RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591600.1

APOC4-201, Transcript of apolipoprotein C4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene APOC4, Length 348 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-201ENST00000591600 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.26■■□□□ 1.63
APOC4-201ENST00000591600 KIF14Q15058 1648 aa25.26■■□□□ 1.63
APOC4-201ENST00000591600 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.25■■□□□ 1.63
APOC4-201ENST00000591600 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
APOC4-201ENST00000591600 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
APOC4-201ENST00000591600 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.24■■□□□ 1.63
APOC4-201ENST00000591600 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.24■■□□□ 1.63
APOC4-201ENST00000591600 CLIP1P30622 1438 aa25.2■■□□□ 1.63
APOC4-201ENST00000591600 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
APOC4-201ENST00000591600 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.17■■□□□ 1.62
APOC4-201ENST00000591600 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.16■■□□□ 1.62
APOC4-201ENST00000591600 ATP10AO60312 1499 aa25.15■■□□□ 1.62
APOC4-201ENST00000591600 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.15■■□□□ 1.62
APOC4-201ENST00000591600 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.15■■□□□ 1.62
APOC4-201ENST00000591600 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.15■■□□□ 1.62
APOC4-201ENST00000591600 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.15■■□□□ 1.62
APOC4-201ENST00000591600 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.14■■□□□ 1.62
APOC4-201ENST00000591600 KDM5CP41229 1560 aa25.13■■□□□ 1.61
APOC4-201ENST00000591600 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.11■■□□□ 1.61
APOC4-201ENST00000591600 PREX2Q70Z35 1606 aa25.1■■□□□ 1.61
APOC4-201ENST00000591600 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.08■■□□□ 1.61
APOC4-201ENST00000591600 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.07■■□□□ 1.6
APOC4-201ENST00000591600 AFAP1Q8N556 730 aa25.05■■□□□ 1.6
APOC4-201ENST00000591600 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.05■■□□□ 1.6
APOC4-201ENST00000591600 REREQ9P2R6 1566 aa25.04■■□□□ 1.6
APOC4-201ENST00000591600 MLECQ14165 292 aa25.03■■□□□ 1.6
APOC4-201ENST00000591600 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.02■■□□□ 1.6
APOC4-201ENST00000591600 ABCC1P33527 1531 aa25.02■■□□□ 1.6
APOC4-201ENST00000591600 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.01■■□□□ 1.59
APOC4-201ENST00000591600 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.01■■□□□ 1.59
APOC4-201ENST00000591600 ABCA6Q8N139 1617 aa24.97■■□□□ 1.59
APOC4-201ENST00000591600 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.96■■□□□ 1.59
APOC4-201ENST00000591600 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.95■■□□□ 1.59
APOC4-201ENST00000591600 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
APOC4-201ENST00000591600 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.94■■□□□ 1.58
APOC4-201ENST00000591600 FBXO41Q8TF61 875 aa24.94■■□□□ 1.58
APOC4-201ENST00000591600 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.94■■□□□ 1.58
APOC4-201ENST00000591600 AGLP35573 1532 aa24.93■■□□□ 1.58
APOC4-201ENST00000591600 HSPA2P54652 639 aa24.93■■□□□ 1.58
APOC4-201ENST00000591600 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.92■■□□□ 1.58
APOC4-201ENST00000591600 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
APOC4-201ENST00000591600 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.88■■□□□ 1.57
APOC4-201ENST00000591600 C3P01024 1663 aa24.85■■□□□ 1.57
APOC4-201ENST00000591600 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
APOC4-201ENST00000591600 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.82■■□□□ 1.56
APOC4-201ENST00000591600 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.82■■□□□ 1.56
APOC4-201ENST00000591600 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.81■■□□□ 1.56
APOC4-201ENST00000591600 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
APOC4-201ENST00000591600 STRCQ7RTU9 1775 aa24.79■■□□□ 1.56
APOC4-201ENST00000591600 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.78■■□□□ 1.56
APOC4-201ENST00000591600 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.78■■□□□ 1.56
APOC4-201ENST00000591600 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.78■■□□□ 1.56
APOC4-201ENST00000591600 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.78■■□□□ 1.56
APOC4-201ENST00000591600 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
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APOC4-201ENST00000591600 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.73■■□□□ 1.55
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APOC4-201ENST00000591600 PLXNC1O60486 1568 aa24.71■■□□□ 1.55
APOC4-201ENST00000591600 TIAM1Q13009 1591 aa24.71■■□□□ 1.55
APOC4-201ENST00000591600 CEP162Q5TB80 1403 aa24.7■■□□□ 1.55
APOC4-201ENST00000591600 CERKQ8TCT0 537 aa24.69■■□□□ 1.54
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APOC4-201ENST00000591600 A2MP01023 1474 aa24.67■■□□□ 1.54
APOC4-201ENST00000591600 NPATQ14207 1427 aa24.66■■□□□ 1.54
APOC4-201ENST00000591600 MBD5Q9P267 1494 aa24.64■■□□□ 1.54
APOC4-201ENST00000591600 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
APOC4-201ENST00000591600 ZMYM3Q14202 1370 aa24.63■■□□□ 1.53
APOC4-201ENST00000591600 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.61■■□□□ 1.53
APOC4-201ENST00000591600 PTPRTO14522 1441 aa24.61■■□□□ 1.53
APOC4-201ENST00000591600 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
APOC4-201ENST00000591600 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.6■■□□□ 1.53
APOC4-201ENST00000591600 NCOA2Q15596 1464 aa24.56■■□□□ 1.52
APOC4-201ENST00000591600 NCOA1Q15788 1441 aa24.55■■□□□ 1.52
APOC4-201ENST00000591600 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
APOC4-201ENST00000591600 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.54■■□□□ 1.52
APOC4-201ENST00000591600 GGT6Q6P531 493 aa24.53■■□□□ 1.52
APOC4-201ENST00000591600 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.52■■□□□ 1.52
APOC4-201ENST00000591600 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
APOC4-201ENST00000591600 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.51■■□□□ 1.51
APOC4-201ENST00000591600 PTPRKQ15262 1439 aa24.51■■□□□ 1.51
APOC4-201ENST00000591600 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.51■■□□□ 1.51
APOC4-201ENST00000591600 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.51■■□□□ 1.51
APOC4-201ENST00000591600 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.48■■□□□ 1.51
APOC4-201ENST00000591600 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.48■■□□□ 1.51
APOC4-201ENST00000591600 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.47■■□□□ 1.51
APOC4-201ENST00000591600 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
APOC4-201ENST00000591600 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.46■■□□□ 1.51
APOC4-201ENST00000591600 PLA2R1Q13018 1463 aa24.45■■□□□ 1.51
APOC4-201ENST00000591600 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.45■■□□□ 1.51
APOC4-201ENST00000591600 MAP3K1Q13233 1512 aa24.44■■□□□ 1.5
APOC4-201ENST00000591600 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.43■■□□□ 1.5
APOC4-201ENST00000591600 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.4■■□□□ 1.5
APOC4-201ENST00000591600 PKD2Q13563 968 aa24.4■■□□□ 1.5
APOC4-201ENST00000591600 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
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