RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579814.1

LIMD2-208, Transcript of LIM domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene LIMD2, Length 709 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD2-208ENST00000579814 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.67■■■■■ 4.26
LIMD2-208ENST00000579814 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP41.65■■■■■ 4.26
LIMD2-208ENST00000579814 RICTORQ6R327 1708 aa41.64■■■■■ 4.26
LIMD2-208ENST00000579814 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.61■■■■■ 4.25
LIMD2-208ENST00000579814 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.59■■■■■ 4.25
LIMD2-208ENST00000579814 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.59■■■■■ 4.25
LIMD2-208ENST00000579814 AFAP1Q8N556 730 aa41.58■■■■■ 4.25
LIMD2-208ENST00000579814 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.56■■■■■ 4.24
LIMD2-208ENST00000579814 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.56■■■■■ 4.24
LIMD2-208ENST00000579814 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
LIMD2-208ENST00000579814 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.54■■■■■ 4.24
LIMD2-208ENST00000579814 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.53■■■■■ 4.24
LIMD2-208ENST00000579814 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.53■■■■■ 4.24
LIMD2-208ENST00000579814 PREX2Q70Z35 1606 aa41.52■■■■■ 4.24
LIMD2-208ENST00000579814 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.52■■■■■ 4.24
LIMD2-208ENST00000579814 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa41.52■■■■■ 4.24
LIMD2-208ENST00000579814 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.51■■■■■ 4.24
LIMD2-208ENST00000579814 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.5■■■■■ 4.23
LIMD2-208ENST00000579814 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.47■■■■■ 4.23
LIMD2-208ENST00000579814 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.41■■■■■ 4.22
LIMD2-208ENST00000579814 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.41■■■■■ 4.22
LIMD2-208ENST00000579814 ABCC1P33527 1531 aa41.4■■■■■ 4.22
LIMD2-208ENST00000579814 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.4■■■■■ 4.22
LIMD2-208ENST00000579814 ATP10AO60312 1499 aa41.4■■■■■ 4.22
LIMD2-208ENST00000579814 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.37■■■■■ 4.21
LIMD2-208ENST00000579814 KDM5CP41229 1560 aa41.36■■■■■ 4.21
LIMD2-208ENST00000579814 TIAM1Q13009 1591 aa41.33■■■■■ 4.21
LIMD2-208ENST00000579814 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.33■■■■■ 4.21
LIMD2-208ENST00000579814 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.33■■■■■ 4.21
LIMD2-208ENST00000579814 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.32■■■■■ 4.21
LIMD2-208ENST00000579814 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.32■■■■■ 4.2
LIMD2-208ENST00000579814 MLECQ14165 292 aa41.3■■■■■ 4.2
LIMD2-208ENST00000579814 APLP2Q06481 763 aa41.29■■■■■ 4.2
LIMD2-208ENST00000579814 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.29■■■■■ 4.2
LIMD2-208ENST00000579814 ADAMTSL3P82987 1691 aa41.28■■■■■ 4.2
LIMD2-208ENST00000579814 NCOA2Q15596 1464 aa41.28■■■■■ 4.2
LIMD2-208ENST00000579814 BCORL1Q5H9F3 1711 aa41.27■■■■■ 4.2
LIMD2-208ENST00000579814 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.26■■■■■ 4.2
LIMD2-208ENST00000579814 MAP3K1Q13233 1512 aa41.25■■■■■ 4.19
LIMD2-208ENST00000579814 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.25■■■■■ 4.19
LIMD2-208ENST00000579814 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.24■■■■■ 4.19
LIMD2-208ENST00000579814 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.24■■■■■ 4.19
LIMD2-208ENST00000579814 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.24■■■■■ 4.19
LIMD2-208ENST00000579814 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.23■■■■■ 4.19
LIMD2-208ENST00000579814 PTPRMP28827 1452 aa41.23■■■■■ 4.19
