RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572010.5

SLC12A4-208, Transcript of solute carrier family 12 member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC12A4, Length 1,016 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4-208ENST00000572010 PLPPR3Q6T4P5 718 aa34.87■■■■□ 3.17
SLC12A4-208ENST00000572010 YEATS2Q9ULM3 1422 aa34.87■■■■□ 3.17
SLC12A4-208ENST00000572010 MLECQ14165 292 aa34.85■■■■□ 3.17
SLC12A4-208ENST00000572010 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP34.82■■■■□ 3.16
SLC12A4-208ENST00000572010 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
SLC12A4-208ENST00000572010 CLIP1P30622 1438 aa34.78■■■■□ 3.16
SLC12A4-208ENST00000572010 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.78■■■■□ 3.16
SLC12A4-208ENST00000572010 LMTK3Q96Q04 1460 aa34.76■■■■□ 3.15
SLC12A4-208ENST00000572010 FBXO41Q8TF61 875 aa34.75■■■■□ 3.15
SLC12A4-208ENST00000572010 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.75■■■■□ 3.15
SLC12A4-208ENST00000572010 ATP10AO60312 1499 aa34.74■■■■□ 3.15
SLC12A4-208ENST00000572010 KIF14Q15058 1648 aa34.73■■■■□ 3.15
SLC12A4-208ENST00000572010 MYT1LQ9UL68 1186 aa34.73■■■■□ 3.15
SLC12A4-208ENST00000572010 ARHGAP5Q13017 1502 aa34.7■■■■□ 3.14
SLC12A4-208ENST00000572010 HSPA2P54652 639 aa34.69■■■■□ 3.14
SLC12A4-208ENST00000572010 AFAP1Q8N556 730 aa34.69■■■■□ 3.14
SLC12A4-208ENST00000572010 C9orf84Q5VXU9 1444 aa34.68■■■■□ 3.14
SLC12A4-208ENST00000572010 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.67■■■■□ 3.14
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa34.66■■■■□ 3.14
SLC12A4-208ENST00000572010 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.61■■■■□ 3.13
SLC12A4-208ENST00000572010 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.58■■■■□ 3.13
SLC12A4-208ENST00000572010 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa34.58■■■■□ 3.13
SLC12A4-208ENST00000572010 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.55■■■■□ 3.12
SLC12A4-208ENST00000572010 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa34.55■■■■□ 3.12
SLC12A4-208ENST00000572010 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP34.53■■■■□ 3.12
SLC12A4-208ENST00000572010 KDM5CP41229 1560 aa34.52■■■■□ 3.12
SLC12A4-208ENST00000572010 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa34.48■■■■□ 3.11
SLC12A4-208ENST00000572010 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
SLC12A4-208ENST00000572010 MLH3Q9UHC1 1453 aa34.46■■■■□ 3.11
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP34.43■■■■□ 3.1
SLC12A4-208ENST00000572010 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa34.43■■■■□ 3.1
SLC12A4-208ENST00000572010 PREX2Q70Z35 1606 aa34.42■■■■□ 3.1
SLC12A4-208ENST00000572010 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.42■■■■□ 3.1
SLC12A4-208ENST00000572010 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa34.41■■■■□ 3.1
SLC12A4-208ENST00000572010 ABCC1P33527 1531 aa34.39■■■■□ 3.1
SLC12A4-208ENST00000572010 REREQ9P2R6 1566 aa34.37■■■■□ 3.09
SLC12A4-208ENST00000572010 CERKQ8TCT0 537 aa34.35■■■■□ 3.09
SLC12A4-208ENST00000572010 DMRT2Q9Y5R5 561 aa34.35■■■■□ 3.09
SLC12A4-208ENST00000572010 PREX1Q8TCU6 1659 aa34.34■■■■□ 3.09
SLC12A4-208ENST00000572010 ABCA6Q8N139 1617 aa34.33■■■■□ 3.09
SLC12A4-208ENST00000572010 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa34.32■■■■□ 3.08
SLC12A4-208ENST00000572010 ITSN2Q9NZM3 1697 aa34.31■■■■□ 3.08
SLC12A4-208ENST00000572010 AGLP35573 1532 aa34.3■■■■□ 3.08
SLC12A4-208ENST00000572010 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa34.3■■■■□ 3.08
SLC12A4-208ENST00000572010 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP34.29■■■■□ 3.08
SLC12A4-208ENST00000572010 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
SLC12A4-208ENST00000572010 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
SLC12A4-208ENST00000572010 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
