RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578365.1

MIR4449-201, Transcript of microRNA 4449, humanhuman

BASIC

Gene MIR4449, Length 66 nt, Biotype miRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIR4449-201ENST00000578365 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
MIR4449-201ENST00000578365 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP41.99■■■■■ 4.31
MIR4449-201ENST00000578365 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.98■■■■■ 4.31
MIR4449-201ENST00000578365 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.98■■■■■ 4.31
MIR4449-201ENST00000578365 LMTK3Q96Q04 1460 aa41.97■■■■■ 4.31
MIR4449-201ENST00000578365 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa41.96■■■■■ 4.31
MIR4449-201ENST00000578365 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
MIR4449-201ENST00000578365 KIF14Q15058 1648 aa41.92■■■■■ 4.3
MIR4449-201ENST00000578365 CLIP1P30622 1438 aa41.87■■■■■ 4.29
MIR4449-201ENST00000578365 ATP10AO60312 1499 aa41.85■■■■■ 4.29
MIR4449-201ENST00000578365 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.84■■■■■ 4.29
MIR4449-201ENST00000578365 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.81■■■■■ 4.28
MIR4449-201ENST00000578365 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.8■■■■■ 4.28
MIR4449-201ENST00000578365 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.79■■■■■ 4.28
MIR4449-201ENST00000578365 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.77■■■■■ 4.28
MIR4449-201ENST00000578365 KDM5CP41229 1560 aa41.76■■■■■ 4.28
MIR4449-201ENST00000578365 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa41.76■■■■■ 4.27
MIR4449-201ENST00000578365 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.74■■■■■ 4.27
MIR4449-201ENST00000578365 MLECQ14165 292 aa41.74■■■■■ 4.27
MIR4449-201ENST00000578365 FBXO41Q8TF61 875 aa41.74■■■■■ 4.27
MIR4449-201ENST00000578365 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.73■■■■■ 4.27
MIR4449-201ENST00000578365 AFAP1Q8N556 730 aa41.69■■■■■ 4.26
MIR4449-201ENST00000578365 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.68■■■■■ 4.26
MIR4449-201ENST00000578365 HSPA2P54652 639 aa41.64■■■■■ 4.26
MIR4449-201ENST00000578365 PLPPR3Q6T4P5 718 aa41.64■■■■■ 4.26
MIR4449-201ENST00000578365 PREX2Q70Z35 1606 aa41.63■■■■■ 4.26
MIR4449-201ENST00000578365 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.6■■■■■ 4.25
MIR4449-201ENST00000578365 REREQ9P2R6 1566 aa41.6■■■■■ 4.25
MIR4449-201ENST00000578365 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.59■■■■■ 4.25
MIR4449-201ENST00000578365 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.58■■■■■ 4.25
MIR4449-201ENST00000578365 ABCC1P33527 1531 aa41.56■■■■■ 4.24
MIR4449-201ENST00000578365 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.52■■■■■ 4.24
MIR4449-201ENST00000578365 ABCA6Q8N139 1617 aa41.49■■■■■ 4.23
MIR4449-201ENST00000578365 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.49■■■■■ 4.23
MIR4449-201ENST00000578365 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.48■■■■■ 4.23
MIR4449-201ENST00000578365 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.47■■■■■ 4.23
MIR4449-201ENST00000578365 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.47■■■■■ 4.23
MIR4449-201ENST00000578365 AGLP35573 1532 aa41.45■■■■■ 4.23
MIR4449-201ENST00000578365 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.45■■■■■ 4.23
MIR4449-201ENST00000578365 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41.39■■■■■ 4.22
MIR4449-201ENST00000578365 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.37■■■■■ 4.21
MIR4449-201ENST00000578365 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
MIR4449-201ENST00000578365 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.31■■■■■ 4.2
MIR4449-201ENST00000578365 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.31■■■■■ 4.2
MIR4449-201ENST00000578365 C3P01024 1663 aa41.26■■■■■ 4.2
MIR4449-201ENST00000578365 CERKQ8TCT0 537 aa41.25■■■■■ 4.19
MIR4449-201ENST00000578365 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
MIR4449-201ENST00000578365 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.25■■■■■ 4.19
