RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576106.5

TRAP1-215, Transcript of TNF receptor associated protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene TRAP1, Length 555 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAP1-215ENST00000576106 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.35■■■■□ 3.41
TRAP1-215ENST00000576106 RICTORQ6R327 1708 aa36.32■■■■□ 3.4
TRAP1-215ENST00000576106 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.31■■■■□ 3.4
TRAP1-215ENST00000576106 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.3■■■■□ 3.4
TRAP1-215ENST00000576106 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.29■■■■□ 3.4
TRAP1-215ENST00000576106 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.39
TRAP1-215ENST00000576106 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.25■■■■□ 3.39
TRAP1-215ENST00000576106 PREX2Q70Z35 1606 aa36.25■■■■□ 3.39
TRAP1-215ENST00000576106 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.24■■■■□ 3.39
TRAP1-215ENST00000576106 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.24■■■■□ 3.39
TRAP1-215ENST00000576106 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.23■■■■□ 3.39
TRAP1-215ENST00000576106 AFAP1Q8N556 730 aa36.22■■■■□ 3.39
TRAP1-215ENST00000576106 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
TRAP1-215ENST00000576106 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.21■■■■□ 3.39
TRAP1-215ENST00000576106 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.2■■■■□ 3.39
TRAP1-215ENST00000576106 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.2■■■■□ 3.39
TRAP1-215ENST00000576106 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.19■■■■□ 3.38
TRAP1-215ENST00000576106 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.19■■■■□ 3.38
TRAP1-215ENST00000576106 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.14■■■■□ 3.38
TRAP1-215ENST00000576106 ABCC1P33527 1531 aa36.13■■■■□ 3.38
TRAP1-215ENST00000576106 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.13■■■■□ 3.37
TRAP1-215ENST00000576106 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.11■■■■□ 3.37
TRAP1-215ENST00000576106 KDM5CP41229 1560 aa36.1■■■■□ 3.37
TRAP1-215ENST00000576106 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.09■■■■□ 3.37
TRAP1-215ENST00000576106 ATP10AO60312 1499 aa36.09■■■■□ 3.37
TRAP1-215ENST00000576106 TIAM1Q13009 1591 aa36.08■■■■□ 3.37
TRAP1-215ENST00000576106 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.05■■■■□ 3.36
TRAP1-215ENST00000576106 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.05■■■■□ 3.36
TRAP1-215ENST00000576106 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.04■■■■□ 3.36
TRAP1-215ENST00000576106 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.04■■■■□ 3.36
TRAP1-215ENST00000576106 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.03■■■■□ 3.364e-7■■■■■ 27
TRAP1-215ENST00000576106 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.02■■■■□ 3.36
TRAP1-215ENST00000576106 NCOA2Q15596 1464 aa36.01■■■■□ 3.36
TRAP1-215ENST00000576106 MAP3K1Q13233 1512 aa36.01■■■■□ 3.36
TRAP1-215ENST00000576106 ADAMTSL3P82987 1691 aa36■■■■□ 3.35
TRAP1-215ENST00000576106 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36■■■■□ 3.35
TRAP1-215ENST00000576106 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.99■■■■□ 3.35
TRAP1-215ENST00000576106 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.99■■■■□ 3.35
TRAP1-215ENST00000576106 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.99■■■■□ 3.35
TRAP1-215ENST00000576106 APLP2Q06481 763 aa35.98■■■■□ 3.35
TRAP1-215ENST00000576106 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.98■■■■□ 3.35
TRAP1-215ENST00000576106 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
TRAP1-215ENST00000576106 PTPRMP28827 1452 aa35.94■■■■□ 3.34
TRAP1-215ENST00000576106 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
TRAP1-215ENST00000576106 MLECQ14165 292 aa35.94■■■■□ 3.34
TRAP1-215ENST00000576106 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
TRAP1-215ENST00000576106 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
