RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602164.5

USF2-215, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, human

TSL 3

Gene USF2, Length 582 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USF2-215	ENST00000602164	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	42.59	■■■■■ 4.41
USF2-215	ENST00000602164	RAPGEF3	O95398	923 aa		42.58	■■■■■ 4.41
USF2-215	ENST00000602164	ADGRL1	O94910	1474 aa		42.57	■■■■■ 4.41
USF2-215	ENST00000602164	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		42.57	■■■■■ 4.41
USF2-215	ENST00000602164	MAP3K1	Q13233	1512 aa		42.56	■■■■■ 4.4
USF2-215	ENST00000602164	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	42.53	■■■■■ 4.4
USF2-215	ENST00000602164	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		42.5	■■■■■ 4.39
USF2-215	ENST00000602164	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		42.47	■■■■■ 4.39
USF2-215	ENST00000602164	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		42.47	■■■■■ 4.39
USF2-215	ENST00000602164	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		42.46	■■■■■ 4.39
USF2-215	ENST00000602164	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	42.43	■■■■■ 4.38
USF2-215	ENST00000602164	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		42.42	■■■■■ 4.38
USF2-215	ENST00000602164	ABCC1	P33527	1531 aa		42.42	■■■■■ 4.38
USF2-215	ENST00000602164	NCOA2	Q15596	1464 aa		42.4	■■■■■ 4.38
USF2-215	ENST00000602164	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		42.37	■■■■■ 4.37
USF2-215	ENST00000602164	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		42.37	■■■■■ 4.37
USF2-215	ENST00000602164	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		42.36	■■■■■ 4.37
USF2-215	ENST00000602164	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	42.35	■■■■■ 4.37
USF2-215	ENST00000602164	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		42.35	■■■■■ 4.37
USF2-215	ENST00000602164	KDM5C	P41229	1560 aa		42.32	■■■■■ 4.37
USF2-215	ENST00000602164	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		42.32	■■■■■ 4.37
USF2-215	ENST00000602164	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		42.3	■■■■■ 4.36
USF2-215	ENST00000602164	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	42.27	■■■■■ 4.36
USF2-215	ENST00000602164	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		42.26	■■■■■ 4.36
USF2-215	ENST00000602164	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		42.26	■■■■■ 4.36
USF2-215	ENST00000602164	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		42.26	■■■■■ 4.36
USF2-215	ENST00000602164	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		42.24	■■■■■ 4.35
USF2-215	ENST00000602164	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		42.24	■■■■■ 4.35
USF2-215	ENST00000602164	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	42.22	■■■■■ 4.35
USF2-215	ENST00000602164	AFAP1	Q8N556	730 aa		42.21	■■■■■ 4.35
USF2-215	ENST00000602164	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		42.2	■■■■■ 4.35
USF2-215	ENST00000602164	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		42.2	■■■■■ 4.35
USF2-215	ENST00000602164	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		42.17	■■■■■ 4.34
USF2-215	ENST00000602164	APLP2	Q06481	763 aa		42.16	■■■■■ 4.34
USF2-215	ENST00000602164	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		42.13	■■■■■ 4.34
USF2-215	ENST00000602164	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	42.12	■■■■■ 4.33
USF2-215	ENST00000602164	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		42.1	■■■■■ 4.33
USF2-215	ENST00000602164	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	42.08	■■■■■ 4.33
USF2-215	ENST00000602164	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.07	■■■■■ 4.33
USF2-215	ENST00000602164	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		42.06	■■■■■ 4.32
USF2-215	ENST00000602164	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		42.06	■■■■■ 4.32
USF2-215	ENST00000602164	ABCA6	Q8N139	1617 aa		42.05	■■■■■ 4.32
USF2-215	ENST00000602164	ATP10A	O60312	1499 aa		42.04	■■■■■ 4.32
USF2-215	ENST00000602164	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		42.04	■■■■■ 4.32
USF2-215	ENST00000602164	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		42.04	■■■■■ 4.32
USF2-215	ENST00000602164	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		42.01	■■■■■ 4.32
USF2-215	ENST00000602164	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		41.99	■■■■■ 4.31
