RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, human

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRD4-208	ENST00000597315	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		42.72	■■■■■ 4.43
BRD4-208	ENST00000597315	RICTOR	Q6R327	1708 aa		42.71	■■■■■ 4.43
BRD4-208	ENST00000597315	PREX2	Q70Z35	1606 aa		42.67	■■■■■ 4.42
BRD4-208	ENST00000597315	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		42.65	■■■■■ 4.42
BRD4-208	ENST00000597315	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		42.63	■■■■■ 4.42
BRD4-208	ENST00000597315	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		42.63	■■■■■ 4.42
BRD4-208	ENST00000597315	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		42.6	■■■■■ 4.41
BRD4-208	ENST00000597315	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		42.58	■■■■■ 4.41
BRD4-208	ENST00000597315	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		42.58	■■■■■ 4.41
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	42.57	■■■■■ 4.41
BRD4-208	ENST00000597315	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	42.56	■■■■■ 4.4
BRD4-208	ENST00000597315	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		42.55	■■■■■ 4.4
BRD4-208	ENST00000597315	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		42.54	■■■■■ 4.4
BRD4-208	ENST00000597315	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		42.54	■■■■■ 4.4
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		42.54	■■■■■ 4.4
BRD4-208	ENST00000597315	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		42.53	■■■■■ 4.4
BRD4-208	ENST00000597315	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	42.53	■■■■■ 4.4
BRD4-208	ENST00000597315	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	42.52	■■■■■ 4.4
BRD4-208	ENST00000597315	TIAM1	Q13009	1591 aa		42.52	■■■■■ 4.4
BRD4-208	ENST00000597315	AFAP1	Q8N556	730 aa		42.47	■■■■■ 4.39
BRD4-208	ENST00000597315	ABCC1	P33527	1531 aa		42.46	■■■■■ 4.39
BRD4-208	ENST00000597315	APLP2	Q06481	763 aa		42.45	■■■■■ 4.39
BRD4-208	ENST00000597315	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		42.45	■■■■■ 4.39
BRD4-208	ENST00000597315	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	42.41	■■■■■ 4.38
BRD4-208	ENST00000597315	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		42.38	■■■■■ 4.38
BRD4-208	ENST00000597315	KDM5C	P41229	1560 aa		42.37	■■■■■ 4.37
BRD4-208	ENST00000597315	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		42.36	■■■■■ 4.37
BRD4-208	ENST00000597315	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		42.36	■■■■■ 4.37
BRD4-208	ENST00000597315	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		42.36	■■■■■ 4.37
BRD4-208	ENST00000597315	MAP3K1	Q13233	1512 aa		42.36	■■■■■ 4.37
BRD4-208	ENST00000597315	NCOA2	Q15596	1464 aa		42.35	■■■■■ 4.37
BRD4-208	ENST00000597315	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		42.35	■■■■■ 4.37
BRD4-208	ENST00000597315	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		42.35	■■■■■ 4.37
BRD4-208	ENST00000597315	ATP10A	O60312	1499 aa		42.33	■■■■■ 4.37
BRD4-208	ENST00000597315	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		42.32	■■■■■ 4.37
BRD4-208	ENST00000597315	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	42.31	■■■■■ 4.36	1e-6	■■■□□ 18.2
BRD4-208	ENST00000597315	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		42.3	■■■■■ 4.36
BRD4-208	ENST00000597315	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		42.29	■■■■■ 4.36
BRD4-208	ENST00000597315	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		42.28	■■■■■ 4.36
BRD4-208	ENST00000597315	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		42.27	■■■■■ 4.36
BRD4-208	ENST00000597315	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		42.26	■■■■■ 4.36
BRD4-208	ENST00000597315	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	42.24	■■■■■ 4.35
BRD4-208	ENST00000597315	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		42.22	■■■■■ 4.35
BRD4-208	ENST00000597315	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	42.2	■■■■■ 4.35
BRD4-208	ENST00000597315	MLEC	Q14165	292 aa		42.2	■■■■■ 4.35
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	42.19	■■■■■ 4.34
BRD4-208	ENST00000597315	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		42.16	■■■■■ 4.34
BRD4-208	ENST00000597315	ABCA6	Q8N139	1617 aa		42.12	■■■■■ 4.33
BRD4-208	ENST00000597315	MADD	Q8WXG6	1647 aa		42.12	■■■■■ 4.33
BRD4-208	ENST00000597315	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		42.1	■■■■■ 4.33
