RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.16■■■■□ 3.86
SCAMP4-210ENST00000588555 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP39.11■■■■□ 3.85
SCAMP4-210ENST00000588555 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.09■■■■□ 3.85
SCAMP4-210ENST00000588555 MAPKBP1O60336 1514 aa39.07■■■■□ 3.85
SCAMP4-210ENST00000588555 PLCH2O75038 1416 aa39.06■■■■□ 3.84
SCAMP4-210ENST00000588555 DAPK1P53355 1430 aa39.05■■■■□ 3.84
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP39.05■■■■□ 3.84
SCAMP4-210ENST00000588555 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa39.04■■■■□ 3.84
SCAMP4-210ENST00000588555 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.04■■■■□ 3.84
SCAMP4-210ENST00000588555 ABCC5O15440 1437 aa39.03■■■■□ 3.84
SCAMP4-210ENST00000588555 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.01■■■■□ 3.83
SCAMP4-210ENST00000588555 SETD5Q9C0A6 1442 aa38.97■■■■□ 3.83
SCAMP4-210ENST00000588555 HFM1A2PYH4 1435 aa38.95■■■■□ 3.83
SCAMP4-210ENST00000588555 CROCC2H7BZ55 1655 aa38.95■■■■□ 3.83
SCAMP4-210ENST00000588555 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa38.93■■■■□ 3.82
SCAMP4-210ENST00000588555 ARHGEF5Q12774 1597 aa38.92■■■■□ 3.82
SCAMP4-210ENST00000588555 MBD5Q9P267 1494 aa38.92■■■■□ 3.82
SCAMP4-210ENST00000588555 AKNAQ7Z591 1439 aa38.92■■■■□ 3.82
SCAMP4-210ENST00000588555 NAIPQ13075 1403 aa38.88■■■■□ 3.82
SCAMP4-210ENST00000588555 CHIC2Q9UKJ5 165 aa38.87■■■■□ 3.81
SCAMP4-210ENST00000588555 HRCP23327 699 aa38.87■■■■□ 3.81
SCAMP4-210ENST00000588555 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa38.86■■■■□ 3.81
SCAMP4-210ENST00000588555 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa38.86■■■■□ 3.81
SCAMP4-210ENST00000588555 ROCK1Q13464 1354 aa38.86■■■■□ 3.81
SCAMP4-210ENST00000588555 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa38.86■■■■□ 3.81
SCAMP4-210ENST00000588555 SYCP2Q9BX26 1530 aa38.86■■■■□ 3.81
SCAMP4-210ENST00000588555 GCC2Q8IWJ2 1684 aa38.84■■■■□ 3.81
SCAMP4-210ENST00000588555 SHANK2Q9UPX8 1470 aa38.84■■■■□ 3.81
SCAMP4-210ENST00000588555 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP38.82■■■■□ 3.81
SCAMP4-210ENST00000588555 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP38.82■■■■□ 3.8
SCAMP4-210ENST00000588555 ABCC1P33527 1531 aa38.81■■■■□ 3.8
SCAMP4-210ENST00000588555 ADGBQ8N7X0 1667 aa38.8■■■■□ 3.8
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC141Q6ZP82 1450 aa38.8■■■■□ 3.8
SCAMP4-210ENST00000588555 ADGRL2O95490 1459 aa38.79■■■■□ 3.8
SCAMP4-210ENST00000588555 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa38.79■■■■□ 3.8
SCAMP4-210ENST00000588555 FANCAO15360 1455 aa38.78■■■■□ 3.8
SCAMP4-210ENST00000588555 CD109Q6YHK3 1445 aa38.76■■■■□ 3.8
SCAMP4-210ENST00000588555 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa38.76■■■■□ 3.8
SCAMP4-210ENST00000588555 GLI2P10070 1586 aa38.76■■■■□ 3.79
SCAMP4-210ENST00000588555 RSPH4AQ5TD94 716 aa38.75■■■■□ 3.79
SCAMP4-210ENST00000588555 C9orf84Q5VXU9 1444 aa38.74■■■■□ 3.79
SCAMP4-210ENST00000588555 NCOA1Q15788 1441 aa38.73■■■■□ 3.79
SCAMP4-210ENST00000588555 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP38.71■■■■□ 3.79
SCAMP4-210ENST00000588555 DIP2BQ9P265 1576 aa38.71■■■■□ 3.79
SCAMP4-210ENST00000588555 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa38.7■■■■□ 3.79
SCAMP4-210ENST00000588555 MAST1Q9Y2H9 1570 aa38.67■■■■□ 3.78
SCAMP4-210ENST00000588555 TSPY4P0CV99 314 aa38.66■■■■□ 3.78
SCAMP4-210ENST00000588555 TSPY10P0CW01 314 aa38.66■■■■□ 3.78
SCAMP4-210ENST00000588555 KDM6BO15054 1643 aa38.66■■■■□ 3.78
SCAMP4-210ENST00000588555 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa38.65■■■■□ 3.78
SCAMP4-210ENST00000588555 CFAP74Q9C0B2 1584 aa38.64■■■■□ 3.78