MIR4449-201ENST00000578365 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.24■■■■■ 4.19
MIR4449-201ENST00000578365 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP41.24■■■■■ 4.19
MIR4449-201ENST00000578365 CNTLNQ9NXG0 1405 aa41.23■■■■■ 4.19
MIR4449-201ENST00000578365 DMRT2Q9Y5R5 561 aa41.22■■■■■ 4.19
MIR4449-201ENST00000578365 STRCQ7RTU9 1775 aa41.21■■■■■ 4.19
MIR4449-201ENST00000578365 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.21■■■■■ 4.19
MIR4449-201ENST00000578365 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.19■■■■■ 4.19
MIR4449-201ENST00000578365 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
MIR4449-201ENST00000578365 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.17■■■■■ 4.18
MIR4449-201ENST00000578365 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.16■■■■■ 4.18
MIR4449-201ENST00000578365 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.14■■■■■ 4.18
MIR4449-201ENST00000578365 ATP7AQ04656 1500 aa41.12■■■■■ 4.17
MIR4449-201ENST00000578365 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
MIR4449-201ENST00000578365 MROH2AA6NES4 1674 aa41.08■■■■■ 4.17
MIR4449-201ENST00000578365 PLXNC1O60486 1568 aa41.07■■■■■ 4.16
MIR4449-201ENST00000578365 NPATQ14207 1427 aa41.06■■■■■ 4.16
MIR4449-201ENST00000578365 PTPRTO14522 1441 aa41.05■■■■■ 4.16
MIR4449-201ENST00000578365 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
MIR4449-201ENST00000578365 A2MP01023 1474 aa41.02■■■■■ 4.16
MIR4449-201ENST00000578365 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.01■■■■■ 4.16
MIR4449-201ENST00000578365 ZMYM3Q14202 1370 aa41■■■■■ 4.15
MIR4449-201ENST00000578365 TIAM1Q13009 1591 aa40.99■■■■■ 4.15
MIR4449-201ENST00000578365 CEP162Q5TB80 1403 aa40.96■■■■■ 4.15
MIR4449-201ENST00000578365 NCOA1Q15788 1441 aa40.94■■■■■ 4.14
MIR4449-201ENST00000578365 MBD5Q9P267 1494 aa40.94■■■■■ 4.14
MIR4449-201ENST00000578365 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.93■■■■■ 4.14
MIR4449-201ENST00000578365 PPP6R1Q9UPN7 881 aa40.9■■■■■ 4.14
MIR4449-201ENST00000578365 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.9■■■■■ 4.14
MIR4449-201ENST00000578365 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.88■■■■■ 4.13
MIR4449-201ENST00000578365 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.13
MIR4449-201ENST00000578365 GGT6Q6P531 493 aa40.83■■■■■ 4.13
MIR4449-201ENST00000578365 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa40.82■■■■■ 4.13
MIR4449-201ENST00000578365 PTPRKQ15262 1439 aa40.82■■■■■ 4.12
MIR4449-201ENST00000578365 LTBP4Q8N2S1 1624 aa40.79■■■■■ 4.12
MIR4449-201ENST00000578365 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
MIR4449-201ENST00000578365 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
MIR4449-201ENST00000578365 NCOA2Q15596 1464 aa40.76■■■■■ 4.12
MIR4449-201ENST00000578365 MYO3AQ8NEV4 1616 aa40.75■■■■■ 4.11
MIR4449-201ENST00000578365 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.72■■■■■ 4.11
MIR4449-201ENST00000578365 PLA2R1Q13018 1463 aa40.71■■■■■ 4.11
MIR4449-201ENST00000578365 IQSEC2Q5JU85 1478 aa40.71■■■■■ 4.11
MIR4449-201ENST00000578365 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.71■■■■■ 4.11
MIR4449-201ENST00000578365 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP40.7■■■■■ 4.11
MIR4449-201ENST00000578365 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa40.69■■■■■ 4.1
MIR4449-201ENST00000578365 PKD2Q13563 968 aa40.66■■■■■ 4.1
MIR4449-201ENST00000578365 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40.65■■■■■ 4.1
MIR4449-201ENST00000578365 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP40.64■■■■■ 4.1
MIR4449-201ENST00000578365 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.62■■■■■ 4.09
MIR4449-201ENST00000578365 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.59■■■■■ 4.09
MIR4449-201ENST00000578365 KIF3BO15066 747 aa40.58■■■■■ 4.09
MIR4449-201ENST00000578365 A2ML1A8K2U0 1454 aa40.57■■■■■ 4.08
MIR4449-201ENST00000578365 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.56■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms