RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589469.5

PSME3-209, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 3

Gene PSME3, Length 733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-209	ENST00000589469	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	31.86	■■■□□ 2.69
PSME3-209	ENST00000589469	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PSME3-209	ENST00000589469	RICTOR	Q6R327	1708 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PSME3-209	ENST00000589469	PREX2	Q70Z35	1606 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PSME3-209	ENST00000589469	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PSME3-209	ENST00000589469	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PSME3-209	ENST00000589469	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PSME3-209	ENST00000589469	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PSME3-209	ENST00000589469	TIAM1	Q13009	1591 aa		31.77	■■■□□ 2.68
PSME3-209	ENST00000589469	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	31.76	■■■□□ 2.68
PSME3-209	ENST00000589469	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		31.76	■■■□□ 2.67
PSME3-209	ENST00000589469	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PSME3-209	ENST00000589469	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PSME3-209	ENST00000589469	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		31.72	■■■□□ 2.67
PSME3-209	ENST00000589469	ABCC1	P33527	1531 aa		31.7	■■■□□ 2.67
PSME3-209	ENST00000589469	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		31.7	■■■□□ 2.67
PSME3-209	ENST00000589469	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	31.68	■■■□□ 2.66
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	31.68	■■■□□ 2.66
PSME3-209	ENST00000589469	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		31.67	■■■□□ 2.66
PSME3-209	ENST00000589469	MAP3K1	Q13233	1512 aa		31.67	■■■□□ 2.66
PSME3-209	ENST00000589469	AFAP1	Q8N556	730 aa		31.66	■■■□□ 2.66
PSME3-209	ENST00000589469	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		31.65	■■■□□ 2.66
PSME3-209	ENST00000589469	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		31.64	■■■□□ 2.66
PSME3-209	ENST00000589469	KDM5C	P41229	1560 aa		31.64	■■■□□ 2.65
PSME3-209	ENST00000589469	NCOA2	Q15596	1464 aa		31.63	■■■□□ 2.65
PSME3-209	ENST00000589469	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		31.63	■■■□□ 2.65
PSME3-209	ENST00000589469	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	31.62	■■■□□ 2.65
PSME3-209	ENST00000589469	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	31.62	■■■□□ 2.65
PSME3-209	ENST00000589469	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		31.62	■■■□□ 2.65
PSME3-209	ENST00000589469	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		31.61	■■■□□ 2.65
PSME3-209	ENST00000589469	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		31.59	■■■□□ 2.65
PSME3-209	ENST00000589469	APLP2	Q06481	763 aa		31.58	■■■□□ 2.65
PSME3-209	ENST00000589469	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		31.58	■■■□□ 2.65
PSME3-209	ENST00000589469	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		31.57	■■■□□ 2.64
PSME3-209	ENST00000589469	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		31.57	■■■□□ 2.64
PSME3-209	ENST00000589469	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		31.56	■■■□□ 2.64
PSME3-209	ENST00000589469	ATP10A	O60312	1499 aa		31.55	■■■□□ 2.64
PSME3-209	ENST00000589469	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		31.55	■■■□□ 2.64
PSME3-209	ENST00000589469	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	31.55	■■■□□ 2.64
PSME3-209	ENST00000589469	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	31.53	■■■□□ 2.64
PSME3-209	ENST00000589469	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		31.52	■■■□□ 2.64
PSME3-209	ENST00000589469	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		31.49	■■■□□ 2.63
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	31.49	■■■□□ 2.63
PSME3-209	ENST00000589469	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		31.47	■■■□□ 2.63
PSME3-209	ENST00000589469	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		31.47	■■■□□ 2.63
PSME3-209	ENST00000589469	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	31.45	■■■□□ 2.62
PSME3-209	ENST00000589469	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		31.44	■■■□□ 2.62
