RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRM-214ENST00000583153 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
PTPRM-214ENST00000583153 AKNAQ7Z591 1439 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRM-214ENST00000583153 PREX2Q70Z35 1606 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRM-214ENST00000583153 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRM-214ENST00000583153 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
PTPRM-214ENST00000583153 RAPGEF3O95398 923 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRM-214ENST00000583153 PLCH2O75038 1416 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRM-214ENST00000583153 BCORL1Q5H9F3 1711 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRM-214ENST00000583153 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRM-214ENST00000583153 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRM-214ENST00000583153 ADAMTSL3P82987 1691 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRM-214ENST00000583153 POGZQ7Z3K3 1410 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRM-214ENST00000583153 ARHGAP5Q13017 1502 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRM-214ENST00000583153 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRM-214ENST00000583153 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRM-214ENST00000583153 CEP162Q5TB80 1403 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRM-214ENST00000583153 MADDQ8WXG6 1647 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRM-214ENST00000583153 ITSN2Q9NZM3 1697 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRM-214ENST00000583153 KDM5CP41229 1560 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRM-214ENST00000583153 ABCC1P33527 1531 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRM-214ENST00000583153 SCAPERQ9BY12 1400 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRM-214ENST00000583153 MAGI2Q86UL8 1455 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRM-214ENST00000583153 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRM-214ENST00000583153 HECW2Q9P2P5 1572 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRM-214ENST00000583153 YEATS2Q9ULM3 1422 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRM-214ENST00000583153 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
PTPRM-214ENST00000583153 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
PTPRM-214ENST00000583153 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa13.27□□□□□ -0.28
PTPRM-214ENST00000583153 MYT1LQ9UL68 1186 aa13.27□□□□□ -0.29
PTPRM-214ENST00000583153 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa13.27□□□□□ -0.29
PTPRM-214ENST00000583153 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa13.27□□□□□ -0.29
PTPRM-214ENST00000583153 ABCA6Q8N139 1617 aa13.27□□□□□ -0.29
PTPRM-214ENST00000583153 PTPRMP28827 1452 aa13.26□□□□□ -0.29
PTPRM-214ENST00000583153 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa13.26□□□□□ -0.29
PTPRM-214ENST00000583153 TIAM1Q13009 1591 aa13.24□□□□□ -0.29
PTPRM-214ENST00000583153 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa13.24□□□□□ -0.29
PTPRM-214ENST00000583153 REREQ9P2R6 1566 aa13.24□□□□□ -0.29
PTPRM-214ENST00000583153 SYCP2Q9BX26 1530 aa13.23□□□□□ -0.29
PTPRM-214ENST00000583153 C9orf84Q5VXU9 1444 aa13.23□□□□□ -0.29
PTPRM-214ENST00000583153 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa13.23□□□□□ -0.29
PTPRM-214ENST00000583153 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
PTPRM-214ENST00000583153 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
PTPRM-214ENST00000583153 ATP10AO60312 1499 aa13.22□□□□□ -0.29
PTPRM-214ENST00000583153 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.3
PTPRM-214ENST00000583153 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa13.21□□□□□ -0.3
PTPRM-214ENST00000583153 MTUS2Q5JR59 1369 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRM-214ENST00000583153 AFAP1Q8N556 730 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRM-214ENST00000583153 MLH3Q9UHC1 1453 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRM-214ENST00000583153 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
PTPRM-214ENST00000583153 VPS8Q8N3P4 1428 aa13.18□□□□□ -0.3
PTPRM-214ENST00000583153 MLECQ14165 292 aa13.17□□□□□ -0.3
PTPRM-214ENST00000583153 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
PTPRM-214ENST00000583153 CCNB3Q8WWL7 1395 aa13.17□□□□□ -0.3
PTPRM-214ENST00000583153 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRM-214ENST00000583153 ATP7AQ04656 1500 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRM-214ENST00000583153 DMRT2Q9Y5R5 561 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRM-214ENST00000583153 AGLP35573 1532 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRM-214ENST00000583153 LMTK3Q96Q04 1460 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRM-214ENST00000583153 PLXNC1O60486 1568 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRM-214ENST00000583153 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRM-214ENST00000583153 NCOA2Q15596 1464 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRM-214ENST00000583153 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP13.13□□□□□ -0.31
PTPRM-214ENST00000583153 ADGBQ8N7X0 1667 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRM-214ENST00000583153 PREX1Q8TCU6 1659 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRM-214ENST00000583153 APLP2Q06481 763 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRM-214ENST00000583153 C3P01024 1663 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRM-214ENST00000583153 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRM-214ENST00000583153 MAP3K1Q13233 1512 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRM-214ENST00000583153 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRM-214ENST00000583153 MROH2AA6NES4 1674 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRM-214ENST00000583153 MBD5Q9P267 1494 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRM-214ENST00000583153 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRM-214ENST00000583153 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PTPRM-214ENST00000583153 ARHGEF5Q12774 1597 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC141Q6ZP82 1450 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRM-214ENST00000583153 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PTPRM-214ENST00000583153 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PTPRM-214ENST00000583153 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PTPRM-214ENST00000583153 A2MP01023 1474 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRM-214ENST00000583153 CROCC2H7BZ55 1655 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRM-214ENST00000583153 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
PTPRM-214ENST00000583153 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRM-214ENST00000583153 CNTLNQ9NXG0 1405 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRM-214ENST00000583153 RSPH4AQ5TD94 716 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRM-214ENST00000583153 MAST1Q9Y2H9 1570 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRM-214ENST00000583153 MYOM3Q5VTT5 1437 aa13□□□□□ -0.33
PTPRM-214ENST00000583153 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
PTPRM-214ENST00000583153 TSPY4P0CV99 314 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRM-214ENST00000583153 TSPY10P0CW01 314 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
PTPRM-214ENST00000583153 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRM-214ENST00000583153 STRCQ7RTU9 1775 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRM-214ENST00000583153 MYO3AQ8NEV4 1616 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRM-214ENST00000583153 MIA2Q96PC5 1412 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRM-214ENST00000583153 GGT6Q6P531 493 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRM-214ENST00000583153 PTPN23Q9H3S7 1636 aa12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms