RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601261.5

GTPBP3-225, Transcript of GTP binding protein 3, mitochondrial, human

TSL 4

Gene GTPBP3, Length 606 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP3-225	ENST00000601261	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		29.39	■■■□□ 2.3
GTPBP3-225	ENST00000601261	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		29.38	■■■□□ 2.29
GTPBP3-225	ENST00000601261	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		29.37	■■■□□ 2.29
GTPBP3-225	ENST00000601261	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		29.36	■■■□□ 2.29
GTPBP3-225	ENST00000601261	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		29.36	■■■□□ 2.29
GTPBP3-225	ENST00000601261	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		29.36	■■■□□ 2.29
GTPBP3-225	ENST00000601261	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		29.35	■■■□□ 2.29
GTPBP3-225	ENST00000601261	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		29.35	■■■□□ 2.29
GTPBP3-225	ENST00000601261	PTPRM	P28827	1452 aa		29.34	■■■□□ 2.29
GTPBP3-225	ENST00000601261	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		29.28	■■■□□ 2.28
GTPBP3-225	ENST00000601261	MADD	Q8WXG6	1647 aa		29.27	■■■□□ 2.28
GTPBP3-225	ENST00000601261	AFAP1	Q8N556	730 aa		29.25	■■■□□ 2.27
GTPBP3-225	ENST00000601261	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		29.24	■■■□□ 2.27
GTPBP3-225	ENST00000601261	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		29.24	■■■□□ 2.27
GTPBP3-225	ENST00000601261	ATP10A	O60312	1499 aa		29.23	■■■□□ 2.27
GTPBP3-225	ENST00000601261	PREX2	Q70Z35	1606 aa		29.22	■■■□□ 2.27
GTPBP3-225	ENST00000601261	MLEC	Q14165	292 aa		29.21	■■■□□ 2.27
GTPBP3-225	ENST00000601261	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		29.2	■■■□□ 2.26
GTPBP3-225	ENST00000601261	KDM5C	P41229	1560 aa		29.18	■■■□□ 2.26
GTPBP3-225	ENST00000601261	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	29.17	■■■□□ 2.26
GTPBP3-225	ENST00000601261	CEP162	Q5TB80	1403 aa		29.16	■■■□□ 2.26
GTPBP3-225	ENST00000601261	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		29.15	■■■□□ 2.26
GTPBP3-225	ENST00000601261	ABCC1	P33527	1531 aa		29.14	■■■□□ 2.25
GTPBP3-225	ENST00000601261	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		29.14	■■■□□ 2.25
GTPBP3-225	ENST00000601261	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		29.13	■■■□□ 2.25
GTPBP3-225	ENST00000601261	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	29.13	■■■□□ 2.25
GTPBP3-225	ENST00000601261	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		29.11	■■■□□ 2.25
GTPBP3-225	ENST00000601261	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		29.11	■■■□□ 2.25
GTPBP3-225	ENST00000601261	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		29.1	■■■□□ 2.25
GTPBP3-225	ENST00000601261	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		29.1	■■■□□ 2.25
GTPBP3-225	ENST00000601261	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	29.1	■■■□□ 2.25
GTPBP3-225	ENST00000601261	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		29.07	■■■□□ 2.24
GTPBP3-225	ENST00000601261	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		29.07	■■■□□ 2.24
GTPBP3-225	ENST00000601261	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
GTPBP3-225	ENST00000601261	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		29.05	■■■□□ 2.24
GTPBP3-225	ENST00000601261	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		29.05	■■■□□ 2.24
GTPBP3-225	ENST00000601261	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		29.01	■■■□□ 2.24
GTPBP3-225	ENST00000601261	RERE	Q9P2R6	1566 aa		29.01	■■■□□ 2.24
GTPBP3-225	ENST00000601261	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		29	■■■□□ 2.23
GTPBP3-225	ENST00000601261	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		29	■■■□□ 2.23
GTPBP3-225	ENST00000601261	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	29	■■■□□ 2.23
GTPBP3-225	ENST00000601261	ABCA6	Q8N139	1617 aa		29	■■■□□ 2.23
GTPBP3-225	ENST00000601261	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		28.99	■■■□□ 2.23
GTPBP3-225	ENST00000601261	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		28.99	■■■□□ 2.23
GTPBP3-225	ENST00000601261	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		28.98	■■■□□ 2.23
GTPBP3-225	ENST00000601261	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		28.97	■■■□□ 2.23
GTPBP3-225	ENST00000601261	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	28.96	■■■□□ 2.23