SCAMP4-210ENST00000588555 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa38.63■■■■□ 3.77
SCAMP4-210ENST00000588555 ADGRL1O94910 1474 aa38.61■■■■□ 3.77
SCAMP4-210ENST00000588555 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP38.57■■■■□ 3.76
SCAMP4-210ENST00000588555 SCAPERQ9BY12 1400 aa38.54■■■■□ 3.76
SCAMP4-210ENST00000588555 NEO1Q92859 1461 aa38.53■■■■□ 3.76
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM69CQ0P6D2 419 aa38.53■■■■□ 3.76
SCAMP4-210ENST00000588555 PLXNC1O60486 1568 aa38.52■■■■□ 3.76
SCAMP4-210ENST00000588555 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.49■■■■□ 3.75
SCAMP4-210ENST00000588555 KIF15Q9NS87 1388 aa38.49■■■■□ 3.75
SCAMP4-210ENST00000588555 CLSPNQ9HAW4 1339 aa38.48■■■■□ 3.75
SCAMP4-210ENST00000588555 KIF13AQ9H1H9 1805 aa38.48■■■■□ 3.75
SCAMP4-210ENST00000588555 AFAP1Q8N556 730 aa38.47■■■■□ 3.75
SCAMP4-210ENST00000588555 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa38.46■■■■□ 3.75
SCAMP4-210ENST00000588555 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa38.44■■■■□ 3.74
SCAMP4-210ENST00000588555 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa38.44■■■■□ 3.74
SCAMP4-210ENST00000588555 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP38.43■■■■□ 3.74
SCAMP4-210ENST00000588555 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP38.42■■■■□ 3.74
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa38.4■■■■□ 3.74
SCAMP4-210ENST00000588555 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP38.4■■■■□ 3.74
SCAMP4-210ENST00000588555 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP38.4■■■■□ 3.74
SCAMP4-210ENST00000588555 POGZQ7Z3K3 1410 aa38.39■■■■□ 3.74
SCAMP4-210ENST00000588555 KDM5CP41229 1560 aa38.36■■■■□ 3.73
SCAMP4-210ENST00000588555 ATP7AQ04656 1500 aa38.36■■■■□ 3.73
SCAMP4-210ENST00000588555 TSPOAP1O95153 1857 aa38.34■■■■□ 3.73
SCAMP4-210ENST00000588555 DUOX2Q9NRD8 1548 aa38.33■■■■□ 3.73
SCAMP4-210ENST00000588555 TRIM52Q96A61 297 aa38.3■■■■□ 3.72
SCAMP4-210ENST00000588555 TEX14Q8IWB6 1497 aa38.3■■■■□ 3.72
SCAMP4-210ENST00000588555 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP38.29■■■■□ 3.72
SCAMP4-210ENST00000588555 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa38.28■■■■□ 3.72
SCAMP4-210ENST00000588555 RICTORQ6R327 1708 aa38.25■■■■□ 3.71
SCAMP4-210ENST00000588555 ERBINQ96RT1 1412 aa38.25■■■■□ 3.71
SCAMP4-210ENST00000588555 MLH3Q9UHC1 1453 aa38.23■■■■□ 3.71
SCAMP4-210ENST00000588555 PZPP20742 1482 aa38.22■■■■□ 3.71
SCAMP4-210ENST00000588555 HECW2Q9P2P5 1572 aa38.21■■■■□ 3.71
SCAMP4-210ENST00000588555 KDM5DQ9BY66 1539 aa38.21■■■■□ 3.71
SCAMP4-210ENST00000588555 MPHOSPH9Q99550 1183 aa38.19■■■■□ 3.7
SCAMP4-210ENST00000588555 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa38.17■■■■□ 3.7
SCAMP4-210ENST00000588555 RAPGEF3O95398 923 aa38.17■■■■□ 3.7
SCAMP4-210ENST00000588555 UNC13BO14795 1591 aa38.17■■■■□ 3.7
SCAMP4-210ENST00000588555 NUP155O75694 1391 aa38.11■■■■□ 3.69
SCAMP4-210ENST00000588555 MAGI2Q86UL8 1455 aa38.1■■■■□ 3.69
SCAMP4-210ENST00000588555 MYT1LQ9UL68 1186 aa38.09■■■■□ 3.69
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP38.08■■■■□ 3.69
SCAMP4-210ENST00000588555 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP38.08■■■■□ 3.69
SCAMP4-210ENST00000588555 ABCA6Q8N139 1617 aa38.08■■■■□ 3.69
SCAMP4-210ENST00000588555 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa38.08■■■■□ 3.69
SCAMP4-210ENST00000588555 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP38.06■■■■□ 3.68
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM135AQ9P2D6 1515 aa38.02■■■■□ 3.68
SCAMP4-210ENST00000588555 DEPDC5O75140 1603 aa38.02■■■■□ 3.68
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