RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594537.2

LTBP4-211, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene LTBP4, Length 657 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4-211ENST00000594537 TSPOAP1O95153 1857 aa35.84■■■■□ 3.33
LTBP4-211ENST00000594537 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.81■■■■□ 3.32
LTBP4-211ENST00000594537 FANCAO15360 1455 aa35.8■■■■□ 3.32
LTBP4-211ENST00000594537 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.8■■■■□ 3.32
LTBP4-211ENST00000594537 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.8■■■■□ 3.32
LTBP4-211ENST00000594537 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.79■■■■□ 3.32
LTBP4-211ENST00000594537 MIA2Q96PC5 1412 aa35.76■■■■□ 3.32
LTBP4-211ENST00000594537 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.32
LTBP4-211ENST00000594537 AKNAQ7Z591 1439 aa35.71■■■■□ 3.31
LTBP4-211ENST00000594537 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.68■■■■□ 3.3
LTBP4-211ENST00000594537 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
LTBP4-211ENST00000594537 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.64■■■■□ 3.3
LTBP4-211ENST00000594537 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.63■■■■□ 3.29
LTBP4-211ENST00000594537 ADGRL1O94910 1474 aa35.62■■■■□ 3.29
LTBP4-211ENST00000594537 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.62■■■■□ 3.29
LTBP4-211ENST00000594537 ABCC1P33527 1531 aa35.6■■■■□ 3.29
LTBP4-211ENST00000594537 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
LTBP4-211ENST00000594537 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.56■■■■□ 3.28
LTBP4-211ENST00000594537 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.56■■■■□ 3.28
LTBP4-211ENST00000594537 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
LTBP4-211ENST00000594537 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
LTBP4-211ENST00000594537 KDM6BO15054 1643 aa35.54■■■■□ 3.28
LTBP4-211ENST00000594537 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.54■■■■□ 3.28
LTBP4-211ENST00000594537 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.51■■■■□ 3.28
LTBP4-211ENST00000594537 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.49■■■■□ 3.272e-6■■■■□ 20.4
LTBP4-211ENST00000594537 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.49■■■■□ 3.27
LTBP4-211ENST00000594537 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.48■■■■□ 3.27
LTBP4-211ENST00000594537 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.48■■■■□ 3.27
LTBP4-211ENST00000594537 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.48■■■■□ 3.27
LTBP4-211ENST00000594537 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
LTBP4-211ENST00000594537 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.48■■■■□ 3.27
LTBP4-211ENST00000594537 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.47■■■■□ 3.27
LTBP4-211ENST00000594537 MBD5Q9P267 1494 aa35.46■■■■□ 3.27
LTBP4-211ENST00000594537 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.46■■■■□ 3.27
LTBP4-211ENST00000594537 RICTORQ6R327 1708 aa35.44■■■■□ 3.26
LTBP4-211ENST00000594537 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.41■■■■□ 3.26
LTBP4-211ENST00000594537 KDM5CP41229 1560 aa35.4■■■■□ 3.26
LTBP4-211ENST00000594537 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.4■■■■□ 3.26
LTBP4-211ENST00000594537 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.39■■■■□ 3.26
LTBP4-211ENST00000594537 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.39■■■■□ 3.26
LTBP4-211ENST00000594537 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.39■■■■□ 3.26
LTBP4-211ENST00000594537 RAPGEF3O95398 923 aa35.38■■■■□ 3.25
LTBP4-211ENST00000594537 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.36■■■■□ 3.25
LTBP4-211ENST00000594537 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
LTBP4-211ENST00000594537 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.25
LTBP4-211ENST00000594537 AFAP1Q8N556 730 aa35.32■■■■□ 3.24
