RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589631.5

GIPC1-211, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3

Gene GIPC1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-211ENST00000589631 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa32.4■■■□□ 2.78
GIPC1-211ENST00000589631 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.39■■■□□ 2.78
GIPC1-211ENST00000589631 POGZQ7Z3K3 1410 aa32.39■■■□□ 2.78
GIPC1-211ENST00000589631 MAGI2Q86UL8 1455 aa32.39■■■□□ 2.78
GIPC1-211ENST00000589631 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa32.38■■■□□ 2.77
GIPC1-211ENST00000589631 PREX2Q70Z35 1606 aa32.35■■■□□ 2.77
GIPC1-211ENST00000589631 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa32.32■■■□□ 2.76
GIPC1-211ENST00000589631 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa32.31■■■□□ 2.76
GIPC1-211ENST00000589631 ADAMTSL3P82987 1691 aa32.29■■■□□ 2.76
GIPC1-211ENST00000589631 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
GIPC1-211ENST00000589631 YEATS2Q9ULM3 1422 aa32.28■■■□□ 2.76
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa32.28■■■□□ 2.76
GIPC1-211ENST00000589631 BCORL1Q5H9F3 1711 aa32.27■■■□□ 2.76
GIPC1-211ENST00000589631 MTUS2Q5JR59 1369 aa32.26■■■□□ 2.75
GIPC1-211ENST00000589631 AFAP1Q8N556 730 aa32.23■■■□□ 2.75
GIPC1-211ENST00000589631 KDM5CP41229 1560 aa32.23■■■□□ 2.75
GIPC1-211ENST00000589631 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
GIPC1-211ENST00000589631 ABCC1P33527 1531 aa32.21■■■□□ 2.75
GIPC1-211ENST00000589631 ATP10AO60312 1499 aa32.19■■■□□ 2.74
GIPC1-211ENST00000589631 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa32.17■■■□□ 2.74
GIPC1-211ENST00000589631 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa32.16■■■□□ 2.74
GIPC1-211ENST00000589631 ITSN2Q9NZM3 1697 aa32.16■■■□□ 2.74
GIPC1-211ENST00000589631 CCNB3Q8WWL7 1395 aa32.16■■■□□ 2.74
GIPC1-211ENST00000589631 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa32.15■■■□□ 2.74
GIPC1-211ENST00000589631 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.15■■■□□ 2.74
GIPC1-211ENST00000589631 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa32.14■■■□□ 2.74
GIPC1-211ENST00000589631 PTPRMP28827 1452 aa32.14■■■□□ 2.74
GIPC1-211ENST00000589631 HECW2Q9P2P5 1572 aa32.13■■■□□ 2.73
GIPC1-211ENST00000589631 MLH3Q9UHC1 1453 aa32.13■■■□□ 2.73
GIPC1-211ENST00000589631 MADDQ8WXG6 1647 aa32.12■■■□□ 2.73
GIPC1-211ENST00000589631 C9orf84Q5VXU9 1444 aa32.12■■■□□ 2.73
GIPC1-211ENST00000589631 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
GIPC1-211ENST00000589631 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa32.11■■■□□ 2.73
GIPC1-211ENST00000589631 MYT1LQ9UL68 1186 aa32.09■■■□□ 2.73
GIPC1-211ENST00000589631 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa32.06■■■□□ 2.72
GIPC1-211ENST00000589631 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa32.06■■■□□ 2.72
GIPC1-211ENST00000589631 TIAM1Q13009 1591 aa32.06■■■□□ 2.72
GIPC1-211ENST00000589631 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa32.05■■■□□ 2.72
GIPC1-211ENST00000589631 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
GIPC1-211ENST00000589631 SYCP2Q9BX26 1530 aa32.03■■■□□ 2.72
GIPC1-211ENST00000589631 REREQ9P2R6 1566 aa32.02■■■□□ 2.72
GIPC1-211ENST00000589631 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP32.02■■■□□ 2.72
GIPC1-211ENST00000589631 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP32.01■■■□□ 2.72
GIPC1-211ENST00000589631 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa32.01■■■□□ 2.71
GIPC1-211ENST00000589631 ABCA6Q8N139 1617 aa32■■■□□ 2.71
GIPC1-211ENST00000589631 MLECQ14165 292 aa32■■■□□ 2.71
GIPC1-211ENST00000589631 MAP3K1Q13233 1512 aa31.98■■■□□ 2.71