PSME3-209	ENST00000589469	ABCA6	Q8N139	1617 aa		31.43	■■■□□ 2.62
PSME3-209	ENST00000589469	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PSME3-209	ENST00000589469	MBD5	Q9P267	1494 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PSME3-209	ENST00000589469	RERE	Q9P2R6	1566 aa		31.39	■■■□□ 2.62
PSME3-209	ENST00000589469	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		31.39	■■■□□ 2.62
PSME3-209	ENST00000589469	MADD	Q8WXG6	1647 aa		31.38	■■■□□ 2.61
PSME3-209	ENST00000589469	MLEC	Q14165	292 aa		31.38	■■■□□ 2.61
PSME3-209	ENST00000589469	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PSME3-209	ENST00000589469	ATP7A	Q04656	1500 aa		31.36	■■■□□ 2.61
PSME3-209	ENST00000589469	PTPRM	P28827	1452 aa		31.36	■■■□□ 2.61
PSME3-209	ENST00000589469	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	31.34	■■■□□ 2.61
PSME3-209	ENST00000589469	MIA2	Q96PC5	1412 aa		31.33	■■■□□ 2.61
PSME3-209	ENST00000589469	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		31.32	■■■□□ 2.6
PSME3-209	ENST00000589469	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		31.31	■■■□□ 2.6
PSME3-209	ENST00000589469	AGL	P35573	1532 aa		31.3	■■■□□ 2.6
PSME3-209	ENST00000589469	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		31.27	■■■□□ 2.6
PSME3-209	ENST00000589469	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	31.27	■■■□□ 2.6
PSME3-209	ENST00000589469	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		31.26	■■■□□ 2.6
PSME3-209	ENST00000589469	A2M	P01023	1474 aa		31.23	■■■□□ 2.59
PSME3-209	ENST00000589469	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		31.21	■■■□□ 2.59
PSME3-209	ENST00000589469	TSPY4	P0CV99	314 aa		31.19	■■■□□ 2.58
PSME3-209	ENST00000589469	TSPY10	P0CW01	314 aa		31.19	■■■□□ 2.58
PSME3-209	ENST00000589469	PLXNC1	O60486	1568 aa		31.18	■■■□□ 2.58
PSME3-209	ENST00000589469	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		31.16	■■■□□ 2.58
PSME3-209	ENST00000589469	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		31.16	■■■□□ 2.58
PSME3-209	ENST00000589469	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		31.14	■■■□□ 2.58
PSME3-209	ENST00000589469	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		31.14	■■■□□ 2.58
PSME3-209	ENST00000589469	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	31.13	■■■□□ 2.57
PSME3-209	ENST00000589469	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	31.11	■■■□□ 2.57
PSME3-209	ENST00000589469	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	31.1	■■■□□ 2.57
PSME3-209	ENST00000589469	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		31.09	■■■□□ 2.57
PSME3-209	ENST00000589469	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		31.07	■■■□□ 2.56
PSME3-209	ENST00000589469	GGT6	Q6P531	493 aa		31.03	■■■□□ 2.56
PSME3-209	ENST00000589469	ABCC5	O15440	1437 aa		31.03	■■■□□ 2.56
PSME3-209	ENST00000589469	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	31.02	■■■□□ 2.56
PSME3-209	ENST00000589469	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		31.01	■■■□□ 2.56
PSME3-209	ENST00000589469	DAPK1	P53355	1430 aa		31	■■■□□ 2.55
PSME3-209	ENST00000589469	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	30.98	■■■□□ 2.55
PSME3-209	ENST00000589469	KIF3B	O15066	747 aa		30.98	■■■□□ 2.55
PSME3-209	ENST00000589469	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		30.97	■■■□□ 2.55
PSME3-209	ENST00000589469	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		30.96	■■■□□ 2.55
PSME3-209	ENST00000589469	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		30.95	■■■□□ 2.55
PSME3-209	ENST00000589469	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	30.95	■■■□□ 2.55
PSME3-209	ENST00000589469	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	30.94	■■■□□ 2.54
PSME3-209	ENST00000589469	C3	P01024	1663 aa		30.93	■■■□□ 2.54
PSME3-209	ENST00000589469	MROH2A	A6NES4	1674 aa		30.91	■■■□□ 2.54
PSME3-209	ENST00000589469	ZMYM3	Q14202	1370 aa		30.91	■■■□□ 2.54
PSME3-209	ENST00000589469	KIF15	Q9NS87	1388 aa		30.9	■■■□□ 2.54
PSME3-209	ENST00000589469	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		30.89	■■■□□ 2.54
PSME3-209	ENST00000589469	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	30.89	■■■□□ 2.54
PSME3-209	ENST00000589469	FBXO41	Q8TF61	875 aa		30.86	■■■□□ 2.53
PSME3-209	ENST00000589469	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		30.86	■■■□□ 2.53

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