LIMD2-208ENST00000579814 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.23■■■■■ 4.19
LIMD2-208ENST00000579814 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
LIMD2-208ENST00000579814 MADDQ8WXG6 1647 aa41.14■■■■■ 4.18
LIMD2-208ENST00000579814 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.13■■■■■ 4.18
LIMD2-208ENST00000579814 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa41.11■■■■■ 4.17
LIMD2-208ENST00000579814 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.08■■■■■ 4.17
LIMD2-208ENST00000579814 MBD5Q9P267 1494 aa41.07■■■■■ 4.16
LIMD2-208ENST00000579814 REREQ9P2R6 1566 aa41.06■■■■■ 4.16
LIMD2-208ENST00000579814 ABCA6Q8N139 1617 aa41.06■■■■■ 4.16
LIMD2-208ENST00000579814 PLPPR3Q6T4P5 718 aa41.04■■■■■ 4.16
LIMD2-208ENST00000579814 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.04■■■■■ 4.16
LIMD2-208ENST00000579814 AGLP35573 1532 aa40.99■■■■■ 4.15
LIMD2-208ENST00000579814 ATP7AQ04656 1500 aa40.98■■■■■ 4.15
LIMD2-208ENST00000579814 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa40.98■■■■■ 4.15
LIMD2-208ENST00000579814 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
LIMD2-208ENST00000579814 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP40.97■■■■■ 4.15
LIMD2-208ENST00000579814 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.93■■■■■ 4.14
LIMD2-208ENST00000579814 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.93■■■■■ 4.14
LIMD2-208ENST00000579814 TSPY4P0CV99 314 aa40.92■■■■■ 4.14
LIMD2-208ENST00000579814 TSPY10P0CW01 314 aa40.92■■■■■ 4.14
LIMD2-208ENST00000579814 MIA2Q96PC5 1412 aa40.92■■■■■ 4.14
LIMD2-208ENST00000579814 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.91■■■■■ 4.14
LIMD2-208ENST00000579814 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
LIMD2-208ENST00000579814 A2MP01023 1474 aa40.89■■■■■ 4.14
LIMD2-208ENST00000579814 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP40.85■■■■■ 4.13
LIMD2-208ENST00000579814 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.84■■■■■ 4.13
LIMD2-208ENST00000579814 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
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LIMD2-208ENST00000579814 GGT6Q6P531 493 aa40.77■■■■■ 4.12
LIMD2-208ENST00000579814 CNTLNQ9NXG0 1405 aa40.75■■■■■ 4.11
LIMD2-208ENST00000579814 PLXNC1O60486 1568 aa40.73■■■■■ 4.11
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LIMD2-208ENST00000579814 LMTK3Q96Q04 1460 aa40.7■■■■■ 4.11
LIMD2-208ENST00000579814 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.67■■■■■ 4.1
LIMD2-208ENST00000579814 KIF3BO15066 747 aa40.66■■■■■ 4.1
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LIMD2-208ENST00000579814 HSPA2P54652 639 aa40.62■■■■■ 4.09
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LIMD2-208ENST00000579814 ABCC5O15440 1437 aa40.54■■■■■ 4.08
LIMD2-208ENST00000579814 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
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LIMD2-208ENST00000579814 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.48■■■■■ 4.07
LIMD2-208ENST00000579814 DAPK1P53355 1430 aa40.46■■■■■ 4.07
LIMD2-208ENST00000579814 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa40.45■■■■■ 4.07
LIMD2-208ENST00000579814 NPATQ14207 1427 aa40.45■■■■■ 4.07
LIMD2-208ENST00000579814 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.44■■■■■ 4.06
LIMD2-208ENST00000579814 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
LIMD2-208ENST00000579814 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.44■■■■■ 4.06
LIMD2-208ENST00000579814 MROH2AA6NES4 1674 aa40.41■■■■■ 4.06
LIMD2-208ENST00000579814 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.4■■■■■ 4.06
LIMD2-208ENST00000579814 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.4■■■■■ 4.06
LIMD2-208ENST00000579814 KIF15Q9NS87 1388 aa40.39■■■■■ 4.06
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