RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589485.5

ILF3-215, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 2

Gene ILF3, Length 620 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-215	ENST00000589485	PREX2	Q70Z35	1606 aa		32.95	■■■□□ 2.87
ILF3-215	ENST00000589485	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		32.95	■■■□□ 2.86
ILF3-215	ENST00000589485	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		32.94	■■■□□ 2.86
ILF3-215	ENST00000589485	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		32.92	■■■□□ 2.86
ILF3-215	ENST00000589485	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		32.91	■■■□□ 2.86
ILF3-215	ENST00000589485	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		32.88	■■■□□ 2.85
ILF3-215	ENST00000589485	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		32.87	■■■□□ 2.85
ILF3-215	ENST00000589485	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		32.87	■■■□□ 2.85
ILF3-215	ENST00000589485	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		32.86	■■■□□ 2.85
ILF3-215	ENST00000589485	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		32.82	■■■□□ 2.84
ILF3-215	ENST00000589485	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		32.8	■■■□□ 2.84
ILF3-215	ENST00000589485	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		32.8	■■■□□ 2.84
ILF3-215	ENST00000589485	TIAM1	Q13009	1591 aa		32.79	■■■□□ 2.84
ILF3-215	ENST00000589485	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
ILF3-215	ENST00000589485	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		32.79	■■■□□ 2.84
ILF3-215	ENST00000589485	ABCC1	P33527	1531 aa		32.77	■■■□□ 2.84
ILF3-215	ENST00000589485	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
ILF3-215	ENST00000589485	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
ILF3-215	ENST00000589485	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		32.75	■■■□□ 2.83
ILF3-215	ENST00000589485	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		32.74	■■■□□ 2.83
ILF3-215	ENST00000589485	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
ILF3-215	ENST00000589485	AFAP1	Q8N556	730 aa		32.72	■■■□□ 2.83
ILF3-215	ENST00000589485	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	32.72	■■■□□ 2.83
ILF3-215	ENST00000589485	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		32.72	■■■□□ 2.83
ILF3-215	ENST00000589485	KDM5C	P41229	1560 aa		32.7	■■■□□ 2.83
ILF3-215	ENST00000589485	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		32.7	■■■□□ 2.83
ILF3-215	ENST00000589485	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		32.68	■■■□□ 2.82
ILF3-215	ENST00000589485	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		32.67	■■■□□ 2.82
ILF3-215	ENST00000589485	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		32.67	■■■□□ 2.82
ILF3-215	ENST00000589485	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		32.66	■■■□□ 2.82
ILF3-215	ENST00000589485	NCOA2	Q15596	1464 aa		32.64	■■■□□ 2.82
ILF3-215	ENST00000589485	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		32.64	■■■□□ 2.82
ILF3-215	ENST00000589485	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		32.64	■■■□□ 2.82
ILF3-215	ENST00000589485	MAP3K1	Q13233	1512 aa		32.63	■■■□□ 2.81
ILF3-215	ENST00000589485	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		32.62	■■■□□ 2.81
ILF3-215	ENST00000589485	ATP10A	O60312	1499 aa		32.62	■■■□□ 2.81
ILF3-215	ENST00000589485	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		32.62	■■■□□ 2.81
ILF3-215	ENST00000589485	APLP2	Q06481	763 aa		32.6	■■■□□ 2.81
ILF3-215	ENST00000589485	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		32.6	■■■□□ 2.81
ILF3-215	ENST00000589485	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		32.6	■■■□□ 2.81
ILF3-215	ENST00000589485	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	32.58	■■■□□ 2.81	5e-6	■■□□□ 11.8
ILF3-215	ENST00000589485	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		32.58	■■■□□ 2.81
ILF3-215	ENST00000589485	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		32.56	■■■□□ 2.8
ILF3-215	ENST00000589485	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		32.56	■■■□□ 2.8
ILF3-215	ENST00000589485	ABCA6	Q8N139	1617 aa		32.55	■■■□□ 2.8
ILF3-215	ENST00000589485	MADD	Q8WXG6	1647 aa		32.55	■■■□□ 2.8
ILF3-215	ENST00000589485	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
