RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 WDR7Q9Y4E6 1490 aa33.54■■■□□ 2.96
CAPNS1-212ENST00000591041 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa33.53■■■□□ 2.96
CAPNS1-212ENST00000591041 AKNAQ7Z591 1439 aa33.52■■■□□ 2.96
CAPNS1-212ENST00000591041 PREX2Q70Z35 1606 aa33.5■■■□□ 2.95
CAPNS1-212ENST00000591041 CLSPNQ9HAW4 1339 aa33.5■■■□□ 2.95
CAPNS1-212ENST00000591041 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP33.5■■■□□ 2.95
CAPNS1-212ENST00000591041 RSPH4AQ5TD94 716 aa33.49■■■□□ 2.95
CAPNS1-212ENST00000591041 HFM1A2PYH4 1435 aa33.48■■■□□ 2.95
CAPNS1-212ENST00000591041 KCNH8Q96L42 1107 aa33.48■■■□□ 2.95
CAPNS1-212ENST00000591041 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa33.48■■■□□ 2.95
CAPNS1-212ENST00000591041 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.48■■■□□ 2.956e-24■■□□□ 13
CAPNS1-212ENST00000591041 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.48■■■□□ 2.95
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP33.47■■■□□ 2.95
CAPNS1-212ENST00000591041 MAPKBP1O60336 1514 aa33.47■■■□□ 2.95
CAPNS1-212ENST00000591041 DAPK1P53355 1430 aa33.46■■■□□ 2.95
CAPNS1-212ENST00000591041 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa33.46■■■□□ 2.95
CAPNS1-212ENST00000591041 ROCK1Q13464 1354 aa33.45■■■□□ 2.94
CAPNS1-212ENST00000591041 ARHGAP5Q13017 1502 aa33.43■■■□□ 2.94
CAPNS1-212ENST00000591041 DIP2BQ9P265 1576 aa33.43■■■□□ 2.94
CAPNS1-212ENST00000591041 ASXL2Q76L83 1435 aa33.41■■■□□ 2.94
CAPNS1-212ENST00000591041 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.4■■■□□ 2.94
CAPNS1-212ENST00000591041 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.4■■■□□ 2.94
CAPNS1-212ENST00000591041 PLCH2O75038 1416 aa33.38■■■□□ 2.93
CAPNS1-212ENST00000591041 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa33.38■■■□□ 2.93
CAPNS1-212ENST00000591041 ABCC5O15440 1437 aa33.37■■■□□ 2.93
CAPNS1-212ENST00000591041 PTPRKQ15262 1439 aa33.36■■■□□ 2.93
CAPNS1-212ENST00000591041 ARHGEF5Q12774 1597 aa33.35■■■□□ 2.93
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP33.35■■■□□ 2.93
CAPNS1-212ENST00000591041 TSPY4P0CV99 314 aa33.35■■■□□ 2.93
CAPNS1-212ENST00000591041 TSPY10P0CW01 314 aa33.35■■■□□ 2.93
CAPNS1-212ENST00000591041 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa33.35■■■□□ 2.93
CAPNS1-212ENST00000591041 SHANK2Q9UPX8 1470 aa33.35■■■□□ 2.93
CAPNS1-212ENST00000591041 KDM6BO15054 1643 aa33.34■■■□□ 2.93
CAPNS1-212ENST00000591041 GCC2Q8IWJ2 1684 aa33.33■■■□□ 2.93
CAPNS1-212ENST00000591041 NAIPQ13075 1403 aa33.32■■■□□ 2.92
CAPNS1-212ENST00000591041 TSPOAP1O95153 1857 aa33.31■■■□□ 2.92
CAPNS1-212ENST00000591041 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa33.31■■■□□ 2.92
CAPNS1-212ENST00000591041 ADGBQ8N7X0 1667 aa33.31■■■□□ 2.92
CAPNS1-212ENST00000591041 CROCC2H7BZ55 1655 aa33.3■■■□□ 2.92
CAPNS1-212ENST00000591041 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.3■■■□□ 2.92
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa33.3■■■□□ 2.92
CAPNS1-212ENST00000591041 CHIC2Q9UKJ5 165 aa33.29■■■□□ 2.92
CAPNS1-212ENST00000591041 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP33.29■■■□□ 2.92
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC141Q6ZP82 1450 aa33.27■■■□□ 2.92
CAPNS1-212ENST00000591041 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa33.26■■■□□ 2.91
CAPNS1-212ENST00000591041 ADGRL2O95490 1459 aa33.25■■■□□ 2.91
CAPNS1-212ENST00000591041 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa33.22■■■□□ 2.91
CAPNS1-212ENST00000591041 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa33.22■■■□□ 2.91
CAPNS1-212ENST00000591041 C9orf84Q5VXU9 1444 aa33.19■■■□□ 2.9
CAPNS1-212ENST00000591041 CFAP74Q9C0B2 1584 aa33.17■■■□□ 2.9
