RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574070.5

CLDN7-207, Transcript of claudin 7, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CLDN7, Length 485 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7-207ENST00000574070 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.16■■□□□ 1.94
CLDN7-207ENST00000574070 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.16■■□□□ 1.94
CLDN7-207ENST00000574070 RAPGEF3O95398 923 aa27.11■■□□□ 1.93
CLDN7-207ENST00000574070 FBXO41Q8TF61 875 aa27.11■■□□□ 1.93
CLDN7-207ENST00000574070 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.1■■□□□ 1.93
CLDN7-207ENST00000574070 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
CLDN7-207ENST00000574070 PREX2Q70Z35 1606 aa27.08■■□□□ 1.93
CLDN7-207ENST00000574070 MAP3K1Q13233 1512 aa27.07■■□□□ 1.92
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CLDN7-207ENST00000574070 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.07■■□□□ 1.92
CLDN7-207ENST00000574070 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.06■■□□□ 1.92
CLDN7-207ENST00000574070 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.06■■□□□ 1.92
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CLDN7-207ENST00000574070 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CLDN7-207ENST00000574070 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
CLDN7-207ENST00000574070 NCOA2Q15596 1464 aa27.01■■□□□ 1.91
CLDN7-207ENST00000574070 PTPRMP28827 1452 aa27■■□□□ 1.91
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CLDN7-207ENST00000574070 RICTORQ6R327 1708 aa26.96■■□□□ 1.91
CLDN7-207ENST00000574070 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.96■■□□□ 1.91
CLDN7-207ENST00000574070 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.95■■□□□ 1.91
CLDN7-207ENST00000574070 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.95■■□□□ 1.9
CLDN7-207ENST00000574070 ABCC1P33527 1531 aa26.92■■□□□ 1.9
CLDN7-207ENST00000574070 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.91■■□□□ 1.9
CLDN7-207ENST00000574070 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.9■■□□□ 1.9
CLDN7-207ENST00000574070 AFAP1Q8N556 730 aa26.9■■□□□ 1.9
CLDN7-207ENST00000574070 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.9■■□□□ 1.9
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CLDN7-207ENST00000574070 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.87■■□□□ 1.89
CLDN7-207ENST00000574070 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.87■■□□□ 1.89
CLDN7-207ENST00000574070 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.87■■□□□ 1.89
CLDN7-207ENST00000574070 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.86■■□□□ 1.89
CLDN7-207ENST00000574070 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
CLDN7-207ENST00000574070 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.85■■□□□ 1.89
CLDN7-207ENST00000574070 MADDQ8WXG6 1647 aa26.85■■□□□ 1.89
CLDN7-207ENST00000574070 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.85■■□□□ 1.89
CLDN7-207ENST00000574070 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.84■■□□□ 1.89
CLDN7-207ENST00000574070 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.82■■□□□ 1.88
CLDN7-207ENST00000574070 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.82■■□□□ 1.88
CLDN7-207ENST00000574070 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.82■■□□□ 1.88
CLDN7-207ENST00000574070 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.8■■□□□ 1.88
CLDN7-207ENST00000574070 KDM5CP41229 1560 aa26.8■■□□□ 1.88
CLDN7-207ENST00000574070 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.79■■□□□ 1.88
CLDN7-207ENST00000574070 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.78■■□□□ 1.88
CLDN7-207ENST00000574070 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
CLDN7-207ENST00000574070 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
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CLDN7-207ENST00000574070 ATP10AO60312 1499 aa26.72■■□□□ 1.87
CLDN7-207ENST00000574070 MBD5Q9P267 1494 aa26.7■■□□□ 1.87
CLDN7-207ENST00000574070 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.7■■□□□ 1.86
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CLDN7-207ENST00000574070 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.68■■□□□ 1.86
CLDN7-207ENST00000574070 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.66■■□□□ 1.86
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CLDN7-207ENST00000574070 ATP7AQ04656 1500 aa26.65■■□□□ 1.86
CLDN7-207ENST00000574070 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.65■■□□□ 1.86
CLDN7-207ENST00000574070 TSPY4P0CV99 314 aa26.64■■□□□ 1.86
CLDN7-207ENST00000574070 TSPY10P0CW01 314 aa26.64■■□□□ 1.86
CLDN7-207ENST00000574070 MLECQ14165 292 aa26.64■■□□□ 1.86
CLDN7-207ENST00000574070 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.64■■□□□ 1.85
CLDN7-207ENST00000574070 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.62■■□□□ 1.85
CLDN7-207ENST00000574070 HSPA2P54652 639 aa26.61■■□□□ 1.85
CLDN7-207ENST00000574070 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
CLDN7-207ENST00000574070 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.6■■□□□ 1.85
CLDN7-207ENST00000574070 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
CLDN7-207ENST00000574070 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.58■■□□□ 1.85
CLDN7-207ENST00000574070 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.57■■□□□ 1.84
CLDN7-207ENST00000574070 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.56■■□□□ 1.84
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CLDN7-207ENST00000574070 AGLP35573 1532 aa26.49■■□□□ 1.83
CLDN7-207ENST00000574070 ABCC5O15440 1437 aa26.48■■□□□ 1.83
CLDN7-207ENST00000574070 DAPK1P53355 1430 aa26.48■■□□□ 1.83
CLDN7-207ENST00000574070 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.46■■□□□ 1.83
CLDN7-207ENST00000574070 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
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CLDN7-207ENST00000574070 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.44■■□□□ 1.82
CLDN7-207ENST00000574070 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.42■■□□□ 1.82
CLDN7-207ENST00000574070 PLXNC1O60486 1568 aa26.42■■□□□ 1.82
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CLDN7-207ENST00000574070 GGT6Q6P531 493 aa26.41■■□□□ 1.82
CLDN7-207ENST00000574070 KIF3BO15066 747 aa26.39■■□□□ 1.82
CLDN7-207ENST00000574070 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.38■■□□□ 1.81
CLDN7-207ENST00000574070 ITGAEP38570 1179 aa26.37■■□□□ 1.81
CLDN7-207ENST00000574070 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.36■■□□□ 1.81
CLDN7-207ENST00000574070 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
CLDN7-207ENST00000574070 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.35■■□□□ 1.81
CLDN7-207ENST00000574070 KIF15Q9NS87 1388 aa26.35■■□□□ 1.81
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