ILF3-215	ENST00000589485	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		32.52	■■■□□ 2.8
ILF3-215	ENST00000589485	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.79
ILF3-215	ENST00000589485	MLEC	Q14165	292 aa		32.5	■■■□□ 2.79
ILF3-215	ENST00000589485	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
ILF3-215	ENST00000589485	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
ILF3-215	ENST00000589485	PTPRM	P28827	1452 aa		32.47	■■■□□ 2.79
ILF3-215	ENST00000589485	RERE	Q9P2R6	1566 aa		32.45	■■■□□ 2.79
ILF3-215	ENST00000589485	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		32.44	■■■□□ 2.78
ILF3-215	ENST00000589485	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		32.44	■■■□□ 2.78
ILF3-215	ENST00000589485	ATP7A	Q04656	1500 aa		32.43	■■■□□ 2.78
ILF3-215	ENST00000589485	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
ILF3-215	ENST00000589485	MBD5	Q9P267	1494 aa		32.4	■■■□□ 2.78
ILF3-215	ENST00000589485	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		32.35	■■■□□ 2.77
ILF3-215	ENST00000589485	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		32.35	■■■□□ 2.77
ILF3-215	ENST00000589485	AGL	P35573	1532 aa		32.34	■■■□□ 2.77
ILF3-215	ENST00000589485	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		32.33	■■■□□ 2.77
ILF3-215	ENST00000589485	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		32.3	■■■□□ 2.76
ILF3-215	ENST00000589485	MIA2	Q96PC5	1412 aa		32.3	■■■□□ 2.76
ILF3-215	ENST00000589485	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.3	■■■□□ 2.76
ILF3-215	ENST00000589485	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		32.29	■■■□□ 2.76
ILF3-215	ENST00000589485	A2M	P01023	1474 aa		32.27	■■■□□ 2.76
ILF3-215	ENST00000589485	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		32.26	■■■□□ 2.76
ILF3-215	ENST00000589485	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
ILF3-215	ENST00000589485	PLXNC1	O60486	1568 aa		32.23	■■■□□ 2.75
ILF3-215	ENST00000589485	TSPY4	P0CV99	314 aa		32.22	■■■□□ 2.75
ILF3-215	ENST00000589485	TSPY10	P0CW01	314 aa		32.22	■■■□□ 2.75
ILF3-215	ENST00000589485	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		32.18	■■■□□ 2.74
ILF3-215	ENST00000589485	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		32.14	■■■□□ 2.74
ILF3-215	ENST00000589485	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		32.12	■■■□□ 2.73
ILF3-215	ENST00000589485	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
ILF3-215	ENST00000589485	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	32.12	■■■□□ 2.73
ILF3-215	ENST00000589485	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.1	■■■□□ 2.73
ILF3-215	ENST00000589485	GGT6	Q6P531	493 aa		32.1	■■■□□ 2.73
ILF3-215	ENST00000589485	C3	P01024	1663 aa		32.1	■■■□□ 2.73
ILF3-215	ENST00000589485	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		32.06	■■■□□ 2.72
ILF3-215	ENST00000589485	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
ILF3-215	ENST00000589485	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
ILF3-215	ENST00000589485	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		32.05	■■■□□ 2.72
ILF3-215	ENST00000589485	MROH2A	A6NES4	1674 aa		32.05	■■■□□ 2.72
ILF3-215	ENST00000589485	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		32.02	■■■□□ 2.72
ILF3-215	ENST00000589485	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
ILF3-215	ENST00000589485	KIF3B	O15066	747 aa		32.02	■■■□□ 2.72
ILF3-215	ENST00000589485	ABCC5	O15440	1437 aa		32	■■■□□ 2.71
ILF3-215	ENST00000589485	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
ILF3-215	ENST00000589485	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		31.99	■■■□□ 2.71
ILF3-215	ENST00000589485	DAPK1	P53355	1430 aa		31.99	■■■□□ 2.71
ILF3-215	ENST00000589485	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		31.97	■■■□□ 2.71
ILF3-215	ENST00000589485	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	31.96	■■■□□ 2.71
ILF3-215	ENST00000589485	ZMYM3	Q14202	1370 aa		31.95	■■■□□ 2.71
ILF3-215	ENST00000589485	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	31.95	■■■□□ 2.71
ILF3-215	ENST00000589485	HSPA2	P54652	639 aa		31.92	■■■□□ 2.7
ILF3-215	ENST00000589485	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		31.92	■■■□□ 2.7
ILF3-215	ENST00000589485	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		31.91	■■■□□ 2.7

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