RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588702.5

PRKAR1A-215, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene PRKAR1A, Length 622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1A-215ENST00000588702 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.25■■■□□ 2.27
PRKAR1A-215ENST00000588702 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
PRKAR1A-215ENST00000588702 PREX2Q70Z35 1606 aa29.23■■■□□ 2.27
PRKAR1A-215ENST00000588702 FANCAO15360 1455 aa29.23■■■□□ 2.27
PRKAR1A-215ENST00000588702 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.23■■■□□ 2.27
PRKAR1A-215ENST00000588702 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.21■■■□□ 2.27
PRKAR1A-215ENST00000588702 AKNAQ7Z591 1439 aa29.17■■■□□ 2.26
PRKAR1A-215ENST00000588702 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.15■■■□□ 2.26
PRKAR1A-215ENST00000588702 MIA2Q96PC5 1412 aa29.15■■■□□ 2.26
PRKAR1A-215ENST00000588702 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
PRKAR1A-215ENST00000588702 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
PRKAR1A-215ENST00000588702 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.11■■■□□ 2.25
PRKAR1A-215ENST00000588702 ADGRL1O94910 1474 aa29.09■■■□□ 2.25
PRKAR1A-215ENST00000588702 KDM6BO15054 1643 aa29.07■■■□□ 2.24
PRKAR1A-215ENST00000588702 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.06■■■□□ 2.24
PRKAR1A-215ENST00000588702 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.05■■■□□ 2.24
PRKAR1A-215ENST00000588702 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.05■■■□□ 2.24
PRKAR1A-215ENST00000588702 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
PRKAR1A-215ENST00000588702 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.02■■■□□ 2.24
PRKAR1A-215ENST00000588702 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.01■■■□□ 2.24
PRKAR1A-215ENST00000588702 ABCC1P33527 1531 aa28.99■■■□□ 2.23
PRKAR1A-215ENST00000588702 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
PRKAR1A-215ENST00000588702 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.97■■■□□ 2.23
PRKAR1A-215ENST00000588702 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
PRKAR1A-215ENST00000588702 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.96■■■□□ 2.23
PRKAR1A-215ENST00000588702 RAPGEF3O95398 923 aa28.96■■■□□ 2.23
PRKAR1A-215ENST00000588702 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.96■■■□□ 2.232e-6■■□□□ 11.9
PRKAR1A-215ENST00000588702 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.96■■■□□ 2.23
PRKAR1A-215ENST00000588702 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.94■■■□□ 2.22
PRKAR1A-215ENST00000588702 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
PRKAR1A-215ENST00000588702 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.92■■■□□ 2.22
PRKAR1A-215ENST00000588702 RICTORQ6R327 1708 aa28.91■■■□□ 2.22
PRKAR1A-215ENST00000588702 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.91■■■□□ 2.22
PRKAR1A-215ENST00000588702 AFAP1Q8N556 730 aa28.9■■■□□ 2.22
PRKAR1A-215ENST00000588702 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.89■■■□□ 2.22
PRKAR1A-215ENST00000588702 TSPY4P0CV99 314 aa28.89■■■□□ 2.22
PRKAR1A-215ENST00000588702 TSPY10P0CW01 314 aa28.89■■■□□ 2.22
PRKAR1A-215ENST00000588702 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
PRKAR1A-215ENST00000588702 MBD5Q9P267 1494 aa28.89■■■□□ 2.22
PRKAR1A-215ENST00000588702 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.88■■■□□ 2.21
PRKAR1A-215ENST00000588702 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.87■■■□□ 2.21
PRKAR1A-215ENST00000588702 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.86■■■□□ 2.21
PRKAR1A-215ENST00000588702 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.85■■■□□ 2.21
PRKAR1A-215ENST00000588702 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
PRKAR1A-215ENST00000588702 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.84■■■□□ 2.21
PRKAR1A-215ENST00000588702 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.84■■■□□ 2.21
PRKAR1A-215ENST00000588702 KDM5CP41229 1560 aa28.84■■■□□ 2.21
PRKAR1A-215ENST00000588702 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
