PPFIA3-204	ENST00000602492	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PPFIA3-204	ENST00000602492	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PPFIA3-204	ENST00000602492	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PPFIA3-204	ENST00000602492	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PPFIA3-204	ENST00000602492	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PPFIA3-204	ENST00000602492	FBXO41	Q8TF61	875 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PPFIA3-204	ENST00000602492	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PPFIA3-204	ENST00000602492	HSPA2	P54652	639 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PPFIA3-204	ENST00000602492	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PPFIA3-204	ENST00000602492	AFAP1	Q8N556	730 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PPFIA3-204	ENST00000602492	KDM5C	P41229	1560 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PPFIA3-204	ENST00000602492	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		33.01	■■■□□ 2.87
PPFIA3-204	ENST00000602492	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PPFIA3-204	ENST00000602492	PREX2	Q70Z35	1606 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PPFIA3-204	ENST00000602492	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		32.93	■■■□□ 2.86
PPFIA3-204	ENST00000602492	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		32.93	■■■□□ 2.86
PPFIA3-204	ENST00000602492	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PPFIA3-204	ENST00000602492	ABCC1	P33527	1531 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PPFIA3-204	ENST00000602492	RERE	Q9P2R6	1566 aa		32.9	■■■□□ 2.86
PPFIA3-204	ENST00000602492	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PPFIA3-204	ENST00000602492	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	32.88	■■■□□ 2.85
PPFIA3-204	ENST00000602492	ABCA6	Q8N139	1617 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PPFIA3-204	ENST00000602492	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		32.86	■■■□□ 2.85
PPFIA3-204	ENST00000602492	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		32.85	■■■□□ 2.85
PPFIA3-204	ENST00000602492	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PPFIA3-204	ENST00000602492	AGL	P35573	1532 aa		32.8	■■■□□ 2.84
PPFIA3-204	ENST00000602492	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
PPFIA3-204	ENST00000602492	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
PPFIA3-204	ENST00000602492	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		32.76	■■■□□ 2.83
PPFIA3-204	ENST00000602492	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		32.75	■■■□□ 2.83
PPFIA3-204	ENST00000602492	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
PPFIA3-204	ENST00000602492	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
PPFIA3-204	ENST00000602492	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		32.72	■■■□□ 2.83
PPFIA3-204	ENST00000602492	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		32.7	■■■□□ 2.83
PPFIA3-204	ENST00000602492	CERK	Q8TCT0	537 aa		32.69	■■■□□ 2.82
PPFIA3-204	ENST00000602492	C3	P01024	1663 aa		32.68	■■■□□ 2.82
PPFIA3-204	ENST00000602492	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
PPFIA3-204	ENST00000602492	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PPFIA3-204	ENST00000602492	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PPFIA3-204	ENST00000602492	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	32.65	■■■□□ 2.82
PPFIA3-204	ENST00000602492	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
PPFIA3-204	ENST00000602492	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PPFIA3-204	ENST00000602492	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PPFIA3-204	ENST00000602492	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		32.64	■■■□□ 2.82
PPFIA3-204	ENST00000602492	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		32.63	■■■□□ 2.81
PPFIA3-204	ENST00000602492	STRC	Q7RTU9	1775 aa		32.6	■■■□□ 2.81
PPFIA3-204	ENST00000602492	ATP7A	Q04656	1500 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PPFIA3-204	ENST00000602492	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
PPFIA3-204	ENST00000602492	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
PPFIA3-204	ENST00000602492	MROH2A	A6NES4	1674 aa		32.51	■■■□□ 2.79
PPFIA3-204	ENST00000602492	A2M	P01023	1474 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PPFIA3-204	ENST00000602492	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PPFIA3-204	ENST00000602492	PTPRT	O14522	1441 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PPFIA3-204	ENST00000602492	NPAT	Q14207	1427 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PPFIA3-204	ENST00000602492	PLXNC1	O60486	1568 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PPFIA3-204	ENST00000602492	ZMYM3	Q14202	1370 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PPFIA3-204	ENST00000602492	TIAM1	Q13009	1591 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PPFIA3-204	ENST00000602492	CEP162	Q5TB80	1403 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PPFIA3-204	ENST00000602492	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
PPFIA3-204	ENST00000602492	NCOA1	Q15788	1441 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PPFIA3-204	ENST00000602492	GGT6	Q6P531	493 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PPFIA3-204	ENST00000602492	MBD5	Q9P267	1494 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PPFIA3-204	ENST00000602492	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
PPFIA3-204	ENST00000602492	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.39	■■■□□ 2.78
PPFIA3-204	ENST00000602492	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PPFIA3-204	ENST00000602492	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PPFIA3-204	ENST00000602492	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PPFIA3-204	ENST00000602492	PTPRK	Q15262	1439 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PPFIA3-204	ENST00000602492	NCOA2	Q15596	1464 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PPFIA3-204	ENST00000602492	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PPFIA3-204	ENST00000602492	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PPFIA3-204	ENST00000602492	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
PPFIA3-204	ENST00000602492	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PPFIA3-204	ENST00000602492	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
PPFIA3-204	ENST00000602492	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PPFIA3-204	ENST00000602492	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PPFIA3-204	ENST00000602492	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
PPFIA3-204	ENST00000602492	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PPFIA3-204	ENST00000602492	PLA2R1	Q13018	1463 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PPFIA3-204	ENST00000602492	PKD2	Q13563	968 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PPFIA3-204	ENST00000602492	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PPFIA3-204	ENST00000602492	KIF3B	O15066	747 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PPFIA3-204	ENST00000602492	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
PPFIA3-204	ENST00000602492	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PPFIA3-204	ENST00000602492	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PPFIA3-204	ENST00000602492	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PPFIA3-204	ENST00000602492	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		32.12	■■■□□ 2.73

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