CAPNS1-212ENST00000591041 MBD5Q9P267 1494 aa33.17■■■□□ 2.9
CAPNS1-212ENST00000591041 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP33.16■■■□□ 2.9
CAPNS1-212ENST00000591041 NCOA1Q15788 1441 aa33.16■■■□□ 2.9
CAPNS1-212ENST00000591041 SYCP2Q9BX26 1530 aa33.14■■■□□ 2.9
CAPNS1-212ENST00000591041 MAST1Q9Y2H9 1570 aa33.13■■■□□ 2.89
CAPNS1-212ENST00000591041 FANCAO15360 1455 aa33.12■■■□□ 2.89
CAPNS1-212ENST00000591041 ABCC1P33527 1531 aa33.11■■■□□ 2.89
CAPNS1-212ENST00000591041 CD109Q6YHK3 1445 aa33.08■■■□□ 2.89
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM52Q96A61 297 aa33.05■■■□□ 2.88
CAPNS1-212ENST00000591041 GLI2P10070 1586 aa33.02■■■□□ 2.88
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa33.01■■■□□ 2.87
CAPNS1-212ENST00000591041 KIF15Q9NS87 1388 aa33■■■□□ 2.87
CAPNS1-212ENST00000591041 ADGRL1O94910 1474 aa32.99■■■□□ 2.87
CAPNS1-212ENST00000591041 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa32.98■■■□□ 2.87
CAPNS1-212ENST00000591041 PLXNC1O60486 1568 aa32.98■■■□□ 2.87
CAPNS1-212ENST00000591041 NEO1Q92859 1461 aa32.95■■■□□ 2.87
CAPNS1-212ENST00000591041 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP32.94■■■□□ 2.86
CAPNS1-212ENST00000591041 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa32.93■■■□□ 2.86
CAPNS1-212ENST00000591041 SCAPERQ9BY12 1400 aa32.92■■■□□ 2.86
CAPNS1-212ENST00000591041 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa32.91■■■□□ 2.86
CAPNS1-212ENST00000591041 DUOX2Q9NRD8 1548 aa32.9■■■□□ 2.86
CAPNS1-212ENST00000591041 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP32.89■■■□□ 2.86
CAPNS1-212ENST00000591041 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa32.87■■■□□ 2.85
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa32.86■■■□□ 2.85
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa32.86■■■□□ 2.85
CAPNS1-212ENST00000591041 MPHOSPH9Q99550 1183 aa32.85■■■□□ 2.85
CAPNS1-212ENST00000591041 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP32.84■■■□□ 2.85
CAPNS1-212ENST00000591041 ERBINQ96RT1 1412 aa32.84■■■□□ 2.85
CAPNS1-212ENST00000591041 MYT1LQ9UL68 1186 aa32.81■■■□□ 2.84
CAPNS1-212ENST00000591041 TEX14Q8IWB6 1497 aa32.8■■■□□ 2.84
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP32.8■■■□□ 2.84
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP7AQ04656 1500 aa32.77■■■□□ 2.84
CAPNS1-212ENST00000591041 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa32.77■■■□□ 2.84
CAPNS1-212ENST00000591041 AFAP1Q8N556 730 aa32.76■■■□□ 2.83
CAPNS1-212ENST00000591041 KDM5DQ9BY66 1539 aa32.76■■■□□ 2.83
CAPNS1-212ENST00000591041 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP32.75■■■□□ 2.83
CAPNS1-212ENST00000591041 POGZQ7Z3K3 1410 aa32.75■■■□□ 2.83
CAPNS1-212ENST00000591041 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP32.74■■■□□ 2.83
CAPNS1-212ENST00000591041 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP32.74■■■□□ 2.83
CAPNS1-212ENST00000591041 NUP155O75694 1391 aa32.73■■■□□ 2.83
CAPNS1-212ENST00000591041 NEUROD1Q13562 356 aa32.68■■■□□ 2.82
CAPNS1-212ENST00000591041 TONSLQ96HA7 1378 aa32.68■■■□□ 2.82
CAPNS1-212ENST00000591041 KDM5CP41229 1560 aa32.67■■■□□ 2.82
CAPNS1-212ENST00000591041 MLH3Q9UHC1 1453 aa32.67■■■□□ 2.82
CAPNS1-212ENST00000591041 UNC13BO14795 1591 aa32.66■■■□□ 2.82
CAPNS1-212ENST00000591041 PZPP20742 1482 aa32.66■■■□□ 2.82
CAPNS1-212ENST00000591041 HECW2Q9P2P5 1572 aa32.63■■■□□ 2.81
CAPNS1-212ENST00000591041 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP32.62■■■□□ 2.81
CAPNS1-212ENST00000591041 KANK1Q14678 1352 aa32.6■■■□□ 2.81
CAPNS1-212ENST00000591041 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP32.6■■■□□ 2.81
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