TRAP1-215ENST00000576106 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.89■■■■□ 3.34
TRAP1-215ENST00000576106 MADDQ8WXG6 1647 aa35.87■■■■□ 3.33
TRAP1-215ENST00000576106 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.86■■■■□ 3.33
TRAP1-215ENST00000576106 REREQ9P2R6 1566 aa35.85■■■■□ 3.33
TRAP1-215ENST00000576106 ABCA6Q8N139 1617 aa35.83■■■■□ 3.33
TRAP1-215ENST00000576106 MBD5Q9P267 1494 aa35.82■■■■□ 3.32
TRAP1-215ENST00000576106 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.79■■■■□ 3.32
TRAP1-215ENST00000576106 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.79■■■■□ 3.32
TRAP1-215ENST00000576106 AGLP35573 1532 aa35.77■■■■□ 3.32
TRAP1-215ENST00000576106 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.76■■■■□ 3.32
TRAP1-215ENST00000576106 ATP7AQ04656 1500 aa35.76■■■■□ 3.31
TRAP1-215ENST00000576106 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
TRAP1-215ENST00000576106 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.7■■■■□ 3.31
TRAP1-215ENST00000576106 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.7■■■■□ 3.31
TRAP1-215ENST00000576106 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.7■■■■□ 3.31
TRAP1-215ENST00000576106 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.7■■■■□ 3.31
TRAP1-215ENST00000576106 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.7■■■■□ 3.31
TRAP1-215ENST00000576106 MIA2Q96PC5 1412 aa35.69■■■■□ 3.3
TRAP1-215ENST00000576106 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
TRAP1-215ENST00000576106 A2MP01023 1474 aa35.66■■■■□ 3.3
TRAP1-215ENST00000576106 TSPY4P0CV99 314 aa35.65■■■■□ 3.3
TRAP1-215ENST00000576106 TSPY10P0CW01 314 aa35.65■■■■□ 3.3
TRAP1-215ENST00000576106 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.63■■■■□ 3.29
TRAP1-215ENST00000576106 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.59■■■■□ 3.29
TRAP1-215ENST00000576106 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
TRAP1-215ENST00000576106 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
TRAP1-215ENST00000576106 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.55■■■■□ 3.28
TRAP1-215ENST00000576106 PLXNC1O60486 1568 aa35.55■■■■□ 3.28
TRAP1-215ENST00000576106 GGT6Q6P531 493 aa35.5■■■■□ 3.27
TRAP1-215ENST00000576106 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.49■■■■□ 3.27
TRAP1-215ENST00000576106 LMTK3Q96Q04 1460 aa35.48■■■■□ 3.27
TRAP1-215ENST00000576106 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.48■■■■□ 3.27
TRAP1-215ENST00000576106 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.46■■■■□ 3.27
TRAP1-215ENST00000576106 KIF3BO15066 747 aa35.42■■■■□ 3.26
TRAP1-215ENST00000576106 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.39■■■■□ 3.26
TRAP1-215ENST00000576106 ZMYM3Q14202 1370 aa35.38■■■■□ 3.26
TRAP1-215ENST00000576106 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.38■■■■□ 3.25
TRAP1-215ENST00000576106 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
TRAP1-215ENST00000576106 HSPA2P54652 639 aa35.36■■■■□ 3.25
TRAP1-215ENST00000576106 ABCC5O15440 1437 aa35.35■■■■□ 3.25
TRAP1-215ENST00000576106 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.32■■■■□ 3.25
TRAP1-215ENST00000576106 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.31■■■■□ 3.24
TRAP1-215ENST00000576106 C3P01024 1663 aa35.3■■■■□ 3.24
TRAP1-215ENST00000576106 DAPK1P53355 1430 aa35.3■■■■□ 3.24
TRAP1-215ENST00000576106 NPATQ14207 1427 aa35.29■■■■□ 3.24
TRAP1-215ENST00000576106 MROH2AA6NES4 1674 aa35.27■■■■□ 3.24
TRAP1-215ENST00000576106 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
TRAP1-215ENST00000576106 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.25■■■■□ 3.23
TRAP1-215ENST00000576106 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.24■■■■□ 3.23
TRAP1-215ENST00000576106 KIF15Q9NS87 1388 aa35.23■■■■□ 3.23
TRAP1-215ENST00000576106 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
TRAP1-215ENST00000576106 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.22■■■■□ 3.23
TRAP1-215ENST00000576106 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.22■■■■□ 3.23
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