RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589530.5

KDSR-208, Transcript of 3-ketodihydrosphingosine reductase, human

TSL 2

Gene KDSR, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KDSR-208	ENST00000589530	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		32.43	■■■□□ 2.78
KDSR-208	ENST00000589530	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		32.43	■■■□□ 2.78
KDSR-208	ENST00000589530	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		32.42	■■■□□ 2.78
KDSR-208	ENST00000589530	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		32.42	■■■□□ 2.78
KDSR-208	ENST00000589530	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		32.41	■■■□□ 2.78
KDSR-208	ENST00000589530	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		32.41	■■■□□ 2.78
KDSR-208	ENST00000589530	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		32.4	■■■□□ 2.78
KDSR-208	ENST00000589530	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		32.4	■■■□□ 2.78
KDSR-208	ENST00000589530	PTPRM	P28827	1452 aa		32.38	■■■□□ 2.77
KDSR-208	ENST00000589530	MADD	Q8WXG6	1647 aa		32.32	■■■□□ 2.76
KDSR-208	ENST00000589530	AFAP1	Q8N556	730 aa		32.31	■■■□□ 2.76
KDSR-208	ENST00000589530	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		32.31	■■■□□ 2.76
KDSR-208	ENST00000589530	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		32.28	■■■□□ 2.76
KDSR-208	ENST00000589530	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		32.28	■■■□□ 2.76
KDSR-208	ENST00000589530	ATP10A	O60312	1499 aa		32.26	■■■□□ 2.75
KDSR-208	ENST00000589530	PREX2	Q70Z35	1606 aa		32.26	■■■□□ 2.75
KDSR-208	ENST00000589530	MLEC	Q14165	292 aa		32.23	■■■□□ 2.75
KDSR-208	ENST00000589530	KDM5C	P41229	1560 aa		32.21	■■■□□ 2.75
KDSR-208	ENST00000589530	CEP162	Q5TB80	1403 aa		32.2	■■■□□ 2.75
KDSR-208	ENST00000589530	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		32.2	■■■□□ 2.75
KDSR-208	ENST00000589530	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		32.2	■■■□□ 2.75
KDSR-208	ENST00000589530	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.74
KDSR-208	ENST00000589530	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		32.2	■■■□□ 2.74
KDSR-208	ENST00000589530	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		32.19	■■■□□ 2.74
KDSR-208	ENST00000589530	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		32.17	■■■□□ 2.74
KDSR-208	ENST00000589530	ABCC1	P33527	1531 aa		32.16	■■■□□ 2.74
KDSR-208	ENST00000589530	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
KDSR-208	ENST00000589530	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	32.14	■■■□□ 2.74
KDSR-208	ENST00000589530	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		32.13	■■■□□ 2.73
KDSR-208	ENST00000589530	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		32.12	■■■□□ 2.73
KDSR-208	ENST00000589530	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		32.12	■■■□□ 2.73
KDSR-208	ENST00000589530	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		32.11	■■■□□ 2.73
KDSR-208	ENST00000589530	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		32.1	■■■□□ 2.73
KDSR-208	ENST00000589530	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		32.08	■■■□□ 2.73
KDSR-208	ENST00000589530	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		32.07	■■■□□ 2.72
KDSR-208	ENST00000589530	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	32.06	■■■□□ 2.72
KDSR-208	ENST00000589530	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		32.05	■■■□□ 2.72
KDSR-208	ENST00000589530	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		32.05	■■■□□ 2.72
KDSR-208	ENST00000589530	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	32.04	■■■□□ 2.72
KDSR-208	ENST00000589530	ABCA6	Q8N139	1617 aa		32.04	■■■□□ 2.72
KDSR-208	ENST00000589530	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		32.03	■■■□□ 2.72
KDSR-208	ENST00000589530	RERE	Q9P2R6	1566 aa		32.02	■■■□□ 2.72
KDSR-208	ENST00000589530	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		32	■■■□□ 2.71
KDSR-208	ENST00000589530	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		31.99	■■■□□ 2.71
KDSR-208	ENST00000589530	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		31.98	■■■□□ 2.71
KDSR-208	ENST00000589530	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		31.97	■■■□□ 2.71
KDSR-208	ENST00000589530	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	31.96	■■■□□ 2.71
