RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589649.1

TOMM40-205, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

TSL 2

Gene TOMM40, Length 731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-205ENST00000589649 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.74■■■■□ 3.95
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TOMM40-205ENST00000589649 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.72■■■■□ 3.95
TOMM40-205ENST00000589649 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.7■■■■□ 3.95
TOMM40-205ENST00000589649 BCORL1Q5H9F3 1711 aa39.69■■■■□ 3.94
TOMM40-205ENST00000589649 HECW2Q9P2P5 1572 aa39.69■■■■□ 3.94
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TOMM40-205ENST00000589649 MAGI2Q86UL8 1455 aa39.65■■■■□ 3.94
TOMM40-205ENST00000589649 AFAP1Q8N556 730 aa39.62■■■■□ 3.93
TOMM40-205ENST00000589649 MADDQ8WXG6 1647 aa39.62■■■■□ 3.93
TOMM40-205ENST00000589649 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa39.6■■■■□ 3.93
TOMM40-205ENST00000589649 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.6■■■■□ 3.93
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TOMM40-205ENST00000589649 CEP162Q5TB80 1403 aa39.54■■■■□ 3.92
TOMM40-205ENST00000589649 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa39.53■■■■□ 3.92
TOMM40-205ENST00000589649 PREX2Q70Z35 1606 aa39.53■■■■□ 3.92
TOMM40-205ENST00000589649 ATP10AO60312 1499 aa39.51■■■■□ 3.92
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TOMM40-205ENST00000589649 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa39.5■■■■□ 3.91
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TOMM40-205ENST00000589649 MLH3Q9UHC1 1453 aa39.34■■■■□ 3.89
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TOMM40-205ENST00000589649 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa39.31■■■■□ 3.88
TOMM40-205ENST00000589649 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP39.31■■■■□ 3.88
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TOMM40-205ENST00000589649 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa39.26■■■■□ 3.88
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TOMM40-205ENST00000589649 LMTK3Q96Q04 1460 aa39.24■■■■□ 3.87
TOMM40-205ENST00000589649 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.2■■■■□ 3.87
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TOMM40-205ENST00000589649 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.19■■■■□ 3.86
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TOMM40-205ENST00000589649 REREQ9P2R6 1566 aa39.17■■■■□ 3.86
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TOMM40-205ENST00000589649 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa39.14■■■■□ 3.86
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TOMM40-205ENST00000589649 C3P01024 1663 aa38.87■■■■□ 3.81
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TOMM40-205ENST00000589649 PLXNC1O60486 1568 aa38.85■■■■□ 3.81
TOMM40-205ENST00000589649 CNTLNQ9NXG0 1405 aa38.82■■■■□ 3.81
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TOMM40-205ENST00000589649 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa38.8■■■■□ 3.8
TOMM40-205ENST00000589649 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa38.79■■■■□ 3.8
TOMM40-205ENST00000589649 CCDC141Q6ZP82 1450 aa38.78■■■■□ 3.8
TOMM40-205ENST00000589649 MAP3K1Q13233 1512 aa38.76■■■■□ 3.8
TOMM40-205ENST00000589649 ZMYM3Q14202 1370 aa38.76■■■■□ 3.8
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TOMM40-205ENST00000589649 MROH2AA6NES4 1674 aa38.66■■■■□ 3.78
TOMM40-205ENST00000589649 KIF3BO15066 747 aa38.64■■■■□ 3.78
TOMM40-205ENST00000589649 TSPY4P0CV99 314 aa38.64■■■■□ 3.78
TOMM40-205ENST00000589649 TSPY10P0CW01 314 aa38.64■■■■□ 3.78
TOMM40-205ENST00000589649 ARHGEF5Q12774 1597 aa38.64■■■■□ 3.78
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TOMM40-205ENST00000589649 MYOM3Q5VTT5 1437 aa38.63■■■■□ 3.77
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TOMM40-205ENST00000589649 STRCQ7RTU9 1775 aa38.59■■■■□ 3.77
TOMM40-205ENST00000589649 PPP6R1Q9UPN7 881 aa38.59■■■■□ 3.77
TOMM40-205ENST00000589649 PTPRKQ15262 1439 aa38.55■■■■□ 3.76
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TOMM40-205ENST00000589649 DMRT2Q9Y5R5 561 aa38.51■■■■□ 3.76
TOMM40-205ENST00000589649 CERKQ8TCT0 537 aa38.47■■■■□ 3.75
TOMM40-205ENST00000589649 MAST1Q9Y2H9 1570 aa38.44■■■■□ 3.74
TOMM40-205ENST00000589649 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa38.43■■■■□ 3.74
TOMM40-205ENST00000589649 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP38.43■■■■□ 3.74
TOMM40-205ENST00000589649 NCOA1Q15788 1441 aa38.43■■■■□ 3.74
TOMM40-205ENST00000589649 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa38.41■■■■□ 3.74
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