RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596962.5

PGPEP1-205, Transcript of pyroglutamyl-peptidase I, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PGPEP1, Length 1,237 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1-205ENST00000596962 FANCAO15360 1455 aa22.22■■□□□ 1.15
PGPEP1-205ENST00000596962 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.18■■□□□ 1.14
PGPEP1-205ENST00000596962 PLCH2O75038 1416 aa22.17■■□□□ 1.14
PGPEP1-205ENST00000596962 AKNAQ7Z591 1439 aa22.17■■□□□ 1.14
PGPEP1-205ENST00000596962 PREX2Q70Z35 1606 aa22.17■■□□□ 1.14
PGPEP1-205ENST00000596962 NCOA2Q15596 1464 aa22.16■■□□□ 1.14
PGPEP1-205ENST00000596962 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.16■■□□□ 1.14
PGPEP1-205ENST00000596962 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.16■■□□□ 1.14
PGPEP1-205ENST00000596962 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PGPEP1-205ENST00000596962 RAPGEF3O95398 923 aa22.13■■□□□ 1.13
PGPEP1-205ENST00000596962 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PGPEP1-205ENST00000596962 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PGPEP1-205ENST00000596962 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.11■■□□□ 1.13
PGPEP1-205ENST00000596962 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.11■■□□□ 1.13
PGPEP1-205ENST00000596962 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.1■■□□□ 1.13
PGPEP1-205ENST00000596962 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PGPEP1-205ENST00000596962 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.08■■□□□ 1.13
PGPEP1-205ENST00000596962 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PGPEP1-205ENST00000596962 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.06■■□□□ 1.12
PGPEP1-205ENST00000596962 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.06■■□□□ 1.12
PGPEP1-205ENST00000596962 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.05■■□□□ 1.12
PGPEP1-205ENST00000596962 MIA2Q96PC5 1412 aa22.05■■□□□ 1.12
PGPEP1-205ENST00000596962 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.04■■□□□ 1.12
PGPEP1-205ENST00000596962 ABCC1P33527 1531 aa22.04■■□□□ 1.12
PGPEP1-205ENST00000596962 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.04■■□□□ 1.12
PGPEP1-205ENST00000596962 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.01■■□□□ 1.11
PGPEP1-205ENST00000596962 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22■■□□□ 1.11
PGPEP1-205ENST00000596962 KDM5CP41229 1560 aa21.99■■□□□ 1.11
PGPEP1-205ENST00000596962 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.99■■□□□ 1.11
PGPEP1-205ENST00000596962 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.98■■□□□ 1.11
PGPEP1-205ENST00000596962 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.98■■□□□ 1.11
PGPEP1-205ENST00000596962 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.97■■□□□ 1.11
PGPEP1-205ENST00000596962 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PGPEP1-205ENST00000596962 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.97■■□□□ 1.11
PGPEP1-205ENST00000596962 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.96■■□□□ 1.11
PGPEP1-205ENST00000596962 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.95■■□□□ 1.1
PGPEP1-205ENST00000596962 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.95■■□□□ 1.1
PGPEP1-205ENST00000596962 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.94■■□□□ 1.1
PGPEP1-205ENST00000596962 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.92■■□□□ 1.1
PGPEP1-205ENST00000596962 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.92■■□□□ 1.1
PGPEP1-205ENST00000596962 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.92■■□□□ 1.1
PGPEP1-205ENST00000596962 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.92■■□□□ 1.1
PGPEP1-205ENST00000596962 ABCA6Q8N139 1617 aa21.91■■□□□ 1.1
PGPEP1-205ENST00000596962 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PGPEP1-205ENST00000596962 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.91■■□□□ 1.1
PGPEP1-205ENST00000596962 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.9■■□□□ 1.1