LTBP4-211ENST00000594537 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.32■■■■□ 3.24
LTBP4-211ENST00000594537 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.29■■■■□ 3.24
LTBP4-211ENST00000594537 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.29■■■■□ 3.24
LTBP4-211ENST00000594537 TSPY4P0CV99 314 aa35.28■■■■□ 3.24
LTBP4-211ENST00000594537 TSPY10P0CW01 314 aa35.28■■■■□ 3.24
LTBP4-211ENST00000594537 DAPK1P53355 1430 aa35.28■■■■□ 3.24
LTBP4-211ENST00000594537 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.28■■■■□ 3.24
LTBP4-211ENST00000594537 ABCC5O15440 1437 aa35.27■■■■□ 3.24
LTBP4-211ENST00000594537 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
LTBP4-211ENST00000594537 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.25■■■■□ 3.23
LTBP4-211ENST00000594537 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.23■■■■□ 3.23
LTBP4-211ENST00000594537 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
LTBP4-211ENST00000594537 ATP7AQ04656 1500 aa35.2■■■■□ 3.23
LTBP4-211ENST00000594537 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.2■■■■□ 3.23
LTBP4-211ENST00000594537 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.19■■■■□ 3.22
LTBP4-211ENST00000594537 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.17■■■■□ 3.22
LTBP4-211ENST00000594537 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa35.16■■■■□ 3.22
LTBP4-211ENST00000594537 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.13■■■■□ 3.21
LTBP4-211ENST00000594537 ADGRL2O95490 1459 aa35.11■■■■□ 3.21
LTBP4-211ENST00000594537 PLXNC1O60486 1568 aa35.1■■■■□ 3.21
LTBP4-211ENST00000594537 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.1■■■■□ 3.21
LTBP4-211ENST00000594537 ATP10AO60312 1499 aa35.09■■■■□ 3.21
LTBP4-211ENST00000594537 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.08■■■■□ 3.21
LTBP4-211ENST00000594537 ROCK1Q13464 1354 aa35.08■■■■□ 3.21
LTBP4-211ENST00000594537 REREQ9P2R6 1566 aa35.08■■■■□ 3.21
LTBP4-211ENST00000594537 ABCA6Q8N139 1617 aa35.07■■■■□ 3.21
LTBP4-211ENST00000594537 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.07■■■■□ 3.2
LTBP4-211ENST00000594537 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.07■■■■□ 3.2
LTBP4-211ENST00000594537 PTPRKQ15262 1439 aa35.06■■■■□ 3.2
LTBP4-211ENST00000594537 NCOA1Q15788 1441 aa35.04■■■■□ 3.2
LTBP4-211ENST00000594537 ITGAEP38570 1179 aa34.99■■■■□ 3.19
LTBP4-211ENST00000594537 A2MP01023 1474 aa34.98■■■■□ 3.19
LTBP4-211ENST00000594537 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.98■■■■□ 3.19
LTBP4-211ENST00000594537 KIF15Q9NS87 1388 aa34.97■■■■□ 3.19
LTBP4-211ENST00000594537 DUOX2Q9NRD8 1548 aa34.96■■■■□ 3.19
LTBP4-211ENST00000594537 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
LTBP4-211ENST00000594537 AGLP35573 1532 aa34.94■■■■□ 3.18
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LTBP4-211ENST00000594537 ERBINQ96RT1 1412 aa34.89■■■■□ 3.18
LTBP4-211ENST00000594537 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP34.86■■■■□ 3.17
LTBP4-211ENST00000594537 HFM1A2PYH4 1435 aa34.85■■■■□ 3.17
LTBP4-211ENST00000594537 BCORL1Q5H9F3 1711 aa34.84■■■■□ 3.17
LTBP4-211ENST00000594537 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa34.81■■■■□ 3.16
LTBP4-211ENST00000594537 NAIPQ13075 1403 aa34.8■■■■□ 3.16
LTBP4-211ENST00000594537 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.79■■■■□ 3.16
LTBP4-211ENST00000594537 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.77■■■■□ 3.16
LTBP4-211ENST00000594537 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP34.77■■■■□ 3.16
LTBP4-211ENST00000594537 KIF3BO15066 747 aa34.72■■■■□ 3.15
LTBP4-211ENST00000594537 PPP6R1Q9UPN7 881 aa34.72■■■■□ 3.15
LTBP4-211ENST00000594537 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP34.72■■■■□ 3.15
LTBP4-211ENST00000594537 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP34.71■■■■□ 3.15
LTBP4-211ENST00000594537 FAM135AQ9P2D6 1515 aa34.69■■■■□ 3.14
LTBP4-211ENST00000594537 SETD5Q9C0A6 1442 aa34.66■■■■□ 3.14
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