USF2-215	ENST00000602164	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	41.98	■■■■■ 4.31
USF2-215	ENST00000602164	MIA2	Q96PC5	1412 aa		41.97	■■■■■ 4.31
USF2-215	ENST00000602164	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	41.97	■■■■■ 4.31
USF2-215	ENST00000602164	RERE	Q9P2R6	1566 aa		41.97	■■■■■ 4.31
USF2-215	ENST00000602164	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		41.96	■■■■■ 4.31
USF2-215	ENST00000602164	ATP7A	Q04656	1500 aa		41.93	■■■■■ 4.3
USF2-215	ENST00000602164	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	41.92	■■■■■ 4.3
USF2-215	ENST00000602164	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		41.9	■■■■■ 4.3
USF2-215	ENST00000602164	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	41.9	■■■■■ 4.3
USF2-215	ENST00000602164	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		41.89	■■■■■ 4.3
USF2-215	ENST00000602164	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		41.88	■■■■■ 4.29
USF2-215	ENST00000602164	MADD	Q8WXG6	1647 aa		41.82	■■■■■ 4.29
USF2-215	ENST00000602164	AGL	P35573	1532 aa		41.8	■■■■■ 4.28
USF2-215	ENST00000602164	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		41.8	■■■■■ 4.28
USF2-215	ENST00000602164	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		41.8	■■■■■ 4.28
USF2-215	ENST00000602164	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		41.79	■■■■■ 4.28
USF2-215	ENST00000602164	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		41.77	■■■■■ 4.28
USF2-215	ENST00000602164	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	41.76	■■■■■ 4.28
USF2-215	ENST00000602164	PLXNC1	O60486	1568 aa		41.75	■■■■■ 4.27
USF2-215	ENST00000602164	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		41.71	■■■■■ 4.27
USF2-215	ENST00000602164	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		41.69	■■■■■ 4.26
USF2-215	ENST00000602164	A2M	P01023	1474 aa		41.68	■■■■■ 4.26
USF2-215	ENST00000602164	PTPRM	P28827	1452 aa		41.68	■■■■■ 4.26
USF2-215	ENST00000602164	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	41.67	■■■■■ 4.26
USF2-215	ENST00000602164	MLEC	Q14165	292 aa		41.66	■■■■■ 4.26
USF2-215	ENST00000602164	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		41.65	■■■■■ 4.26
USF2-215	ENST00000602164	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		41.61	■■■■■ 4.25
USF2-215	ENST00000602164	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	41.6	■■■■■ 4.25
USF2-215	ENST00000602164	ABCC5	O15440	1437 aa		41.59	■■■■■ 4.25
USF2-215	ENST00000602164	TSPY4	P0CV99	314 aa		41.58	■■■■■ 4.25
USF2-215	ENST00000602164	TSPY10	P0CW01	314 aa		41.58	■■■■■ 4.25
USF2-215	ENST00000602164	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		41.57	■■■■■ 4.25
USF2-215	ENST00000602164	DAPK1	P53355	1430 aa		41.54	■■■■■ 4.24
USF2-215	ENST00000602164	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	41.54	■■■■■ 4.24
USF2-215	ENST00000602164	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	41.54	■■■■■ 4.24
USF2-215	ENST00000602164	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	41.38	■■■■■ 4.21
USF2-215	ENST00000602164	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		41.35	■■■■■ 4.21
USF2-215	ENST00000602164	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		41.34	■■■■■ 4.21
USF2-215	ENST00000602164	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	41.32	■■■■■ 4.2
USF2-215	ENST00000602164	MROH2A	A6NES4	1674 aa		41.31	■■■■■ 4.2
USF2-215	ENST00000602164	ADGRL2	O95490	1459 aa		41.31	■■■■■ 4.2
USF2-215	ENST00000602164	C3	P01024	1663 aa		41.31	■■■■■ 4.2
USF2-215	ENST00000602164	KIF15	Q9NS87	1388 aa		41.31	■■■■■ 4.2
USF2-215	ENST00000602164	KIF3B	O15066	747 aa		41.29	■■■■■ 4.2
USF2-215	ENST00000602164	GGT6	Q6P531	493 aa		41.29	■■■■■ 4.2
USF2-215	ENST00000602164	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	41.28	■■■■■ 4.2
USF2-215	ENST00000602164	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	41.28	■■■■■ 4.2
USF2-215	ENST00000602164	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	41.27	■■■■■ 4.2
USF2-215	ENST00000602164	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	41.26	■■■■■ 4.2
USF2-215	ENST00000602164	PTPRK	Q15262	1439 aa		41.26	■■■■■ 4.19
USF2-215	ENST00000602164	NCOA1	Q15788	1441 aa		41.26	■■■■■ 4.19
USF2-215	ENST00000602164	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		41.25	■■■■■ 4.19
USF2-215	ENST00000602164	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	41.25	■■■■■ 4.19

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