BRD4-208	ENST00000597315	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		42.09	■■■■■ 4.33
BRD4-208	ENST00000597315	PTPRM	P28827	1452 aa		42.09	■■■■■ 4.33
BRD4-208	ENST00000597315	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		42.07	■■■■■ 4.33
BRD4-208	ENST00000597315	RERE	Q9P2R6	1566 aa		42.05	■■■■■ 4.32
BRD4-208	ENST00000597315	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.04	■■■■■ 4.32
BRD4-208	ENST00000597315	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		42.03	■■■■■ 4.32
BRD4-208	ENST00000597315	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.02	■■■■■ 4.32
BRD4-208	ENST00000597315	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	42.02	■■■■■ 4.32
BRD4-208	ENST00000597315	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		42	■■■■■ 4.31
BRD4-208	ENST00000597315	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	41.97	■■■■■ 4.31
BRD4-208	ENST00000597315	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		41.96	■■■■■ 4.31
BRD4-208	ENST00000597315	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		41.95	■■■■■ 4.31
BRD4-208	ENST00000597315	MIA2	Q96PC5	1412 aa		41.95	■■■■■ 4.31
BRD4-208	ENST00000597315	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		41.94	■■■■■ 4.3
BRD4-208	ENST00000597315	AGL	P35573	1532 aa		41.94	■■■■■ 4.3
BRD4-208	ENST00000597315	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	41.93	■■■■■ 4.3
BRD4-208	ENST00000597315	TSPY4	P0CV99	314 aa		41.91	■■■■■ 4.3
BRD4-208	ENST00000597315	TSPY10	P0CW01	314 aa		41.91	■■■■■ 4.3
BRD4-208	ENST00000597315	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		41.9	■■■■■ 4.3
BRD4-208	ENST00000597315	A2M	P01023	1474 aa		41.87	■■■■■ 4.29
BRD4-208	ENST00000597315	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		41.86	■■■■■ 4.29
BRD4-208	ENST00000597315	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		41.81	■■■■■ 4.28
BRD4-208	ENST00000597315	PLXNC1	O60486	1568 aa		41.74	■■■■■ 4.27
BRD4-208	ENST00000597315	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		41.71	■■■■■ 4.27
BRD4-208	ENST00000597315	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		41.71	■■■■■ 4.27
BRD4-208	ENST00000597315	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	41.7	■■■■■ 4.27
BRD4-208	ENST00000597315	GGT6	Q6P531	493 aa		41.69	■■■■■ 4.26
BRD4-208	ENST00000597315	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		41.69	■■■■■ 4.26
BRD4-208	ENST00000597315	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	41.68	■■■■■ 4.26
BRD4-208	ENST00000597315	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		41.62	■■■■■ 4.25
BRD4-208	ENST00000597315	KIF3B	O15066	747 aa		41.6	■■■■■ 4.25
BRD4-208	ENST00000597315	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	41.6	■■■■■ 4.25
BRD4-208	ENST00000597315	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	41.59	■■■■■ 4.25
BRD4-208	ENST00000597315	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		41.58	■■■■■ 4.25
BRD4-208	ENST00000597315	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	41.55	■■■■■ 4.24
BRD4-208	ENST00000597315	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		41.53	■■■■■ 4.24
BRD4-208	ENST00000597315	ABCC5	O15440	1437 aa		41.52	■■■■■ 4.24
BRD4-208	ENST00000597315	DAPK1	P53355	1430 aa		41.52	■■■■■ 4.24
BRD4-208	ENST00000597315	C3	P01024	1663 aa		41.52	■■■■■ 4.24
BRD4-208	ENST00000597315	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		41.5	■■■■■ 4.23
BRD4-208	ENST00000597315	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	41.49	■■■■■ 4.23
BRD4-208	ENST00000597315	MROH2A	A6NES4	1674 aa		41.49	■■■■■ 4.23
BRD4-208	ENST00000597315	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	41.48	■■■■■ 4.23
BRD4-208	ENST00000597315	ZMYM3	Q14202	1370 aa		41.48	■■■■■ 4.23
BRD4-208	ENST00000597315	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		41.47	■■■■■ 4.23
BRD4-208	ENST00000597315	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	41.47	■■■■■ 4.23
BRD4-208	ENST00000597315	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		41.44	■■■■■ 4.22
BRD4-208	ENST00000597315	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		41.42	■■■■■ 4.22
BRD4-208	ENST00000597315	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		41.41	■■■■■ 4.22
BRD4-208	ENST00000597315	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		41.41	■■■■■ 4.22

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