RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593908.5

NFKB2-208, Transcript of nuclear factor kappa B subunit 2, human

TSL 4

Gene NFKB2, Length 562 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFKB2-208	ENST00000593908	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		32.23	■■■□□ 2.75
NFKB2-208	ENST00000593908	PLCH2	O75038	1416 aa		32.18	■■■□□ 2.74
NFKB2-208	ENST00000593908	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		32.18	■■■□□ 2.74
NFKB2-208	ENST00000593908	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		32.15	■■■□□ 2.74
NFKB2-208	ENST00000593908	RICTOR	Q6R327	1708 aa		32.15	■■■□□ 2.74
NFKB2-208	ENST00000593908	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
NFKB2-208	ENST00000593908	PTPRM	P28827	1452 aa		32.13	■■■□□ 2.73
NFKB2-208	ENST00000593908	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	32.13	■■■□□ 2.73
NFKB2-208	ENST00000593908	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		32.11	■■■□□ 2.73
NFKB2-208	ENST00000593908	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
NFKB2-208	ENST00000593908	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		32.1	■■■□□ 2.73
NFKB2-208	ENST00000593908	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		32.08	■■■□□ 2.73
NFKB2-208	ENST00000593908	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		32.07	■■■□□ 2.72
NFKB2-208	ENST00000593908	NCOA2	Q15596	1464 aa		32.06	■■■□□ 2.72
NFKB2-208	ENST00000593908	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		32.06	■■■□□ 2.72
NFKB2-208	ENST00000593908	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		32.06	■■■□□ 2.72
NFKB2-208	ENST00000593908	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		32.04	■■■□□ 2.72
NFKB2-208	ENST00000593908	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		32.03	■■■□□ 2.72
NFKB2-208	ENST00000593908	KIF14	Q15058	1648 aa		32.02	■■■□□ 2.72
NFKB2-208	ENST00000593908	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		32	■■■□□ 2.71
NFKB2-208	ENST00000593908	MADD	Q8WXG6	1647 aa		31.97	■■■□□ 2.71
NFKB2-208	ENST00000593908	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
NFKB2-208	ENST00000593908	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
NFKB2-208	ENST00000593908	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		31.92	■■■□□ 2.7
NFKB2-208	ENST00000593908	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		31.91	■■■□□ 2.7
NFKB2-208	ENST00000593908	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		31.89	■■■□□ 2.7
NFKB2-208	ENST00000593908	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		31.88	■■■□□ 2.69
NFKB2-208	ENST00000593908	ATP10A	O60312	1499 aa		31.88	■■■□□ 2.69
NFKB2-208	ENST00000593908	AFAP1	Q8N556	730 aa		31.87	■■■□□ 2.69
NFKB2-208	ENST00000593908	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		31.85	■■■□□ 2.69
NFKB2-208	ENST00000593908	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	31.85	■■■□□ 2.69
NFKB2-208	ENST00000593908	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		31.84	■■■□□ 2.69
NFKB2-208	ENST00000593908	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		31.83	■■■□□ 2.69
NFKB2-208	ENST00000593908	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		31.82	■■■□□ 2.68
NFKB2-208	ENST00000593908	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
NFKB2-208	ENST00000593908	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		31.82	■■■□□ 2.68
NFKB2-208	ENST00000593908	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		31.81	■■■□□ 2.68
NFKB2-208	ENST00000593908	KDM5C	P41229	1560 aa		31.8	■■■□□ 2.68
NFKB2-208	ENST00000593908	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
NFKB2-208	ENST00000593908	MLEC	Q14165	292 aa		31.79	■■■□□ 2.68
NFKB2-208	ENST00000593908	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		31.79	■■■□□ 2.68
NFKB2-208	ENST00000593908	MIA2	Q96PC5	1412 aa		31.77	■■■□□ 2.68
NFKB2-208	ENST00000593908	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		31.77	■■■□□ 2.68
NFKB2-208	ENST00000593908	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		31.75	■■■□□ 2.67
NFKB2-208	ENST00000593908	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		31.74	■■■□□ 2.67
NFKB2-208	ENST00000593908	PREX2	Q70Z35	1606 aa		31.73	■■■□□ 2.67
NFKB2-208	ENST00000593908	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		31.73	■■■□□ 2.67
NFKB2-208	ENST00000593908	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		31.72	■■■□□ 2.67
NFKB2-208	ENST00000593908	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		31.72	■■■□□ 2.67
