RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42■■■■■ 4.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM69CQ0P6D2 419 aa42■■■■■ 4.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 NAIPQ13075 1403 aa41.99■■■■■ 4.31
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CTDNEP1-210ENST00000574322 DIP2BQ9P265 1576 aa41.98■■■■■ 4.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.96■■■■■ 4.31
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CTDNEP1-210ENST00000574322 GLI2P10070 1586 aa41.88■■■■■ 4.3
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CTDNEP1-210ENST00000574322 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.84■■■■■ 4.29
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CTDNEP1-210ENST00000574322 PREX2Q70Z35 1606 aa41.76■■■■■ 4.28
CTDNEP1-210ENST00000574322 CD109Q6YHK3 1445 aa41.76■■■■■ 4.28
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.72■■■■■ 4.27
CTDNEP1-210ENST00000574322 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.71■■■■■ 4.27
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.7■■■■■ 4.27
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.52■■■■■ 4.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
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CTDNEP1-210ENST00000574322 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.48■■■■■ 4.23
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa41.47■■■■■ 4.23
CTDNEP1-210ENST00000574322 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.46■■■■■ 4.23
CTDNEP1-210ENST00000574322 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.45■■■■■ 4.23
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.43■■■■■ 4.22
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP41.33■■■■■ 4.21
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ADGRL1O94910 1474 aa41.28■■■■■ 4.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.27■■■■■ 4.2
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.21■■■■■ 4.19
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CTDNEP1-210ENST00000574322 KIF15Q9NS87 1388 aa41.18■■■■■ 4.18
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ERBINQ96RT1 1412 aa40.89■■■■■ 4.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.86■■■■■ 4.13
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