PGPEP1-205ENST00000596962 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PGPEP1-205ENST00000596962 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
PGPEP1-205ENST00000596962 MADDQ8WXG6 1647 aa21.89■■□□□ 1.09
PGPEP1-205ENST00000596962 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PGPEP1-205ENST00000596962 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PGPEP1-205ENST00000596962 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.88■■□□□ 1.09
PGPEP1-205ENST00000596962 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.87■■□□□ 1.09
PGPEP1-205ENST00000596962 PTPRMP28827 1452 aa21.86■■□□□ 1.09
PGPEP1-205ENST00000596962 AFAP1Q8N556 730 aa21.86■■□□□ 1.09
PGPEP1-205ENST00000596962 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.84■■□□□ 1.09
PGPEP1-205ENST00000596962 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
PGPEP1-205ENST00000596962 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PGPEP1-205ENST00000596962 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.83■■□□□ 1.09
PGPEP1-205ENST00000596962 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.83■■□□□ 1.09
PGPEP1-205ENST00000596962 ATP10AO60312 1499 aa21.83■■□□□ 1.08
PGPEP1-205ENST00000596962 REREQ9P2R6 1566 aa21.82■■□□□ 1.08
PGPEP1-205ENST00000596962 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PGPEP1-205ENST00000596962 MBD5Q9P267 1494 aa21.81■■□□□ 1.08
PGPEP1-205ENST00000596962 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.81■■□□□ 1.08
PGPEP1-205ENST00000596962 TSPY4P0CV99 314 aa21.8■■□□□ 1.08
PGPEP1-205ENST00000596962 TSPY10P0CW01 314 aa21.8■■□□□ 1.08
PGPEP1-205ENST00000596962 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
PGPEP1-205ENST00000596962 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.77■■□□□ 1.07
PGPEP1-205ENST00000596962 ATP7AQ04656 1500 aa21.76■■□□□ 1.07
PGPEP1-205ENST00000596962 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.76■■□□□ 1.07
PGPEP1-205ENST00000596962 ABCC5O15440 1437 aa21.74■■□□□ 1.07
PGPEP1-205ENST00000596962 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PGPEP1-205ENST00000596962 DAPK1P53355 1430 aa21.73■■□□□ 1.07
PGPEP1-205ENST00000596962 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.71■■□□□ 1.07
PGPEP1-205ENST00000596962 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.71■■□□□ 1.07
PGPEP1-205ENST00000596962 AGLP35573 1532 aa21.7■■□□□ 1.07
PGPEP1-205ENST00000596962 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.7■■□□□ 1.06
PGPEP1-205ENST00000596962 ITGAEP38570 1179 aa21.7■■□□□ 1.06
PGPEP1-205ENST00000596962 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.7■■□□□ 1.06
PGPEP1-205ENST00000596962 PLXNC1O60486 1568 aa21.7■■□□□ 1.06
PGPEP1-205ENST00000596962 MLECQ14165 292 aa21.68■■□□□ 1.06
PGPEP1-205ENST00000596962 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PGPEP1-205ENST00000596962 ROCK1Q13464 1354 aa21.65■■□□□ 1.06
PGPEP1-205ENST00000596962 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.65■■□□□ 1.06
PGPEP1-205ENST00000596962 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.64■■□□□ 1.05
PGPEP1-205ENST00000596962 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.64■■□□□ 1.05
PGPEP1-205ENST00000596962 PTPRKQ15262 1439 aa21.63■■□□□ 1.05
PGPEP1-205ENST00000596962 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.62■■□□□ 1.05
PGPEP1-205ENST00000596962 ADGRL2O95490 1459 aa21.61■■□□□ 1.05
PGPEP1-205ENST00000596962 A2MP01023 1474 aa21.61■■□□□ 1.05
PGPEP1-205ENST00000596962 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.6■■□□□ 1.05
PGPEP1-205ENST00000596962 NCOA1Q15788 1441 aa21.6■■□□□ 1.05
PGPEP1-205ENST00000596962 C3P01024 1663 aa21.59■■□□□ 1.05
PGPEP1-205ENST00000596962 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.57■■□□□ 1.04
PGPEP1-205ENST00000596962 KIF15Q9NS87 1388 aa21.56■■□□□ 1.04
PGPEP1-205ENST00000596962 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.55■■□□□ 1.04
PGPEP1-205ENST00000596962 MROH2AA6NES4 1674 aa21.54■■□□□ 1.04
PGPEP1-205ENST00000596962 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PGPEP1-205ENST00000596962 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.54■■□□□ 1.04
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