NFKB2-208	ENST00000593908	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	31.7	■■■□□ 2.67
NFKB2-208	ENST00000593908	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
NFKB2-208	ENST00000593908	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	31.68	■■■□□ 2.66
NFKB2-208	ENST00000593908	ABCC1	P33527	1531 aa		31.68	■■■□□ 2.66
NFKB2-208	ENST00000593908	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	31.67	■■■□□ 2.66
NFKB2-208	ENST00000593908	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		31.66	■■■□□ 2.66
NFKB2-208	ENST00000593908	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		31.65	■■■□□ 2.66
NFKB2-208	ENST00000593908	RERE	Q9P2R6	1566 aa		31.64	■■■□□ 2.66
NFKB2-208	ENST00000593908	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		31.64	■■■□□ 2.66
NFKB2-208	ENST00000593908	HSPA2	P54652	639 aa		31.64	■■■□□ 2.66
NFKB2-208	ENST00000593908	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		31.62	■■■□□ 2.65
NFKB2-208	ENST00000593908	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		31.6	■■■□□ 2.65
NFKB2-208	ENST00000593908	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	31.6	■■■□□ 2.65
NFKB2-208	ENST00000593908	ABCA6	Q8N139	1617 aa		31.58	■■■□□ 2.65
NFKB2-208	ENST00000593908	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	31.58	■■■□□ 2.65
NFKB2-208	ENST00000593908	AGL	P35573	1532 aa		31.58	■■■□□ 2.65
NFKB2-208	ENST00000593908	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	31.57	■■■□□ 2.64
NFKB2-208	ENST00000593908	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		31.55	■■■□□ 2.64
NFKB2-208	ENST00000593908	FBXO41	Q8TF61	875 aa		31.53	■■■□□ 2.64
NFKB2-208	ENST00000593908	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		31.52	■■■□□ 2.64
NFKB2-208	ENST00000593908	ITGAE	P38570	1179 aa		31.52	■■■□□ 2.64
NFKB2-208	ENST00000593908	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		31.52	■■■□□ 2.64
NFKB2-208	ENST00000593908	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	31.51	■■■□□ 2.63
NFKB2-208	ENST00000593908	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		31.48	■■■□□ 2.63
NFKB2-208	ENST00000593908	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	31.46	■■■□□ 2.63
NFKB2-208	ENST00000593908	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		31.46	■■■□□ 2.63
NFKB2-208	ENST00000593908	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	31.46	■■■□□ 2.63
NFKB2-208	ENST00000593908	DAPK1	P53355	1430 aa		31.42	■■■□□ 2.62
NFKB2-208	ENST00000593908	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		31.41	■■■□□ 2.62
NFKB2-208	ENST00000593908	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	31.41	■■■□□ 2.62
NFKB2-208	ENST00000593908	ABCC5	O15440	1437 aa		31.41	■■■□□ 2.62
NFKB2-208	ENST00000593908	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		31.4	■■■□□ 2.62
NFKB2-208	ENST00000593908	PTPRK	Q15262	1439 aa		31.39	■■■□□ 2.62
NFKB2-208	ENST00000593908	MBD5	Q9P267	1494 aa		31.39	■■■□□ 2.62
NFKB2-208	ENST00000593908	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	31.37	■■■□□ 2.61
NFKB2-208	ENST00000593908	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		31.37	■■■□□ 2.61
NFKB2-208	ENST00000593908	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		31.36	■■■□□ 2.61
NFKB2-208	ENST00000593908	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		31.36	■■■□□ 2.61
NFKB2-208	ENST00000593908	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		31.35	■■■□□ 2.61
NFKB2-208	ENST00000593908	ATP7A	Q04656	1500 aa		31.34	■■■□□ 2.61
NFKB2-208	ENST00000593908	C3	P01024	1663 aa		31.33	■■■□□ 2.61
NFKB2-208	ENST00000593908	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		31.33	■■■□□ 2.61
NFKB2-208	ENST00000593908	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	31.31	■■■□□ 2.6
NFKB2-208	ENST00000593908	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		31.3	■■■□□ 2.6
NFKB2-208	ENST00000593908	A2M	P01023	1474 aa		31.29	■■■□□ 2.6
NFKB2-208	ENST00000593908	PLXNC1	O60486	1568 aa		31.29	■■■□□ 2.6
NFKB2-208	ENST00000593908	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		31.28	■■■□□ 2.6
NFKB2-208	ENST00000593908	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		31.27	■■■□□ 2.6
NFKB2-208	ENST00000593908	ZMYM3	Q14202	1370 aa		31.27	■■■□□ 2.6
NFKB2-208	ENST00000593908	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		31.26	■■■□□ 2.6
NFKB2-208	ENST00000593908	TSPY4	P0CV99	314 aa		31.26	■■■□□ 2.59

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