RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587016.5

HDGFL2-201, Transcript of HDGF like 2, humanhuman

TSL 3

Gene HDGFL2, Length 870 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL2-201ENST00000587016 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.51■■■□□ 2.31
HDGFL2-201ENST00000587016 NCOA2Q15596 1464 aa29.48■■■□□ 2.31
HDGFL2-201ENST00000587016 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.48■■■□□ 2.31
HDGFL2-201ENST00000587016 AKNAQ7Z591 1439 aa29.47■■■□□ 2.31
HDGFL2-201ENST00000587016 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.47■■■□□ 2.31
HDGFL2-201ENST00000587016 RICTORQ6R327 1708 aa29.47■■■□□ 2.31
HDGFL2-201ENST00000587016 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
HDGFL2-201ENST00000587016 ABCC1P33527 1531 aa29.42■■■□□ 2.3
HDGFL2-201ENST00000587016 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.41■■■□□ 2.3
HDGFL2-201ENST00000587016 ADGRL1O94910 1474 aa29.4■■■□□ 2.3
HDGFL2-201ENST00000587016 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.39■■■□□ 2.3
HDGFL2-201ENST00000587016 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.39■■■□□ 2.3
HDGFL2-201ENST00000587016 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.38■■■□□ 2.29
HDGFL2-201ENST00000587016 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
HDGFL2-201ENST00000587016 APLP2Q06481 763 aa29.35■■■□□ 2.29
HDGFL2-201ENST00000587016 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.35■■■□□ 2.29
HDGFL2-201ENST00000587016 KDM5CP41229 1560 aa29.33■■■□□ 2.29
HDGFL2-201ENST00000587016 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.31■■■□□ 2.28
HDGFL2-201ENST00000587016 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.31■■■□□ 2.28
HDGFL2-201ENST00000587016 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.29■■■□□ 2.28
HDGFL2-201ENST00000587016 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.29■■■□□ 2.28
HDGFL2-201ENST00000587016 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.28■■■□□ 2.28
HDGFL2-201ENST00000587016 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.28■■■□□ 2.28
HDGFL2-201ENST00000587016 MIA2Q96PC5 1412 aa29.27■■■□□ 2.28
HDGFL2-201ENST00000587016 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.26■■■□□ 2.27
HDGFL2-201ENST00000587016 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
HDGFL2-201ENST00000587016 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.24■■■□□ 2.27
HDGFL2-201ENST00000587016 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.23■■■□□ 2.27
HDGFL2-201ENST00000587016 RAPGEF3O95398 923 aa29.22■■■□□ 2.27
HDGFL2-201ENST00000587016 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.22■■■□□ 2.27
HDGFL2-201ENST00000587016 MBD5Q9P267 1494 aa29.21■■■□□ 2.27
HDGFL2-201ENST00000587016 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.2■■■□□ 2.26
HDGFL2-201ENST00000587016 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.19■■■□□ 2.26
HDGFL2-201ENST00000587016 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.18■■■□□ 2.26
HDGFL2-201ENST00000587016 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.17■■■□□ 2.26
HDGFL2-201ENST00000587016 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
HDGFL2-201ENST00000587016 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.15■■■□□ 2.26
HDGFL2-201ENST00000587016 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
HDGFL2-201ENST00000587016 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.14■■■□□ 2.26
HDGFL2-201ENST00000587016 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.14■■■□□ 2.26
HDGFL2-201ENST00000587016 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.13■■■□□ 2.25
HDGFL2-201ENST00000587016 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
HDGFL2-201ENST00000587016 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.1■■■□□ 2.25
HDGFL2-201ENST00000587016 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
HDGFL2-201ENST00000587016 REREQ9P2R6 1566 aa29.09■■■□□ 2.25
HDGFL2-201ENST00000587016 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.09■■■□□ 2.25
HDGFL2-201ENST00000587016 ABCA6Q8N139 1617 aa29.09■■■□□ 2.25
