RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587016.5

HDGFL2-201, Transcript of HDGF like 2, humanhuman

TSL 3

Gene HDGFL2, Length 870 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL2-201ENST00000587016 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.51■■■□□ 2.31
HDGFL2-201ENST00000587016 NCOA2Q15596 1464 aa29.48■■■□□ 2.31
HDGFL2-201ENST00000587016 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.48■■■□□ 2.31
HDGFL2-201ENST00000587016 AKNAQ7Z591 1439 aa29.47■■■□□ 2.31
HDGFL2-201ENST00000587016 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.47■■■□□ 2.31
HDGFL2-201ENST00000587016 RICTORQ6R327 1708 aa29.47■■■□□ 2.31
HDGFL2-201ENST00000587016 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
HDGFL2-201ENST00000587016 ABCC1P33527 1531 aa29.42■■■□□ 2.3
HDGFL2-201ENST00000587016 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.41■■■□□ 2.3
HDGFL2-201ENST00000587016 ADGRL1O94910 1474 aa29.4■■■□□ 2.3
HDGFL2-201ENST00000587016 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.39■■■□□ 2.3
HDGFL2-201ENST00000587016 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.39■■■□□ 2.3
HDGFL2-201ENST00000587016 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.38■■■□□ 2.29
HDGFL2-201ENST00000587016 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
HDGFL2-201ENST00000587016 APLP2Q06481 763 aa29.35■■■□□ 2.29
HDGFL2-201ENST00000587016 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.35■■■□□ 2.29
HDGFL2-201ENST00000587016 KDM5CP41229 1560 aa29.33■■■□□ 2.29
HDGFL2-201ENST00000587016 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.31■■■□□ 2.28
HDGFL2-201ENST00000587016 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.31■■■□□ 2.28
HDGFL2-201ENST00000587016 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.29■■■□□ 2.28
HDGFL2-201ENST00000587016 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.29■■■□□ 2.28
HDGFL2-201ENST00000587016 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.28■■■□□ 2.28
HDGFL2-201ENST00000587016 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.28■■■□□ 2.28
HDGFL2-201ENST00000587016 MIA2Q96PC5 1412 aa29.27■■■□□ 2.28
HDGFL2-201ENST00000587016 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.26■■■□□ 2.27
HDGFL2-201ENST00000587016 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
HDGFL2-201ENST00000587016 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.24■■■□□ 2.27
HDGFL2-201ENST00000587016 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.23■■■□□ 2.27
HDGFL2-201ENST00000587016 RAPGEF3O95398 923 aa29.22■■■□□ 2.27
HDGFL2-201ENST00000587016 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.22■■■□□ 2.27
HDGFL2-201ENST00000587016 MBD5Q9P267 1494 aa29.21■■■□□ 2.27
HDGFL2-201ENST00000587016 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.2■■■□□ 2.26
HDGFL2-201ENST00000587016 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.19■■■□□ 2.26
HDGFL2-201ENST00000587016 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.18■■■□□ 2.26
HDGFL2-201ENST00000587016 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.17■■■□□ 2.26
HDGFL2-201ENST00000587016 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
HDGFL2-201ENST00000587016 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.15■■■□□ 2.26
HDGFL2-201ENST00000587016 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
HDGFL2-201ENST00000587016 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.14■■■□□ 2.26
HDGFL2-201ENST00000587016 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.14■■■□□ 2.26
HDGFL2-201ENST00000587016 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.13■■■□□ 2.25
HDGFL2-201ENST00000587016 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
HDGFL2-201ENST00000587016 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.1■■■□□ 2.25
HDGFL2-201ENST00000587016 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
HDGFL2-201ENST00000587016 REREQ9P2R6 1566 aa29.09■■■□□ 2.25
HDGFL2-201ENST00000587016 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.09■■■□□ 2.25
HDGFL2-201ENST00000587016 ABCA6Q8N139 1617 aa29.09■■■□□ 2.25