SLC12A4-208ENST00000572010 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
SLC12A4-208ENST00000572010 CCNB3Q8WWL7 1395 aa34.23■■■■□ 3.07
SLC12A4-208ENST00000572010 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa34.23■■■■□ 3.07
SLC12A4-208ENST00000572010 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.21■■■■□ 3.07
SLC12A4-208ENST00000572010 CNTLNQ9NXG0 1405 aa34.21■■■■□ 3.07
SLC12A4-208ENST00000572010 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa34.2■■■■□ 3.07
SLC12A4-208ENST00000572010 SYCP2Q9BX26 1530 aa34.18■■■■□ 3.06
SLC12A4-208ENST00000572010 C3P01024 1663 aa34.17■■■■□ 3.06
SLC12A4-208ENST00000572010 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa34.17■■■■□ 3.06
SLC12A4-208ENST00000572010 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa34.17■■■■□ 3.06
SLC12A4-208ENST00000572010 STRCQ7RTU9 1775 aa34.11■■■■□ 3.05
SLC12A4-208ENST00000572010 ZMYM3Q14202 1370 aa34.09■■■■□ 3.05
SLC12A4-208ENST00000572010 ATP7AQ04656 1500 aa34.06■■■■□ 3.04
SLC12A4-208ENST00000572010 PTPRTO14522 1441 aa34.04■■■■□ 3.04
SLC12A4-208ENST00000572010 GGT6Q6P531 493 aa34.04■■■■□ 3.04
SLC12A4-208ENST00000572010 A2MP01023 1474 aa34.03■■■■□ 3.04
SLC12A4-208ENST00000572010 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
SLC12A4-208ENST00000572010 NPATQ14207 1427 aa34.03■■■■□ 3.04
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
SLC12A4-208ENST00000572010 PPP6R1Q9UPN7 881 aa33.98■■■■□ 3.03
SLC12A4-208ENST00000572010 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP33.97■■■■□ 3.03
SLC12A4-208ENST00000572010 MROH2AA6NES4 1674 aa33.96■■■■□ 3.03
SLC12A4-208ENST00000572010 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa33.95■■■■□ 3.03
SLC12A4-208ENST00000572010 CEP162Q5TB80 1403 aa33.95■■■■□ 3.02
SLC12A4-208ENST00000572010 NCOA1Q15788 1441 aa33.94■■■■□ 3.02
SLC12A4-208ENST00000572010 PLXNC1O60486 1568 aa33.92■■■■□ 3.02
SLC12A4-208ENST00000572010 TIAM1Q13009 1591 aa33.92■■■■□ 3.02
SLC12A4-208ENST00000572010 MBD5Q9P267 1494 aa33.89■■■■□ 3.02
SLC12A4-208ENST00000572010 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP33.89■■■■□ 3.02
SLC12A4-208ENST00000572010 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa33.88■■■■□ 3.01
SLC12A4-208ENST00000572010 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa33.87■■■■□ 3.01
SLC12A4-208ENST00000572010 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa33.86■■■■□ 3.01
SLC12A4-208ENST00000572010 RSPH4AQ5TD94 716 aa33.86■■■■□ 3.01
SLC12A4-208ENST00000572010 ADGBQ8N7X0 1667 aa33.86■■■■□ 3.01
SLC12A4-208ENST00000572010 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP33.85■■■■□ 3.01
SLC12A4-208ENST00000572010 PTPRKQ15262 1439 aa33.84■■■■□ 3.01
SLC12A4-208ENST00000572010 PKD2Q13563 968 aa33.82■■■■□ 3
SLC12A4-208ENST00000572010 KIF3BO15066 747 aa33.79■■■■□ 3
SLC12A4-208ENST00000572010 NCOA2Q15596 1464 aa33.78■■■■□ 3
SLC12A4-208ENST00000572010 LTBP4Q8N2S1 1624 aa33.77■■■■□ 3
SLC12A4-208ENST00000572010 TSPY4P0CV99 314 aa33.76■■■□□ 2.99
SLC12A4-208ENST00000572010 TSPY10P0CW01 314 aa33.76■■■□□ 2.99
SLC12A4-208ENST00000572010 CCDC141Q6ZP82 1450 aa33.76■■■□□ 2.99
SLC12A4-208ENST00000572010 MYO3AQ8NEV4 1616 aa33.73■■■□□ 2.99
SLC12A4-208ENST00000572010 PLA2R1Q13018 1463 aa33.72■■■□□ 2.99
SLC12A4-208ENST00000572010 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP33.72■■■□□ 2.99
SLC12A4-208ENST00000572010 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa33.71■■■□□ 2.99
SLC12A4-208ENST00000572010 IQSEC2Q5JU85 1478 aa33.71■■■□□ 2.99
SLC12A4-208ENST00000572010 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa33.71■■■□□ 2.99
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP33.69■■■□□ 2.98
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP33.68■■■□□ 2.98
SLC12A4-208ENST00000572010 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.67■■■□□ 2.98
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