HDGFL2-201ENST00000587016 AFAP1Q8N556 730 aa29.08■■■□□ 2.25
HDGFL2-201ENST00000587016 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.08■■■□□ 2.25
HDGFL2-201ENST00000587016 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.05■■■□□ 2.24
HDGFL2-201ENST00000587016 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.05■■■□□ 2.24
HDGFL2-201ENST00000587016 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.05■■■□□ 2.24
HDGFL2-201ENST00000587016 ATP7AQ04656 1500 aa29.04■■■□□ 2.24
HDGFL2-201ENST00000587016 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.04■■■□□ 2.24
HDGFL2-201ENST00000587016 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.02■■■□□ 2.24
HDGFL2-201ENST00000587016 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
HDGFL2-201ENST00000587016 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.01■■■□□ 2.23
HDGFL2-201ENST00000587016 ATP10AO60312 1499 aa28.99■■■□□ 2.23
HDGFL2-201ENST00000587016 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.98■■■□□ 2.23
HDGFL2-201ENST00000587016 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.97■■■□□ 2.23
HDGFL2-201ENST00000587016 PLXNC1O60486 1568 aa28.96■■■□□ 2.23
HDGFL2-201ENST00000587016 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.95■■■□□ 2.22
HDGFL2-201ENST00000587016 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
HDGFL2-201ENST00000587016 AGLP35573 1532 aa28.93■■■□□ 2.22
HDGFL2-201ENST00000587016 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.92■■■□□ 2.22
HDGFL2-201ENST00000587016 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.92■■■□□ 2.22
HDGFL2-201ENST00000587016 ABCC5O15440 1437 aa28.91■■■□□ 2.22
HDGFL2-201ENST00000587016 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
HDGFL2-201ENST00000587016 DAPK1P53355 1430 aa28.9■■■□□ 2.22
HDGFL2-201ENST00000587016 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
HDGFL2-201ENST00000587016 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.88■■■□□ 2.21
HDGFL2-201ENST00000587016 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
HDGFL2-201ENST00000587016 A2MP01023 1474 aa28.83■■■□□ 2.21
HDGFL2-201ENST00000587016 ADGRL2O95490 1459 aa28.82■■■□□ 2.2
HDGFL2-201ENST00000587016 TSPY4P0CV99 314 aa28.78■■■□□ 2.2
HDGFL2-201ENST00000587016 TSPY10P0CW01 314 aa28.78■■■□□ 2.2
HDGFL2-201ENST00000587016 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.76■■■□□ 2.19
HDGFL2-201ENST00000587016 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
HDGFL2-201ENST00000587016 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
HDGFL2-201ENST00000587016 MADDQ8WXG6 1647 aa28.74■■■□□ 2.19
HDGFL2-201ENST00000587016 PTPRKQ15262 1439 aa28.73■■■□□ 2.19
HDGFL2-201ENST00000587016 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.73■■■□□ 2.19
HDGFL2-201ENST00000587016 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.73■■■□□ 2.19
HDGFL2-201ENST00000587016 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.71■■■□□ 2.19
HDGFL2-201ENST00000587016 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
HDGFL2-201ENST00000587016 NCOA1Q15788 1441 aa28.69■■■□□ 2.18
HDGFL2-201ENST00000587016 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
HDGFL2-201ENST00000587016 KIF15Q9NS87 1388 aa28.66■■■□□ 2.18
HDGFL2-201ENST00000587016 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.66■■■□□ 2.18
HDGFL2-201ENST00000587016 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
HDGFL2-201ENST00000587016 ROCK1Q13464 1354 aa28.65■■■□□ 2.18
HDGFL2-201ENST00000587016 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.65■■■□□ 2.18
HDGFL2-201ENST00000587016 ERBINQ96RT1 1412 aa28.65■■■□□ 2.18
HDGFL2-201ENST00000587016 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
HDGFL2-201ENST00000587016 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.62■■■□□ 2.17
HDGFL2-201ENST00000587016 DEPDC5O75140 1603 aa28.61■■■□□ 2.17
HDGFL2-201ENST00000587016 MROH2AA6NES4 1674 aa28.61■■■□□ 2.17
HDGFL2-201ENST00000587016 PTPRMP28827 1452 aa28.58■■■□□ 2.17
HDGFL2-201ENST00000587016 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
HDGFL2-201ENST00000587016 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms