RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589497.5

GIPC1-210, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 5

Gene GIPC1, Length 853 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-210ENST00000589497 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
GIPC1-210ENST00000589497 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.83■■■□□ 2.37
GIPC1-210ENST00000589497 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.81■■■□□ 2.36
GIPC1-210ENST00000589497 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-210ENST00000589497 APLP2Q06481 763 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-210ENST00000589497 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.78■■■□□ 2.36
GIPC1-210ENST00000589497 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
GIPC1-210ENST00000589497 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-210ENST00000589497 RICTORQ6R327 1708 aa29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-210ENST00000589497 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-210ENST00000589497 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-210ENST00000589497 PREX2Q70Z35 1606 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-210ENST00000589497 AFAP1Q8N556 730 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-210ENST00000589497 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
GIPC1-210ENST00000589497 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.71■■■□□ 2.35
GIPC1-210ENST00000589497 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.71■■■□□ 2.35
GIPC1-210ENST00000589497 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.7■■■□□ 2.35
GIPC1-210ENST00000589497 TIAM1Q13009 1591 aa29.69■■■□□ 2.34
GIPC1-210ENST00000589497 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.68■■■□□ 2.34
GIPC1-210ENST00000589497 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.67■■■□□ 2.34
GIPC1-210ENST00000589497 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.64■■■□□ 2.34
GIPC1-210ENST00000589497 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.64■■■□□ 2.34
GIPC1-210ENST00000589497 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.63■■■□□ 2.33
GIPC1-210ENST00000589497 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.61■■■□□ 2.33
GIPC1-210ENST00000589497 ABCC1P33527 1531 aa29.61■■■□□ 2.33
GIPC1-210ENST00000589497 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
GIPC1-210ENST00000589497 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
GIPC1-210ENST00000589497 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.6■■■□□ 2.33
GIPC1-210ENST00000589497 NCOA2Q15596 1464 aa29.6■■■□□ 2.33
GIPC1-210ENST00000589497 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.6■■■□□ 2.33
GIPC1-210ENST00000589497 MAP3K1Q13233 1512 aa29.6■■■□□ 2.33
GIPC1-210ENST00000589497 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.58■■■□□ 2.33
GIPC1-210ENST00000589497 ATP10AO60312 1499 aa29.57■■■□□ 2.32
GIPC1-210ENST00000589497 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.56■■■□□ 2.32
GIPC1-210ENST00000589497 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.55■■■□□ 2.32
GIPC1-210ENST00000589497 MLECQ14165 292 aa29.55■■■□□ 2.32
GIPC1-210ENST00000589497 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.55■■■□□ 2.32
GIPC1-210ENST00000589497 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
GIPC1-210ENST00000589497 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
GIPC1-210ENST00000589497 KDM5CP41229 1560 aa29.54■■■□□ 2.32
GIPC1-210ENST00000589497 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.53■■■□□ 2.32
GIPC1-210ENST00000589497 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.53■■■□□ 2.32
GIPC1-210ENST00000589497 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.52■■■□□ 2.32
GIPC1-210ENST00000589497 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.52■■■□□ 2.32
GIPC1-210ENST00000589497 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.46■■■□□ 2.31
GIPC1-210ENST00000589497 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.44■■■□□ 2.3
GIPC1-210ENST00000589497 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.42■■■□□ 2.3
GIPC1-210ENST00000589497 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.4■■■□□ 2.3
GIPC1-210ENST00000589497 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.4■■■□□ 2.3
GIPC1-210ENST00000589497 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.38■■■□□ 2.29
GIPC1-210ENST00000589497 TSPY4P0CV99 314 aa29.38■■■□□ 2.29
GIPC1-210ENST00000589497 TSPY10P0CW01 314 aa29.38■■■□□ 2.29
GIPC1-210ENST00000589497 PTPRMP28827 1452 aa29.37■■■□□ 2.29
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GIPC1-210ENST00000589497 ABCA6Q8N139 1617 aa29.37■■■□□ 2.29
GIPC1-210ENST00000589497 MBD5Q9P267 1494 aa29.36■■■□□ 2.29
GIPC1-210ENST00000589497 MADDQ8WXG6 1647 aa29.36■■■□□ 2.29
GIPC1-210ENST00000589497 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.36■■■□□ 2.29
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GIPC1-210ENST00000589497 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.34■■■□□ 2.29
GIPC1-210ENST00000589497 MIA2Q96PC5 1412 aa29.33■■■□□ 2.29
GIPC1-210ENST00000589497 REREQ9P2R6 1566 aa29.31■■■□□ 2.28
GIPC1-210ENST00000589497 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.31■■■□□ 2.28
GIPC1-210ENST00000589497 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
GIPC1-210ENST00000589497 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.28■■■□□ 2.28
GIPC1-210ENST00000589497 AGLP35573 1532 aa29.26■■■□□ 2.27
GIPC1-210ENST00000589497 A2MP01023 1474 aa29.26■■■□□ 2.27
GIPC1-210ENST00000589497 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
GIPC1-210ENST00000589497 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.23■■■□□ 2.27
GIPC1-210ENST00000589497 GGT6Q6P531 493 aa29.21■■■□□ 2.27
GIPC1-210ENST00000589497 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.21■■■□□ 2.27
GIPC1-210ENST00000589497 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
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GIPC1-210ENST00000589497 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.16■■■□□ 2.26
GIPC1-210ENST00000589497 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.14■■■□□ 2.26
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GIPC1-210ENST00000589497 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
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GIPC1-210ENST00000589497 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.04■■■□□ 2.24
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GIPC1-210ENST00000589497 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.03■■■□□ 2.24
GIPC1-210ENST00000589497 DAPK1P53355 1430 aa29.03■■■□□ 2.24
GIPC1-210ENST00000589497 ZMYM3Q14202 1370 aa29.01■■■□□ 2.24
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GIPC1-210ENST00000589497 HSPA2P54652 639 aa28.96■■■□□ 2.23
GIPC1-210ENST00000589497 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.96■■■□□ 2.23
GIPC1-210ENST00000589497 KIF15Q9NS87 1388 aa28.95■■■□□ 2.22
GIPC1-210ENST00000589497 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.95■■■□□ 2.22
GIPC1-210ENST00000589497 C3P01024 1663 aa28.95■■■□□ 2.22
GIPC1-210ENST00000589497 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
GIPC1-210ENST00000589497 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.93■■■□□ 2.22
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