GTPBP3-225	ENST00000601261	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		28.96	■■■□□ 2.23
GTPBP3-225	ENST00000601261	AGL	P35573	1532 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GTPBP3-225	ENST00000601261	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	28.93	■■■□□ 2.22
GTPBP3-225	ENST00000601261	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
GTPBP3-225	ENST00000601261	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
GTPBP3-225	ENST00000601261	HSPA2	P54652	639 aa		28.9	■■■□□ 2.22
GTPBP3-225	ENST00000601261	TIAM1	Q13009	1591 aa		28.89	■■■□□ 2.22
GTPBP3-225	ENST00000601261	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		28.86	■■■□□ 2.21
GTPBP3-225	ENST00000601261	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
GTPBP3-225	ENST00000601261	ATP7A	Q04656	1500 aa		28.84	■■■□□ 2.21
GTPBP3-225	ENST00000601261	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
GTPBP3-225	ENST00000601261	NCOA2	Q15596	1464 aa		28.81	■■■□□ 2.2
GTPBP3-225	ENST00000601261	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		28.8	■■■□□ 2.2
GTPBP3-225	ENST00000601261	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
GTPBP3-225	ENST00000601261	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		28.78	■■■□□ 2.2
GTPBP3-225	ENST00000601261	A2M	P01023	1474 aa		28.78	■■■□□ 2.2
GTPBP3-225	ENST00000601261	MBD5	Q9P267	1494 aa		28.78	■■■□□ 2.2
GTPBP3-225	ENST00000601261	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
GTPBP3-225	ENST00000601261	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		28.76	■■■□□ 2.19
GTPBP3-225	ENST00000601261	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		28.74	■■■□□ 2.19
GTPBP3-225	ENST00000601261	C3	P01024	1663 aa		28.74	■■■□□ 2.19
GTPBP3-225	ENST00000601261	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		28.73	■■■□□ 2.19
GTPBP3-225	ENST00000601261	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		28.72	■■■□□ 2.19
GTPBP3-225	ENST00000601261	PLXNC1	O60486	1568 aa		28.71	■■■□□ 2.19
GTPBP3-225	ENST00000601261	GGT6	Q6P531	493 aa		28.69	■■■□□ 2.18
GTPBP3-225	ENST00000601261	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		28.69	■■■□□ 2.18
GTPBP3-225	ENST00000601261	MAP3K1	Q13233	1512 aa		28.69	■■■□□ 2.18
GTPBP3-225	ENST00000601261	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		28.68	■■■□□ 2.18
GTPBP3-225	ENST00000601261	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GTPBP3-225	ENST00000601261	ZMYM3	Q14202	1370 aa		28.66	■■■□□ 2.18
GTPBP3-225	ENST00000601261	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		28.66	■■■□□ 2.18
GTPBP3-225	ENST00000601261	FBXO41	Q8TF61	875 aa		28.65	■■■□□ 2.18
GTPBP3-225	ENST00000601261	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	28.64	■■■□□ 2.18
GTPBP3-225	ENST00000601261	MROH2A	A6NES4	1674 aa		28.64	■■■□□ 2.17
GTPBP3-225	ENST00000601261	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
GTPBP3-225	ENST00000601261	TSPY4	P0CV99	314 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GTPBP3-225	ENST00000601261	TSPY10	P0CW01	314 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GTPBP3-225	ENST00000601261	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GTPBP3-225	ENST00000601261	APLP2	Q06481	763 aa		28.62	■■■□□ 2.17
GTPBP3-225	ENST00000601261	NPAT	Q14207	1427 aa		28.61	■■■□□ 2.17
GTPBP3-225	ENST00000601261	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		28.58	■■■□□ 2.17
GTPBP3-225	ENST00000601261	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.16
GTPBP3-225	ENST00000601261	KIF3B	O15066	747 aa		28.56	■■■□□ 2.16
GTPBP3-225	ENST00000601261	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		28.53	■■■□□ 2.16
GTPBP3-225	ENST00000601261	MIA2	Q96PC5	1412 aa		28.53	■■■□□ 2.16
GTPBP3-225	ENST00000601261	STRC	Q7RTU9	1775 aa		28.52	■■■□□ 2.16
GTPBP3-225	ENST00000601261	CERK	Q8TCT0	537 aa		28.49	■■■□□ 2.15
GTPBP3-225	ENST00000601261	PTPRK	Q15262	1439 aa		28.49	■■■□□ 2.15
GTPBP3-225	ENST00000601261	PTPRT	O14522	1441 aa		28.45	■■■□□ 2.15
GTPBP3-225	ENST00000601261	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		28.43	■■■□□ 2.14
GTPBP3-225	ENST00000601261	NCOA1	Q15788	1441 aa		28.43	■■■□□ 2.14
GTPBP3-225	ENST00000601261	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		28.43	■■■□□ 2.14
GTPBP3-225	ENST00000601261	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		28.42	■■■□□ 2.14

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