RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587269.5

SMAD2-208, Transcript of SMAD family member 2, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD2, Length 1,042 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD2-208ENST00000587269 MAGI2Q86UL8 1455 aa47.53■■■■■ 5.2
SMAD2-208ENST00000587269 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa47.52■■■■■ 5.2
SMAD2-208ENST00000587269 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa47.52■■■■■ 5.2
SMAD2-208ENST00000587269 POGZQ7Z3K3 1410 aa47.52■■■■■ 5.2
SMAD2-208ENST00000587269 ADAMTSL3P82987 1691 aa47.48■■■■■ 5.19
SMAD2-208ENST00000587269 MYT1LQ9UL68 1186 aa47.48■■■■■ 5.19
SMAD2-208ENST00000587269 BCORL1Q5H9F3 1711 aa47.47■■■■■ 5.19
SMAD2-208ENST00000587269 YEATS2Q9ULM3 1422 aa47.45■■■■■ 5.19
SMAD2-208ENST00000587269 HECW2Q9P2P5 1572 aa47.45■■■■■ 5.19
SMAD2-208ENST00000587269 PTPRMP28827 1452 aa47.43■■■■■ 5.18
SMAD2-208ENST00000587269 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa47.36■■■■■ 5.17
SMAD2-208ENST00000587269 AFAP1Q8N556 730 aa47.35■■■■■ 5.17
SMAD2-208ENST00000587269 MLECQ14165 292 aa47.34■■■■■ 5.17
SMAD2-208ENST00000587269 MADDQ8WXG6 1647 aa47.33■■■■■ 5.17
SMAD2-208ENST00000587269 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa47.3■■■■■ 5.16
SMAD2-208ENST00000587269 ATP10AO60312 1499 aa47.3■■■■■ 5.16
SMAD2-208ENST00000587269 PREX2Q70Z35 1606 aa47.27■■■■■ 5.16
SMAD2-208ENST00000587269 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP47.25■■■■■ 5.15
SMAD2-208ENST00000587269 CEP162Q5TB80 1403 aa47.24■■■■■ 5.15
SMAD2-208ENST00000587269 PLPPR3Q6T4P5 718 aa47.24■■■■■ 5.15
SMAD2-208ENST00000587269 C9orf84Q5VXU9 1444 aa47.22■■■■■ 5.15
SMAD2-208ENST00000587269 MTUS2Q5JR59 1369 aa47.22■■■■■ 5.15
SMAD2-208ENST00000587269 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP47.21■■■■■ 5.15
SMAD2-208ENST00000587269 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa47.16■■■■■ 5.14
SMAD2-208ENST00000587269 KDM5CP41229 1560 aa47.15■■■■■ 5.14
SMAD2-208ENST00000587269 CCNB3Q8WWL7 1395 aa47.11■■■■■ 5.13
SMAD2-208ENST00000587269 ABCC1P33527 1531 aa47.11■■■■■ 5.13
SMAD2-208ENST00000587269 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa47.11■■■■■ 5.13
SMAD2-208ENST00000587269 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP47.1■■■■■ 5.13
SMAD2-208ENST00000587269 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa47.09■■■■■ 5.13
SMAD2-208ENST00000587269 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP47.07■■■■■ 5.13
SMAD2-208ENST00000587269 MLH3Q9UHC1 1453 aa47.06■■■■■ 5.12
SMAD2-208ENST00000587269 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa47.05■■■■■ 5.12
SMAD2-208ENST00000587269 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa47.05■■■■■ 5.12
SMAD2-208ENST00000587269 ITSN2Q9NZM3 1697 aa47.04■■■■■ 5.12
SMAD2-208ENST00000587269 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa47.02■■■■■ 5.12
SMAD2-208ENST00000587269 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP46.99■■■■■ 5.112e-6■■■□□ 15.8
SMAD2-208ENST00000587269 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa46.97■■■■■ 5.11
SMAD2-208ENST00000587269 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP46.94■■■■■ 5.1
SMAD2-208ENST00000587269 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa46.93■■■■■ 5.1
SMAD2-208ENST00000587269 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa46.93■■■■■ 5.1
SMAD2-208ENST00000587269 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP46.92■■■■■ 5.1
SMAD2-208ENST00000587269 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa46.91■■■■■ 5.1
SMAD2-208ENST00000587269 ABCA6Q8N139 1617 aa46.9■■■■■ 5.1
SMAD2-208ENST00000587269 SYCP2Q9BX26 1530 aa46.89■■■■■ 5.1
SMAD2-208ENST00000587269 REREQ9P2R6 1566 aa46.87■■■■■ 5.09