PRKAR1A-215ENST00000588702 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.83■■■□□ 2.21
PRKAR1A-215ENST00000588702 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.81■■■□□ 2.2
PRKAR1A-215ENST00000588702 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.78■■■□□ 2.2
PRKAR1A-215ENST00000588702 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.2
PRKAR1A-215ENST00000588702 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.76■■■□□ 2.19
PRKAR1A-215ENST00000588702 DAPK1P53355 1430 aa28.75■■■□□ 2.19
PRKAR1A-215ENST00000588702 ABCC5O15440 1437 aa28.74■■■□□ 2.19
PRKAR1A-215ENST00000588702 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.74■■■□□ 2.19
PRKAR1A-215ENST00000588702 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.72■■■□□ 2.19
PRKAR1A-215ENST00000588702 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.71■■■□□ 2.19
PRKAR1A-215ENST00000588702 ATP7AQ04656 1500 aa28.7■■■□□ 2.19
PRKAR1A-215ENST00000588702 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.7■■■□□ 2.18
PRKAR1A-215ENST00000588702 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.69■■■□□ 2.18
PRKAR1A-215ENST00000588702 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
PRKAR1A-215ENST00000588702 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.67■■■□□ 2.18
PRKAR1A-215ENST00000588702 ATP10AO60312 1499 aa28.67■■■□□ 2.18
PRKAR1A-215ENST00000588702 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.65■■■□□ 2.18
PRKAR1A-215ENST00000588702 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.64■■■□□ 2.18
PRKAR1A-215ENST00000588702 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.63■■■□□ 2.17
PRKAR1A-215ENST00000588702 ITGAEP38570 1179 aa28.63■■■□□ 2.17
PRKAR1A-215ENST00000588702 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.61■■■□□ 2.17
PRKAR1A-215ENST00000588702 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.61■■■□□ 2.17
PRKAR1A-215ENST00000588702 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.59■■■□□ 2.17
PRKAR1A-215ENST00000588702 ABCA6Q8N139 1617 aa28.58■■■□□ 2.17
PRKAR1A-215ENST00000588702 ROCK1Q13464 1354 aa28.58■■■□□ 2.17
PRKAR1A-215ENST00000588702 PLXNC1O60486 1568 aa28.58■■■□□ 2.17
PRKAR1A-215ENST00000588702 REREQ9P2R6 1566 aa28.58■■■□□ 2.17
PRKAR1A-215ENST00000588702 ADGRL2O95490 1459 aa28.57■■■□□ 2.16
PRKAR1A-215ENST00000588702 NCOA1Q15788 1441 aa28.56■■■□□ 2.16
PRKAR1A-215ENST00000588702 A2MP01023 1474 aa28.55■■■□□ 2.16
PRKAR1A-215ENST00000588702 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
PRKAR1A-215ENST00000588702 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.54■■■□□ 2.16
PRKAR1A-215ENST00000588702 PTPRKQ15262 1439 aa28.53■■■□□ 2.16
PRKAR1A-215ENST00000588702 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
PRKAR1A-215ENST00000588702 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.52■■■□□ 2.16
PRKAR1A-215ENST00000588702 KIF15Q9NS87 1388 aa28.51■■■□□ 2.16
PRKAR1A-215ENST00000588702 AGLP35573 1532 aa28.49■■■□□ 2.15
PRKAR1A-215ENST00000588702 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
PRKAR1A-215ENST00000588702 ERBINQ96RT1 1412 aa28.44■■■□□ 2.14
PRKAR1A-215ENST00000588702 KIF3BO15066 747 aa28.41■■■□□ 2.14
PRKAR1A-215ENST00000588702 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.41■■■□□ 2.14
PRKAR1A-215ENST00000588702 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
PRKAR1A-215ENST00000588702 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.4■■■□□ 2.14
PRKAR1A-215ENST00000588702 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.38■■■□□ 2.13
PRKAR1A-215ENST00000588702 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
PRKAR1A-215ENST00000588702 HFM1A2PYH4 1435 aa28.35■■■□□ 2.13
PRKAR1A-215ENST00000588702 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.35■■■□□ 2.13
PRKAR1A-215ENST00000588702 MLECQ14165 292 aa28.34■■■□□ 2.13
PRKAR1A-215ENST00000588702 GGT6Q6P531 493 aa28.34■■■□□ 2.13
PRKAR1A-215ENST00000588702 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
PRKAR1A-215ENST00000588702 NAIPQ13075 1403 aa28.33■■■□□ 2.13
PRKAR1A-215ENST00000588702 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms