RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590466.2

UBXN6-206, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN6, Length 803 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-206ENST00000590466 MTUS2Q5JR59 1369 aa32.22■■■□□ 2.75
UBXN6-206ENST00000590466 ARHGAP5Q13017 1502 aa32.22■■■□□ 2.75
UBXN6-206ENST00000590466 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa32.2■■■□□ 2.74
UBXN6-206ENST00000590466 PREX2Q70Z35 1606 aa32.18■■■□□ 2.74
UBXN6-206ENST00000590466 POGZQ7Z3K3 1410 aa32.17■■■□□ 2.74
UBXN6-206ENST00000590466 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa32.16■■■□□ 2.74
UBXN6-206ENST00000590466 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
UBXN6-206ENST00000590466 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa32.14■■■□□ 2.74
UBXN6-206ENST00000590466 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa32.13■■■□□ 2.73
UBXN6-206ENST00000590466 TIAM1Q13009 1591 aa32.1■■■□□ 2.73
UBXN6-206ENST00000590466 MAGI2Q86UL8 1455 aa32.1■■■□□ 2.73
UBXN6-206ENST00000590466 CCNB3Q8WWL7 1395 aa32.07■■■□□ 2.73
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UBXN6-206ENST00000590466 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa32.07■■■□□ 2.72
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UBXN6-206ENST00000590466 YEATS2Q9ULM3 1422 aa32.06■■■□□ 2.72
UBXN6-206ENST00000590466 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa32.05■■■□□ 2.72
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UBXN6-206ENST00000590466 MAP3K1Q13233 1512 aa32.04■■■□□ 2.72
UBXN6-206ENST00000590466 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa32.03■■■□□ 2.72
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UBXN6-206ENST00000590466 KDM5CP41229 1560 aa32.02■■■□□ 2.72
UBXN6-206ENST00000590466 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa32.01■■■□□ 2.72
UBXN6-206ENST00000590466 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32■■■□□ 2.71
UBXN6-206ENST00000590466 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.99■■■□□ 2.71
UBXN6-206ENST00000590466 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.99■■■□□ 2.71
UBXN6-206ENST00000590466 NCOA2Q15596 1464 aa31.97■■■□□ 2.71
UBXN6-206ENST00000590466 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.97■■■□□ 2.71
UBXN6-206ENST00000590466 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.95■■■□□ 2.71
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UBXN6-206ENST00000590466 ATP10AO60312 1499 aa31.91■■■□□ 2.7
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UBXN6-206ENST00000590466 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.9■■■□□ 2.7
UBXN6-206ENST00000590466 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.89■■■□□ 2.7
UBXN6-206ENST00000590466 HECW2Q9P2P5 1572 aa31.89■■■□□ 2.7
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UBXN6-206ENST00000590466 ADAMTSL3P82987 1691 aa31.88■■■□□ 2.69
UBXN6-206ENST00000590466 BCORL1Q5H9F3 1711 aa31.86■■■□□ 2.69
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UBXN6-206ENST00000590466 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa31.79■■■□□ 2.68
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UBXN6-206ENST00000590466 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP31.69■■■□□ 2.66
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UBXN6-206ENST00000590466 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31.64■■■□□ 2.66
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UBXN6-206ENST00000590466 ADGBQ8N7X0 1667 aa31.48■■■□□ 2.63
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UBXN6-206ENST00000590466 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.46■■■□□ 2.63
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UBXN6-206ENST00000590466 ZMYM3Q14202 1370 aa31.29■■■□□ 2.6
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UBXN6-206ENST00000590466 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
UBXN6-206ENST00000590466 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
UBXN6-206ENST00000590466 KIF15Q9NS87 1388 aa31.22■■■□□ 2.59
UBXN6-206ENST00000590466 DUOX2Q9NRD8 1548 aa31.22■■■□□ 2.59
UBXN6-206ENST00000590466 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa31.2■■■□□ 2.59
UBXN6-206ENST00000590466 NPATQ14207 1427 aa31.18■■■□□ 2.58
UBXN6-206ENST00000590466 HSPA2P54652 639 aa31.18■■■□□ 2.58
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