KDSR-208	ENST00000589530	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	31.95	■■■□□ 2.71
KDSR-208	ENST00000589530	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		31.95	■■■□□ 2.7
KDSR-208	ENST00000589530	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	31.94	■■■□□ 2.7
KDSR-208	ENST00000589530	AGL	P35573	1532 aa		31.94	■■■□□ 2.7
KDSR-208	ENST00000589530	HSPA2	P54652	639 aa		31.92	■■■□□ 2.7
KDSR-208	ENST00000589530	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	31.92	■■■□□ 2.7
KDSR-208	ENST00000589530	TIAM1	Q13009	1591 aa		31.91	■■■□□ 2.7
KDSR-208	ENST00000589530	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		31.85	■■■□□ 2.69
KDSR-208	ENST00000589530	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	31.84	■■■□□ 2.69
KDSR-208	ENST00000589530	ATP7A	Q04656	1500 aa		31.83	■■■□□ 2.69
KDSR-208	ENST00000589530	NCOA2	Q15596	1464 aa		31.83	■■■□□ 2.69
KDSR-208	ENST00000589530	MBD5	Q9P267	1494 aa		31.8	■■■□□ 2.68
KDSR-208	ENST00000589530	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68
KDSR-208	ENST00000589530	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	31.78	■■■□□ 2.68
KDSR-208	ENST00000589530	A2M	P01023	1474 aa		31.75	■■■□□ 2.67
KDSR-208	ENST00000589530	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		31.74	■■■□□ 2.67
KDSR-208	ENST00000589530	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		31.73	■■■□□ 2.67
KDSR-208	ENST00000589530	C3	P01024	1663 aa		31.73	■■■□□ 2.67
KDSR-208	ENST00000589530	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		31.72	■■■□□ 2.67
KDSR-208	ENST00000589530	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
KDSR-208	ENST00000589530	PLXNC1	O60486	1568 aa		31.7	■■■□□ 2.67
KDSR-208	ENST00000589530	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	31.69	■■■□□ 2.66
KDSR-208	ENST00000589530	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		31.68	■■■□□ 2.66
KDSR-208	ENST00000589530	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		31.68	■■■□□ 2.66
KDSR-208	ENST00000589530	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		31.68	■■■□□ 2.66
KDSR-208	ENST00000589530	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		31.66	■■■□□ 2.66
KDSR-208	ENST00000589530	MAP3K1	Q13233	1512 aa		31.65	■■■□□ 2.66
KDSR-208	ENST00000589530	GGT6	Q6P531	493 aa		31.65	■■■□□ 2.66
KDSR-208	ENST00000589530	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		31.64	■■■□□ 2.66
KDSR-208	ENST00000589530	ZMYM3	Q14202	1370 aa		31.64	■■■□□ 2.66
KDSR-208	ENST00000589530	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		31.64	■■■□□ 2.66
KDSR-208	ENST00000589530	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	31.6	■■■□□ 2.65
KDSR-208	ENST00000589530	MROH2A	A6NES4	1674 aa		31.59	■■■□□ 2.65
KDSR-208	ENST00000589530	FBXO41	Q8TF61	875 aa		31.58	■■■□□ 2.65
KDSR-208	ENST00000589530	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		31.57	■■■□□ 2.64
KDSR-208	ENST00000589530	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	31.55	■■■□□ 2.64
KDSR-208	ENST00000589530	TSPY4	P0CV99	314 aa		31.55	■■■□□ 2.64
KDSR-208	ENST00000589530	TSPY10	P0CW01	314 aa		31.55	■■■□□ 2.64
KDSR-208	ENST00000589530	NPAT	Q14207	1427 aa		31.55	■■■□□ 2.64
KDSR-208	ENST00000589530	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		31.54	■■■□□ 2.64
KDSR-208	ENST00000589530	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		31.52	■■■□□ 2.64
KDSR-208	ENST00000589530	STRC	Q7RTU9	1775 aa		31.51	■■■□□ 2.64
KDSR-208	ENST00000589530	KIF3B	O15066	747 aa		31.51	■■■□□ 2.63
KDSR-208	ENST00000589530	APLP2	Q06481	763 aa		31.5	■■■□□ 2.63
KDSR-208	ENST00000589530	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		31.49	■■■□□ 2.63
KDSR-208	ENST00000589530	MIA2	Q96PC5	1412 aa		31.48	■■■□□ 2.63
KDSR-208	ENST00000589530	PTPRK	Q15262	1439 aa		31.46	■■■□□ 2.63
KDSR-208	ENST00000589530	CERK	Q8TCT0	537 aa		31.42	■■■□□ 2.62
KDSR-208	ENST00000589530	PTPRT	O14522	1441 aa		31.38	■■■□□ 2.61
KDSR-208	ENST00000589530	NCOA1	Q15788	1441 aa		31.38	■■■□□ 2.61
KDSR-208	ENST00000589530	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		31.38	■■■□□ 2.61
KDSR-208	ENST00000589530	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		31.36	■■■□□ 2.61
KDSR-208	ENST00000589530	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		31.35	■■■□□ 2.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.2 ms