RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575194.5

SPNS3-204, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SPNS3, Length 1,721 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-204ENST00000575194 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.39■■□□□ 1.98
SPNS3-204ENST00000575194 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.36■■□□□ 1.97
SPNS3-204ENST00000575194 PTPRKQ15262 1439 aa27.35■■□□□ 1.97
SPNS3-204ENST00000575194 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.35■■□□□ 1.97
SPNS3-204ENST00000575194 AKNAQ7Z591 1439 aa27.35■■□□□ 1.97
SPNS3-204ENST00000575194 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.34■■□□□ 1.97
SPNS3-204ENST00000575194 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.33■■□□□ 1.97
SPNS3-204ENST00000575194 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
SPNS3-204ENST00000575194 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.3■■□□□ 1.96
SPNS3-204ENST00000575194 NAIPQ13075 1403 aa27.29■■□□□ 1.96
SPNS3-204ENST00000575194 GLI2P10070 1586 aa27.29■■□□□ 1.96
SPNS3-204ENST00000575194 DIP2BQ9P265 1576 aa27.28■■□□□ 1.96
SPNS3-204ENST00000575194 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
SPNS3-204ENST00000575194 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
SPNS3-204ENST00000575194 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.25■■□□□ 1.95
SPNS3-204ENST00000575194 PLCH2O75038 1416 aa27.25■■□□□ 1.95
SPNS3-204ENST00000575194 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.24■■□□□ 1.95
SPNS3-204ENST00000575194 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.24■■□□□ 1.95
SPNS3-204ENST00000575194 PREX2Q70Z35 1606 aa27.23■■□□□ 1.95
SPNS3-204ENST00000575194 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.22■■□□□ 1.95
SPNS3-204ENST00000575194 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
SPNS3-204ENST00000575194 CD109Q6YHK3 1445 aa27.21■■□□□ 1.95
SPNS3-204ENST00000575194 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.2■■□□□ 1.94
SPNS3-204ENST00000575194 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.2■■□□□ 1.94
SPNS3-204ENST00000575194 DAPK1P53355 1430 aa27.18■■□□□ 1.94
SPNS3-204ENST00000575194 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
SPNS3-204ENST00000575194 ROCK1Q13464 1354 aa27.17■■□□□ 1.94
SPNS3-204ENST00000575194 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.16■■□□□ 1.94
SPNS3-204ENST00000575194 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.15■■□□□ 1.94
SPNS3-204ENST00000575194 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.14■■□□□ 1.94
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
SPNS3-204ENST00000575194 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.13■■□□□ 1.93
SPNS3-204ENST00000575194 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.11■■□□□ 1.93
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
SPNS3-204ENST00000575194 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.1■■□□□ 1.93
SPNS3-204ENST00000575194 ABCC5O15440 1437 aa27.1■■□□□ 1.93
SPNS3-204ENST00000575194 FANCAO15360 1455 aa27.09■■□□□ 1.93
SPNS3-204ENST00000575194 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.09■■□□□ 1.93
SPNS3-204ENST00000575194 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.07■■□□□ 1.92
SPNS3-204ENST00000575194 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
SPNS3-204ENST00000575194 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.06■■□□□ 1.92
SPNS3-204ENST00000575194 TSPOAP1O95153 1857 aa27.05■■□□□ 1.92
SPNS3-204ENST00000575194 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
SPNS3-204ENST00000575194 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.02■■□□□ 1.92
SPNS3-204ENST00000575194 KDM6BO15054 1643 aa27.01■■□□□ 1.91
SPNS3-204ENST00000575194 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.01■■□□□ 1.91
SPNS3-204ENST00000575194 NEO1Q92859 1461 aa27.01■■□□□ 1.91
SPNS3-204ENST00000575194 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27■■□□□ 1.91
SPNS3-204ENST00000575194 MBD5Q9P267 1494 aa27■■□□□ 1.91
SPNS3-204ENST00000575194 ADGRL2O95490 1459 aa26.99■■□□□ 1.91