HDGFL2-201ENST00000587016 AFAP1Q8N556 730 aa29.08■■■□□ 2.25
HDGFL2-201ENST00000587016 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.08■■■□□ 2.25
HDGFL2-201ENST00000587016 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.05■■■□□ 2.24
HDGFL2-201ENST00000587016 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.05■■■□□ 2.24
HDGFL2-201ENST00000587016 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.05■■■□□ 2.24
HDGFL2-201ENST00000587016 ATP7AQ04656 1500 aa29.04■■■□□ 2.24
HDGFL2-201ENST00000587016 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.04■■■□□ 2.24
HDGFL2-201ENST00000587016 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.02■■■□□ 2.24
HDGFL2-201ENST00000587016 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
HDGFL2-201ENST00000587016 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.01■■■□□ 2.23
HDGFL2-201ENST00000587016 ATP10AO60312 1499 aa28.99■■■□□ 2.23
HDGFL2-201ENST00000587016 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.98■■■□□ 2.23
HDGFL2-201ENST00000587016 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.97■■■□□ 2.23
HDGFL2-201ENST00000587016 PLXNC1O60486 1568 aa28.96■■■□□ 2.23
HDGFL2-201ENST00000587016 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.95■■■□□ 2.22
HDGFL2-201ENST00000587016 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
HDGFL2-201ENST00000587016 AGLP35573 1532 aa28.93■■■□□ 2.22
HDGFL2-201ENST00000587016 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.92■■■□□ 2.22
HDGFL2-201ENST00000587016 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.92■■■□□ 2.22
HDGFL2-201ENST00000587016 ABCC5O15440 1437 aa28.91■■■□□ 2.22
HDGFL2-201ENST00000587016 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
HDGFL2-201ENST00000587016 DAPK1P53355 1430 aa28.9■■■□□ 2.22
HDGFL2-201ENST00000587016 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
HDGFL2-201ENST00000587016 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.88■■■□□ 2.21
HDGFL2-201ENST00000587016 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
HDGFL2-201ENST00000587016 A2MP01023 1474 aa28.83■■■□□ 2.21
HDGFL2-201ENST00000587016 ADGRL2O95490 1459 aa28.82■■■□□ 2.2
HDGFL2-201ENST00000587016 TSPY4P0CV99 314 aa28.78■■■□□ 2.2
HDGFL2-201ENST00000587016 TSPY10P0CW01 314 aa28.78■■■□□ 2.2
HDGFL2-201ENST00000587016 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.76■■■□□ 2.19
HDGFL2-201ENST00000587016 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
HDGFL2-201ENST00000587016 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
HDGFL2-201ENST00000587016 MADDQ8WXG6 1647 aa28.74■■■□□ 2.19
HDGFL2-201ENST00000587016 PTPRKQ15262 1439 aa28.73■■■□□ 2.19
HDGFL2-201ENST00000587016 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.73■■■□□ 2.19
HDGFL2-201ENST00000587016 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.73■■■□□ 2.19
HDGFL2-201ENST00000587016 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.71■■■□□ 2.19
HDGFL2-201ENST00000587016 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
HDGFL2-201ENST00000587016 NCOA1Q15788 1441 aa28.69■■■□□ 2.18
HDGFL2-201ENST00000587016 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
HDGFL2-201ENST00000587016 KIF15Q9NS87 1388 aa28.66■■■□□ 2.18
HDGFL2-201ENST00000587016 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.66■■■□□ 2.18
HDGFL2-201ENST00000587016 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
HDGFL2-201ENST00000587016 ROCK1Q13464 1354 aa28.65■■■□□ 2.18
HDGFL2-201ENST00000587016 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.65■■■□□ 2.18
HDGFL2-201ENST00000587016 ERBINQ96RT1 1412 aa28.65■■■□□ 2.18
HDGFL2-201ENST00000587016 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
HDGFL2-201ENST00000587016 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.62■■■□□ 2.17
HDGFL2-201ENST00000587016 DEPDC5O75140 1603 aa28.61■■■□□ 2.17
HDGFL2-201ENST00000587016 MROH2AA6NES4 1674 aa28.61■■■□□ 2.17
HDGFL2-201ENST00000587016 PTPRMP28827 1452 aa28.58■■■□□ 2.17
HDGFL2-201ENST00000587016 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
HDGFL2-201ENST00000587016 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms