RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580667.5

PLXDC1-218, Transcript of plexin domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene PLXDC1, Length 565 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXDC1-218ENST00000580667 FANCAO15360 1455 aa23.27■■□□□ 1.32
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PLXDC1-218ENST00000580667 KDM6BO15054 1643 aa23.26■■□□□ 1.31
PLXDC1-218ENST00000580667 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.23■■□□□ 1.31
PLXDC1-218ENST00000580667 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.23■■□□□ 1.31
PLXDC1-218ENST00000580667 RICTORQ6R327 1708 aa23.22■■□□□ 1.31
PLXDC1-218ENST00000580667 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
PLXDC1-218ENST00000580667 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.19■■□□□ 1.3
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PLXDC1-218ENST00000580667 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.08■■□□□ 1.28
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PLXDC1-218ENST00000580667 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
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PLXDC1-218ENST00000580667 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.02■■□□□ 1.28
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PLXDC1-218ENST00000580667 HECW2Q9P2P5 1572 aa23■■□□□ 1.27
PLXDC1-218ENST00000580667 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.99■■□□□ 1.27
PLXDC1-218ENST00000580667 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PLXDC1-218ENST00000580667 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.98■■□□□ 1.27
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PLXDC1-218ENST00000580667 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
PLXDC1-218ENST00000580667 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.95■■□□□ 1.26
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PLXDC1-218ENST00000580667 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.93■■□□□ 1.26
PLXDC1-218ENST00000580667 AFAP1Q8N556 730 aa22.92■■□□□ 1.26
PLXDC1-218ENST00000580667 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.92■■□□□ 1.26
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PLXDC1-218ENST00000580667 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.91■■□□□ 1.26
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PLXDC1-218ENST00000580667 ATP7AQ04656 1500 aa22.91■■□□□ 1.26
PLXDC1-218ENST00000580667 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.91■■□□□ 1.26
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PLXDC1-218ENST00000580667 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.85■■□□□ 1.25
PLXDC1-218ENST00000580667 PLXNC1O60486 1568 aa22.84■■□□□ 1.25
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PLXDC1-218ENST00000580667 REREQ9P2R6 1566 aa22.82■■□□□ 1.24
PLXDC1-218ENST00000580667 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.82■■□□□ 1.24
PLXDC1-218ENST00000580667 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PLXDC1-218ENST00000580667 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
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PLXDC1-218ENST00000580667 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.81■■□□□ 1.24
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PLXDC1-218ENST00000580667 ATP10AO60312 1499 aa22.78■■□□□ 1.24
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PLXDC1-218ENST00000580667 ADGRL2O95490 1459 aa22.74■■□□□ 1.23
PLXDC1-218ENST00000580667 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.73■■□□□ 1.23
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PLXDC1-218ENST00000580667 TSPY10P0CW01 314 aa22.72■■□□□ 1.23
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PLXDC1-218ENST00000580667 AGLP35573 1532 aa22.71■■□□□ 1.23
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PLXDC1-218ENST00000580667 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.64■■□□□ 1.22
PLXDC1-218ENST00000580667 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.63■■□□□ 1.21
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PLXDC1-218ENST00000580667 MADDQ8WXG6 1647 aa22.6■■□□□ 1.21
PLXDC1-218ENST00000580667 DEPDC5O75140 1603 aa22.59■■□□□ 1.21
PLXDC1-218ENST00000580667 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.59■■□□□ 1.21
PLXDC1-218ENST00000580667 ERBINQ96RT1 1412 aa22.58■■□□□ 1.21
PLXDC1-218ENST00000580667 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.58■■□□□ 1.21
PLXDC1-218ENST00000580667 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PLXDC1-218ENST00000580667 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PLXDC1-218ENST00000580667 CEP152O94986 1710 aa22.53■■□□□ 1.2
PLXDC1-218ENST00000580667 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
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