SPNS3-204ENST00000575194 ABCC1P33527 1531 aa26.99■■□□□ 1.91
SPNS3-204ENST00000575194 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.99■■□□□ 1.91
SPNS3-204ENST00000575194 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.99■■□□□ 1.91
SPNS3-204ENST00000575194 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.99■■□□□ 1.91
SPNS3-204ENST00000575194 NEUROD1Q13562 356 aa26.98■■□□□ 1.91
SPNS3-204ENST00000575194 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.97■■□□□ 1.91
SPNS3-204ENST00000575194 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.97■■□□□ 1.91
SPNS3-204ENST00000575194 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.96■■□□□ 1.91
SPNS3-204ENST00000575194 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.95■■□□□ 1.9
SPNS3-204ENST00000575194 ADGRL1O94910 1474 aa26.95■■□□□ 1.9
SPNS3-204ENST00000575194 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.93■■□□□ 1.9
SPNS3-204ENST00000575194 TONSLQ96HA7 1378 aa26.93■■□□□ 1.9
SPNS3-204ENST00000575194 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.92■■□□□ 1.9
SPNS3-204ENST00000575194 TRIM52Q96A61 297 aa26.91■■□□□ 1.9
SPNS3-204ENST00000575194 NCOA1Q15788 1441 aa26.89■■□□□ 1.9
SPNS3-204ENST00000575194 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.89■■□□□ 1.9
SPNS3-204ENST00000575194 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.89■■□□□ 1.89
SPNS3-204ENST00000575194 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.89■■□□□ 1.89
SPNS3-204ENST00000575194 AFAP1Q8N556 730 aa26.86■■□□□ 1.89
SPNS3-204ENST00000575194 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
SPNS3-204ENST00000575194 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
SPNS3-204ENST00000575194 TSPY4P0CV99 314 aa26.83■■□□□ 1.89
SPNS3-204ENST00000575194 TSPY10P0CW01 314 aa26.83■■□□□ 1.89
SPNS3-204ENST00000575194 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.82■■□□□ 1.88
SPNS3-204ENST00000575194 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.82■■□□□ 1.88
SPNS3-204ENST00000575194 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.82■■□□□ 1.88
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.8■■□□□ 1.88
SPNS3-204ENST00000575194 RAPGEF3O95398 923 aa26.79■■□□□ 1.88
SPNS3-204ENST00000575194 RICTORQ6R327 1708 aa26.79■■□□□ 1.88
SPNS3-204ENST00000575194 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
SPNS3-204ENST00000575194 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.78■■□□□ 1.88
SPNS3-204ENST00000575194 KDM5CP41229 1560 aa26.77■■□□□ 1.88
SPNS3-204ENST00000575194 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
SPNS3-204ENST00000575194 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.75■■□□□ 1.87
SPNS3-204ENST00000575194 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.74■■□□□ 1.87
SPNS3-204ENST00000575194 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.73■■□□□ 1.87
SPNS3-204ENST00000575194 PZPP20742 1482 aa26.71■■□□□ 1.87
SPNS3-204ENST00000575194 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
SPNS3-204ENST00000575194 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.71■■□□□ 1.87
SPNS3-204ENST00000575194 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.7■■□□□ 1.87
SPNS3-204ENST00000575194 MIER1Q8N108 512 aa26.7■■□□□ 1.86
SPNS3-204ENST00000575194 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.68■■□□□ 1.86
SPNS3-204ENST00000575194 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
SPNS3-204ENST00000575194 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.68■■□□□ 1.86
SPNS3-204ENST00000575194 ATP7AQ04656 1500 aa26.68■■□□□ 1.86
SPNS3-204ENST00000575194 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.68■■□□□ 1.86
SPNS3-204ENST00000575194 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.67■■□□□ 1.86
SPNS3-204ENST00000575194 PLXNC1O60486 1568 aa26.67■■□□□ 1.86
SPNS3-204ENST00000575194 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
SPNS3-204ENST00000575194 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.66■■□□□ 1.86
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