RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585927.1

HSPBP1-204, Transcript of HSPA (Hsp70) binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene HSPBP1, Length 666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPBP1-204ENST00000585927 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.32■■■■■ 4.21
HSPBP1-204ENST00000585927 PREX2Q70Z35 1606 aa41.32■■■■■ 4.2
HSPBP1-204ENST00000585927 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.28■■■■■ 4.2
HSPBP1-204ENST00000585927 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.28■■■■■ 4.2
HSPBP1-204ENST00000585927 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.27■■■■■ 4.2
HSPBP1-204ENST00000585927 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.26■■■■■ 4.2
HSPBP1-204ENST00000585927 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.23■■■■■ 4.19
HSPBP1-204ENST00000585927 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.23■■■■■ 4.19
HSPBP1-204ENST00000585927 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.19■■■■■ 4.18
HSPBP1-204ENST00000585927 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
HSPBP1-204ENST00000585927 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa41.16■■■■■ 4.18
HSPBP1-204ENST00000585927 TIAM1Q13009 1591 aa41.16■■■■■ 4.18
HSPBP1-204ENST00000585927 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.12■■■■■ 4.17
HSPBP1-204ENST00000585927 ABCC1P33527 1531 aa41.09■■■■■ 4.17
HSPBP1-204ENST00000585927 MAP3K1Q13233 1512 aa41.09■■■■■ 4.17
HSPBP1-204ENST00000585927 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.09■■■■■ 4.17
HSPBP1-204ENST00000585927 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.08■■■■■ 4.17
HSPBP1-204ENST00000585927 KDM5CP41229 1560 aa41.06■■■■■ 4.16
HSPBP1-204ENST00000585927 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.03■■■■■ 4.16
HSPBP1-204ENST00000585927 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.02■■■■■ 4.16
HSPBP1-204ENST00000585927 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.02■■■■■ 4.16
HSPBP1-204ENST00000585927 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.01■■■■■ 4.16
HSPBP1-204ENST00000585927 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41■■■■■ 4.15
HSPBP1-204ENST00000585927 AFAP1Q8N556 730 aa41■■■■■ 4.15
HSPBP1-204ENST00000585927 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41■■■■■ 4.15
HSPBP1-204ENST00000585927 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.99■■■■■ 4.15
HSPBP1-204ENST00000585927 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.95■■■■■ 4.15
HSPBP1-204ENST00000585927 NCOA2Q15596 1464 aa40.95■■■■■ 4.15
HSPBP1-204ENST00000585927 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.95■■■■■ 4.15
HSPBP1-204ENST00000585927 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.94■■■■■ 4.14
HSPBP1-204ENST00000585927 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.93■■■■■ 4.14
HSPBP1-204ENST00000585927 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.93■■■■■ 4.14
HSPBP1-204ENST00000585927 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.93■■■■■ 4.14
HSPBP1-204ENST00000585927 ATP10AO60312 1499 aa40.91■■■■■ 4.14
HSPBP1-204ENST00000585927 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.9■■■■■ 4.14
HSPBP1-204ENST00000585927 ADAMTSL3P82987 1691 aa40.9■■■■■ 4.14
HSPBP1-204ENST00000585927 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
HSPBP1-204ENST00000585927 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.88■■■■■ 4.14
HSPBP1-204ENST00000585927 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.84■■■■■ 4.13
HSPBP1-204ENST00000585927 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.84■■■■■ 4.13
HSPBP1-204ENST00000585927 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.83■■■■■ 4.13
HSPBP1-204ENST00000585927 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.81■■■■■ 4.12
HSPBP1-204ENST00000585927 APLP2Q06481 763 aa40.8■■■■■ 4.12
HSPBP1-204ENST00000585927 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.8■■■■■ 4.12
HSPBP1-204ENST00000585927 REREQ9P2R6 1566 aa40.78■■■■■ 4.12
HSPBP1-204ENST00000585927 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.78■■■■■ 4.12
HSPBP1-204ENST00000585927 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa40.78■■■■■ 4.12
HSPBP1-204ENST00000585927 ABCA6Q8N139 1617 aa40.76■■■■■ 4.12
HSPBP1-204ENST00000585927 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.74■■■■■ 4.11
HSPBP1-204ENST00000585927 MBD5Q9P267 1494 aa40.72■■■■■ 4.11
HSPBP1-204ENST00000585927 MADDQ8WXG6 1647 aa40.71■■■■■ 4.11
HSPBP1-204ENST00000585927 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP40.7■■■■■ 4.11
HSPBP1-204ENST00000585927 PTPRMP28827 1452 aa40.66■■■■■ 4.1
HSPBP1-204ENST00000585927 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa40.66■■■■■ 4.1
HSPBP1-204ENST00000585927 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.65■■■■■ 4.1
HSPBP1-204ENST00000585927 ATP7AQ04656 1500 aa40.64■■■■■ 4.1
HSPBP1-204ENST00000585927 AGLP35573 1532 aa40.62■■■■■ 4.09
HSPBP1-204ENST00000585927 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.62■■■■■ 4.09
HSPBP1-204ENST00000585927 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.6■■■■■ 4.09
HSPBP1-204ENST00000585927 MIA2Q96PC5 1412 aa40.6■■■■■ 4.09
HSPBP1-204ENST00000585927 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP40.58■■■■■ 4.09
HSPBP1-204ENST00000585927 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.57■■■■■ 4.08
HSPBP1-204ENST00000585927 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.56■■■■■ 4.08
HSPBP1-204ENST00000585927 MLECQ14165 292 aa40.55■■■■■ 4.08
HSPBP1-204ENST00000585927 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.55■■■■■ 4.08
HSPBP1-204ENST00000585927 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.55■■■■■ 4.08
HSPBP1-204ENST00000585927 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.48■■■■■ 4.07
HSPBP1-204ENST00000585927 A2MP01023 1474 aa40.46■■■■■ 4.07
HSPBP1-204ENST00000585927 PLXNC1O60486 1568 aa40.46■■■■■ 4.07
HSPBP1-204ENST00000585927 TSPY4P0CV99 314 aa40.39■■■■■ 4.06
HSPBP1-204ENST00000585927 TSPY10P0CW01 314 aa40.39■■■■■ 4.06
HSPBP1-204ENST00000585927 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.35■■■■■ 4.05
HSPBP1-204ENST00000585927 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.35■■■■■ 4.05
HSPBP1-204ENST00000585927 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.34■■■■■ 4.05
HSPBP1-204ENST00000585927 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
HSPBP1-204ENST00000585927 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
HSPBP1-204ENST00000585927 CNTLNQ9NXG0 1405 aa40.27■■■■■ 4.04
HSPBP1-204ENST00000585927 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
HSPBP1-204ENST00000585927 PPP6R1Q9UPN7 881 aa40.21■■■■■ 4.03
HSPBP1-204ENST00000585927 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.19■■■■■ 4.03
HSPBP1-204ENST00000585927 MROH2AA6NES4 1674 aa40.19■■■■■ 4.02
HSPBP1-204ENST00000585927 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.19■■■■■ 4.02
HSPBP1-204ENST00000585927 C3P01024 1663 aa40.18■■■■■ 4.02
HSPBP1-204ENST00000585927 ABCC5O15440 1437 aa40.18■■■■■ 4.02
HSPBP1-204ENST00000585927 PLPPR3Q6T4P5 718 aa40.18■■■■■ 4.02
HSPBP1-204ENST00000585927 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
HSPBP1-204ENST00000585927 LMTK3Q96Q04 1460 aa40.17■■■■■ 4.02
HSPBP1-204ENST00000585927 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
HSPBP1-204ENST00000585927 GGT6Q6P531 493 aa40.15■■■■■ 4.02
HSPBP1-204ENST00000585927 DAPK1P53355 1430 aa40.14■■■■■ 4.02
HSPBP1-204ENST00000585927 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.01
HSPBP1-204ENST00000585927 KIF3BO15066 747 aa40.1■■■■■ 4.01
HSPBP1-204ENST00000585927 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP40.09■■■■■ 4.01
HSPBP1-204ENST00000585927 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.08■■■■■ 4.01
HSPBP1-204ENST00000585927 ZMYM3Q14202 1370 aa40.07■■■■■ 4
HSPBP1-204ENST00000585927 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.06■■■■■ 4
HSPBP1-204ENST00000585927 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP40.05■■■■■ 4
HSPBP1-204ENST00000585927 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.04■■■■■ 4
HSPBP1-204ENST00000585927 NPATQ14207 1427 aa39.99■■■■□ 3.99
HSPBP1-204ENST00000585927 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP39.99■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms