RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591412.5

CTIF-210, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 491 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-210ENST00000591412 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.63■■□□□ 1.05
CTIF-210ENST00000591412 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.63■■□□□ 1.05
CTIF-210ENST00000591412 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.63■■□□□ 1.05
CTIF-210ENST00000591412 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.63■■□□□ 1.05
CTIF-210ENST00000591412 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
CTIF-210ENST00000591412 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.61■■□□□ 1.05
CTIF-210ENST00000591412 PTPRMP28827 1452 aa21.61■■□□□ 1.05
CTIF-210ENST00000591412 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.61■■□□□ 1.05
CTIF-210ENST00000591412 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.57■■□□□ 1.04
CTIF-210ENST00000591412 MADDQ8WXG6 1647 aa21.55■■□□□ 1.04
CTIF-210ENST00000591412 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.55■■□□□ 1.04
CTIF-210ENST00000591412 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.52■■□□□ 1.04
CTIF-210ENST00000591412 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.52■■□□□ 1.04
CTIF-210ENST00000591412 AFAP1Q8N556 730 aa21.52■■□□□ 1.04
CTIF-210ENST00000591412 ATP10AO60312 1499 aa21.52■■□□□ 1.03
CTIF-210ENST00000591412 KDM5CP41229 1560 aa21.51■■□□□ 1.03
CTIF-210ENST00000591412 PREX2Q70Z35 1606 aa21.51■■□□□ 1.03
CTIF-210ENST00000591412 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.48■■□□□ 1.03
CTIF-210ENST00000591412 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.48■■□□□ 1.03
CTIF-210ENST00000591412 ABCC1P33527 1531 aa21.47■■□□□ 1.03
CTIF-210ENST00000591412 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CTIF-210ENST00000591412 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.46■■□□□ 1.03
CTIF-210ENST00000591412 CEP162Q5TB80 1403 aa21.45■■□□□ 1.02
CTIF-210ENST00000591412 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.44■■□□□ 1.02
CTIF-210ENST00000591412 MLECQ14165 292 aa21.44■■□□□ 1.02
CTIF-210ENST00000591412 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.44■■□□□ 1.02
CTIF-210ENST00000591412 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CTIF-210ENST00000591412 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.4■■□□□ 1.02
CTIF-210ENST00000591412 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.4■■□□□ 1.02
CTIF-210ENST00000591412 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.39■■□□□ 1.02
CTIF-210ENST00000591412 REREQ9P2R6 1566 aa21.39■■□□□ 1.01
CTIF-210ENST00000591412 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.37■■□□□ 1.01
CTIF-210ENST00000591412 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.37■■□□□ 1.01
CTIF-210ENST00000591412 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.37■■□□□ 1.01
CTIF-210ENST00000591412 ABCA6Q8N139 1617 aa21.37■■□□□ 1.01
CTIF-210ENST00000591412 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.36■■□□□ 1.01
CTIF-210ENST00000591412 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CTIF-210ENST00000591412 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.35■■□□□ 1.01
CTIF-210ENST00000591412 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.34■■□□□ 1.01
CTIF-210ENST00000591412 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
CTIF-210ENST00000591412 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.33■■□□□ 1.01
CTIF-210ENST00000591412 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.33■■□□□ 1
CTIF-210ENST00000591412 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.33■■□□□ 1
CTIF-210ENST00000591412 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.32■■□□□ 1
CTIF-210ENST00000591412 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.32■■□□□ 13e-6■■■■□ 19.4
CTIF-210ENST00000591412 AGLP35573 1532 aa21.32■■□□□ 1
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CTIF-210ENST00000591412 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
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CTIF-210ENST00000591412 TIAM1Q13009 1591 aa21.28■■□□□ 1
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CTIF-210ENST00000591412 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.22■□□□□ 0.99
CTIF-210ENST00000591412 MBD5Q9P267 1494 aa21.22■□□□□ 0.99
CTIF-210ENST00000591412 ATP7AQ04656 1500 aa21.22■□□□□ 0.99
CTIF-210ENST00000591412 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
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CTIF-210ENST00000591412 C3P01024 1663 aa21.15■□□□□ 0.98
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CTIF-210ENST00000591412 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.14■□□□□ 0.98
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CTIF-210ENST00000591412 MAP3K1Q13233 1512 aa21.11■□□□□ 0.97
CTIF-210ENST00000591412 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.11■□□□□ 0.97
CTIF-210ENST00000591412 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.09■□□□□ 0.97
CTIF-210ENST00000591412 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CTIF-210ENST00000591412 ZMYM3Q14202 1370 aa21.09■□□□□ 0.97
CTIF-210ENST00000591412 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.09■□□□□ 0.97
CTIF-210ENST00000591412 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.08■□□□□ 0.97
CTIF-210ENST00000591412 MROH2AA6NES4 1674 aa21.08■□□□□ 0.96
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CTIF-210ENST00000591412 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
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CTIF-210ENST00000591412 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.99■□□□□ 0.95
CTIF-210ENST00000591412 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.98■□□□□ 0.95
CTIF-210ENST00000591412 MIA2Q96PC5 1412 aa20.98■□□□□ 0.95
CTIF-210ENST00000591412 TSPY4P0CV99 314 aa20.98■□□□□ 0.95
CTIF-210ENST00000591412 TSPY10P0CW01 314 aa20.98■□□□□ 0.95
CTIF-210ENST00000591412 KIF3BO15066 747 aa20.96■□□□□ 0.95
CTIF-210ENST00000591412 NCOA1Q15788 1441 aa20.95■□□□□ 0.95
CTIF-210ENST00000591412 CERKQ8TCT0 537 aa20.95■□□□□ 0.94
CTIF-210ENST00000591412 PTPRTO14522 1441 aa20.95■□□□□ 0.94
CTIF-210ENST00000591412 MAST1Q9Y2H9 1570 aa20.93■□□□□ 0.94
CTIF-210ENST00000591412 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.91■□□□□ 0.94
CTIF-210ENST00000591412 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa20.9■□□□□ 0.94
CTIF-210ENST00000591412 MYO3AQ8NEV4 1616 aa20.9■□□□□ 0.94
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