GIPC1-211ENST00000589631 NCOA2Q15596 1464 aa31.97■■■□□ 2.71
GIPC1-211ENST00000589631 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa31.96■■■□□ 2.71
GIPC1-211ENST00000589631 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP31.95■■■□□ 2.7
GIPC1-211ENST00000589631 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.94■■■□□ 2.7
GIPC1-211ENST00000589631 AGLP35573 1532 aa31.93■■■□□ 2.7
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.92■■■□□ 2.7
GIPC1-211ENST00000589631 ATP7AQ04656 1500 aa31.87■■■□□ 2.69
GIPC1-211ENST00000589631 MBD5Q9P267 1494 aa31.87■■■□□ 2.69
GIPC1-211ENST00000589631 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP31.85■■■□□ 2.69
GIPC1-211ENST00000589631 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.84■■■□□ 2.69
GIPC1-211ENST00000589631 RSPH4AQ5TD94 716 aa31.8■■■□□ 2.68
GIPC1-211ENST00000589631 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa31.78■■■□□ 2.68
GIPC1-211ENST00000589631 PLPPR3Q6T4P5 718 aa31.78■■■□□ 2.68
GIPC1-211ENST00000589631 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa31.77■■■□□ 2.68
GIPC1-211ENST00000589631 APLP2Q06481 763 aa31.77■■■□□ 2.68
GIPC1-211ENST00000589631 LMTK3Q96Q04 1460 aa31.77■■■□□ 2.68
GIPC1-211ENST00000589631 A2MP01023 1474 aa31.75■■■□□ 2.67
GIPC1-211ENST00000589631 ADGBQ8N7X0 1667 aa31.73■■■□□ 2.67
GIPC1-211ENST00000589631 PLXNC1O60486 1568 aa31.73■■■□□ 2.67
GIPC1-211ENST00000589631 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31.73■■■□□ 2.67
GIPC1-211ENST00000589631 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
GIPC1-211ENST00000589631 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP31.71■■■□□ 2.67
GIPC1-211ENST00000589631 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP31.7■■■□□ 2.66
GIPC1-211ENST00000589631 ARHGEF5Q12774 1597 aa31.69■■■□□ 2.66
GIPC1-211ENST00000589631 MIA2Q96PC5 1412 aa31.69■■■□□ 2.66
GIPC1-211ENST00000589631 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.68■■■□□ 2.66
GIPC1-211ENST00000589631 CNTLNQ9NXG0 1405 aa31.68■■■□□ 2.66
GIPC1-211ENST00000589631 C3P01024 1663 aa31.65■■■□□ 2.66
GIPC1-211ENST00000589631 TSPY4P0CV99 314 aa31.63■■■□□ 2.65
GIPC1-211ENST00000589631 TSPY10P0CW01 314 aa31.63■■■□□ 2.65
GIPC1-211ENST00000589631 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
GIPC1-211ENST00000589631 PREX1Q8TCU6 1659 aa31.62■■■□□ 2.65
GIPC1-211ENST00000589631 PPP6R1Q9UPN7 881 aa31.6■■■□□ 2.65
GIPC1-211ENST00000589631 MROH2AA6NES4 1674 aa31.6■■■□□ 2.65
GIPC1-211ENST00000589631 HSPA2P54652 639 aa31.58■■■□□ 2.65
GIPC1-211ENST00000589631 GGT6Q6P531 493 aa31.57■■■□□ 2.64
GIPC1-211ENST00000589631 MAST1Q9Y2H9 1570 aa31.54■■■□□ 2.64
GIPC1-211ENST00000589631 ZMYM3Q14202 1370 aa31.54■■■□□ 2.64
GIPC1-211ENST00000589631 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP31.52■■■□□ 2.64
GIPC1-211ENST00000589631 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa31.51■■■□□ 2.64
GIPC1-211ENST00000589631 KIF3BO15066 747 aa31.48■■■□□ 2.63
GIPC1-211ENST00000589631 NPATQ14207 1427 aa31.48■■■□□ 2.63
GIPC1-211ENST00000589631 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.47■■■□□ 2.63
GIPC1-211ENST00000589631 FGD6Q6ZV73 1430 aa31.44■■■□□ 2.62
GIPC1-211ENST00000589631 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
GIPC1-211ENST00000589631 FAM135AQ9P2D6 1515 aa31.4■■■□□ 2.62
GIPC1-211ENST00000589631 ABCC5O15440 1437 aa31.38■■■□□ 2.61
GIPC1-211ENST00000589631 PTPRKQ15262 1439 aa31.37■■■□□ 2.61
GIPC1-211ENST00000589631 SHANK2Q9UPX8 1470 aa31.37■■■□□ 2.61
GIPC1-211ENST00000589631 CROCC2H7BZ55 1655 aa31.37■■■□□ 2.61
GIPC1-211ENST00000589631 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
GIPC1-211ENST00000589631 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 166.7 ms