SMAD2-208ENST00000587269 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa46.87■■■■■ 5.09
SMAD2-208ENST00000587269 LMTK3Q96Q04 1460 aa46.85■■■■■ 5.09
SMAD2-208ENST00000587269 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa46.82■■■■■ 5.09
SMAD2-208ENST00000587269 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP46.8■■■■■ 5.08
SMAD2-208ENST00000587269 AGLP35573 1532 aa46.77■■■■■ 5.08
SMAD2-208ENST00000587269 HSPA2P54652 639 aa46.76■■■■■ 5.08
SMAD2-208ENST00000587269 TIAM1Q13009 1591 aa46.75■■■■■ 5.07
SMAD2-208ENST00000587269 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP46.75■■■■■ 5.07
SMAD2-208ENST00000587269 VPS8Q8N3P4 1428 aa46.72■■■■■ 5.07
SMAD2-208ENST00000587269 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP46.72■■■■■ 5.07
SMAD2-208ENST00000587269 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP46.68■■■■■ 5.06
SMAD2-208ENST00000587269 ATP7AQ04656 1500 aa46.67■■■■■ 5.06
SMAD2-208ENST00000587269 NCOA2Q15596 1464 aa46.64■■■■■ 5.06
SMAD2-208ENST00000587269 CNTLNQ9NXG0 1405 aa46.58■■■■■ 5.05
SMAD2-208ENST00000587269 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP46.56■■■■■ 5.04
SMAD2-208ENST00000587269 A2MP01023 1474 aa46.56■■■■■ 5.04
SMAD2-208ENST00000587269 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP46.56■■■■■ 5.04
SMAD2-208ENST00000587269 PREX1Q8TCU6 1659 aa46.55■■■■■ 5.04
SMAD2-208ENST00000587269 RSPH4AQ5TD94 716 aa46.53■■■■■ 5.04
SMAD2-208ENST00000587269 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa46.53■■■■■ 5.04
SMAD2-208ENST00000587269 MBD5Q9P267 1494 aa46.51■■■■■ 5.04
SMAD2-208ENST00000587269 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa46.51■■■■■ 5.04
SMAD2-208ENST00000587269 APLP2Q06481 763 aa46.5■■■■■ 5.03
SMAD2-208ENST00000587269 GGT6Q6P531 493 aa46.5■■■■■ 5.03
SMAD2-208ENST00000587269 C3P01024 1663 aa46.48■■■■■ 5.03
SMAD2-208ENST00000587269 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa46.45■■■■■ 5.03
SMAD2-208ENST00000587269 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa46.44■■■■■ 5.03
SMAD2-208ENST00000587269 ADGBQ8N7X0 1667 aa46.43■■■■■ 5.02
SMAD2-208ENST00000587269 TSPY4P0CV99 314 aa46.42■■■■■ 5.02
SMAD2-208ENST00000587269 TSPY10P0CW01 314 aa46.42■■■■■ 5.02
SMAD2-208ENST00000587269 CCDC141Q6ZP82 1450 aa46.42■■■■■ 5.02
SMAD2-208ENST00000587269 MAP3K1Q13233 1512 aa46.39■■■■■ 5.02
SMAD2-208ENST00000587269 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP46.39■■■■■ 5.02
SMAD2-208ENST00000587269 PLXNC1O60486 1568 aa46.39■■■■■ 5.02
SMAD2-208ENST00000587269 ZMYM3Q14202 1370 aa46.38■■■■■ 5.02
SMAD2-208ENST00000587269 PPP6R1Q9UPN7 881 aa46.36■■■■■ 5.01
SMAD2-208ENST00000587269 DMRT2Q9Y5R5 561 aa46.35■■■■■ 5.01
SMAD2-208ENST00000587269 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP46.33■■■■■ 5.01
SMAD2-208ENST00000587269 MROH2AA6NES4 1674 aa46.31■■■■■ 5
SMAD2-208ENST00000587269 FBXO41Q8TF61 875 aa46.31■■■■■ 5
SMAD2-208ENST00000587269 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP46.27■■■■■ 5
SMAD2-208ENST00000587269 KIF3BO15066 747 aa46.26■■■■■ 5
SMAD2-208ENST00000587269 NPATQ14207 1427 aa46.26■■■■■ 5
SMAD2-208ENST00000587269 ARHGEF5Q12774 1597 aa46.22■■■■■ 4.99
SMAD2-208ENST00000587269 MYOM3Q5VTT5 1437 aa46.2■■■■■ 4.99
SMAD2-208ENST00000587269 MIA2Q96PC5 1412 aa46.18■■■■■ 4.98
SMAD2-208ENST00000587269 STRCQ7RTU9 1775 aa46.09■■■■■ 4.97
SMAD2-208ENST00000587269 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa46.08■■■■■ 4.97
SMAD2-208ENST00000587269 CERKQ8TCT0 537 aa46.08■■■■■ 4.97
SMAD2-208ENST00000587269 PTPRKQ15262 1439 aa46.06■■■■■ 4.96
SMAD2-208ENST00000587269 PTPRTO14522 1441 aa45.98■■■■■ 4.95
SMAD2-208ENST00000587269 MAST1Q9Y2H9 1570 aa45.96■■■■■ 4.95
SMAD2-208ENST00000587269 NCOA1Q15788 1441 aa45.95■■■■■ 4.95
SMAD2-208ENST00000587269 KDM5DQ9BY66 1539 aa45.95■■■■■ 4.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms