RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596309.5

FCHO1-212, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-212ENST00000596309 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
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FCHO1-212ENST00000596309 NCOA2Q15596 1464 aa30.15■■■□□ 2.42
FCHO1-212ENST00000596309 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.14■■■□□ 2.42
FCHO1-212ENST00000596309 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.13■■■□□ 2.41
FCHO1-212ENST00000596309 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.11■■■□□ 2.41
FCHO1-212ENST00000596309 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.1■■■□□ 2.41
FCHO1-212ENST00000596309 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
FCHO1-212ENST00000596309 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
FCHO1-212ENST00000596309 ADGRL1O94910 1474 aa30.05■■■□□ 2.4
FCHO1-212ENST00000596309 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
FCHO1-212ENST00000596309 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.03■■■□□ 2.4
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FCHO1-212ENST00000596309 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.97■■■□□ 2.39
FCHO1-212ENST00000596309 ABCC1P33527 1531 aa29.96■■■□□ 2.39
FCHO1-212ENST00000596309 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.95■■■□□ 2.38
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FCHO1-212ENST00000596309 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.89■■■□□ 2.38
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FCHO1-212ENST00000596309 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.8■■■□□ 2.36
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FCHO1-212ENST00000596309 AFAP1Q8N556 730 aa29.8■■■□□ 2.36
FCHO1-212ENST00000596309 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.79■■■□□ 2.36
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FCHO1-212ENST00000596309 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.71■■■□□ 2.35
FCHO1-212ENST00000596309 TSPY4P0CV99 314 aa29.69■■■□□ 2.34
FCHO1-212ENST00000596309 TSPY10P0CW01 314 aa29.69■■■□□ 2.34
FCHO1-212ENST00000596309 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.68■■■□□ 2.34
FCHO1-212ENST00000596309 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
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FCHO1-212ENST00000596309 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.39■■■□□ 2.3
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FCHO1-212ENST00000596309 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.32■■■□□ 2.28
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FCHO1-212ENST00000596309 MLECQ14165 292 aa29.25■■■□□ 2.27
FCHO1-212ENST00000596309 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.23■■■□□ 2.27
FCHO1-212ENST00000596309 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
FCHO1-212ENST00000596309 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.21■■■□□ 2.27
FCHO1-212ENST00000596309 MADDQ8WXG6 1647 aa29.2■■■□□ 2.26
FCHO1-212ENST00000596309 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
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